162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0171 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0171  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
183 aa  380  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0082  Ferritin Dps family protein  63.37 
 
 
187 aa  231  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3490  Ferritin Dps family protein  64.37 
 
 
176 aa  223  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13875  bacterioferritin bfrB  59.12 
 
 
181 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321537  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5666  Ferritin, Dps family protein  59.2 
 
 
196 aa  210  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324809  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1141  Ferritin, Dps family protein  62.8 
 
 
187 aa  208  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.406209  normal  0.0967189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5419  Ferritin, Dps family protein  63.06 
 
 
181 aa  207  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920475  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5039  Ferritin and Dps  62.42 
 
 
181 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5127  Ferritin, Dps family protein  62.42 
 
 
181 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2235  Ferritin Dps family protein  58.48 
 
 
184 aa  202  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000308738  normal  0.753428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3193  Ferritin Dps family protein  52.87 
 
 
192 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00970  ferritin-like protein  49.73 
 
 
182 aa  191  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3258  Ferritin, Dps family protein  57.32 
 
 
196 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000744438  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5518  Ferritin Dps family protein  55.21 
 
 
177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1471  Ferritin Dps family protein  52.35 
 
 
174 aa  177  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1774  Ferritin, Dps family protein  50.88 
 
 
174 aa  171  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0917  Ferritin Dps family protein  40.65 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.076232 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  39.53 
 
 
170 aa  93.2  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739627  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  31.74 
 
 
174 aa  89.4  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  32.89 
 
 
172 aa  86.7  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  33.59 
 
 
162 aa  86.3  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  36.76 
 
 
168 aa  85.5  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  34.59 
 
 
170 aa  84.7  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  31.17 
 
 
163 aa  84.3  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  32.89 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  33.57 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6539  Ferritin Dps family protein  36.36 
 
 
176 aa  82  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.973659  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2507  Ferritin Dps family protein  35.25 
 
 
174 aa  82  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000415587  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  30.52 
 
 
163 aa  82  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  32.26 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  33.57 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  31.58 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  32.64 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2055  Ferritin, Dps family protein  31.91 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0573  Ferritin Dps family protein  31.25 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  33.85 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  33.33 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1947  Ferritin, Dps family protein  37.8 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1981  Ferritin Dps family protein  37.8 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  37.4 
 
 
167 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  37.3 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  38.21 
 
 
167 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  32.93 
 
 
171 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  31.76 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  33.33 
 
 
163 aa  75.5  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01880  ferritin-like protein  29.73 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3978  Ferritin Dps family protein  36.22 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.445069  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0690  Ferritin, Dps family protein  35.25 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  35.34 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  35.34 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  35.34 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  35.34 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  35.34 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  35.34 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  28.28 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30880  ferritin-like protein  34.46 
 
 
173 aa  74.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1431  ferritin family protein  37.01 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.858938  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0301  Ferritin Dps family protein  30.61 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.384105 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  34.59 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  30.47 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  34.59 
 
 
168 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.9165399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  30 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  34.59 
 
 
168 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0797  ferritin-like protein  35.09 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.503852  normal  0.0139535 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  29.65 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  32.81 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  34.59 
 
 
168 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0800  Ferritin Dps family protein  31.97 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  29.08 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0177  Ferritin and Dps  32.09 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  27.91 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  28.99 
 
 
173 aa  67  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15640  ferritin-like protein  34.35 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00614251  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  29.32 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  25.64 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  31.75 
 
 
171 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1417  Ferritin, Dps family protein  28.19 
 
 
477 aa  65.9  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.672338  normal  0.285216 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  30 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  29.17 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  29.17 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  29.17 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  29.17 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  29.82 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  28.66 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1791  ferritin  34.03 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000512633  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2778  Ferritin and Dps  29.27 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  30.08 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0380  hypothetical protein  33.6 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.909079 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  31.25 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  29.17 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1860  Ferritin Dps family protein  27.27 
 
 
164 aa  64.7  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00316362  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  29.17 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  29.17 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1186  ferritin  28.22 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00985562  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2090  ferritin  28.22 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.202824  hitchhiker  0.0000482664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2097  ferritin  28.22 
 
 
165 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.85359e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  29.05 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  31.4 
 
 
164 aa  63.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0044  Ferritin and Dps  30 
 
 
175 aa  63.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.311572 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  32.23 
 
 
175 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>