25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0149 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0149  RecB family nuclease, putative  100 
 
 		 576 aa  1152    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0119  RecB family nuclease, putative  50.7 
 
 		 479 aa  421  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0046  nuclease (RecB family)-like protein  46.91 
 
 		 544 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00680  predicted nuclease (RecB family)  44.95 
 
 		 545 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0518  RecB family-like nuclease  24.58 
 
 		 390 aa  79.7  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.13317  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3349  hypothetical protein  23.9 
 
 		 512 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.134566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4865  hypothetical protein  24.43 
 
 		 494 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120137  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2051  hypothetical protein  28.71 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3226  nuclease (RecB family)-like protein  23.86 
 
 		 493 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2870  hypothetical protein  23.86 
 
 		 493 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  24.94 
 
 		 1151 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03041  RecB family nuclease  24.18 
 
 		 490 aa  53.9  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0542901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0719  RecB family-like nuclease  21.82 
 
 		 495 aa  53.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253334  hitchhiker  0.0000000430551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  25.23 
 
 		 1163 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  25.63 
 
 		 1280 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2410  RecB family nuclease, putative  25 
 
 		 486 aa  53.5  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0186  hypothetical protein  31.87 
 
 		 512 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.12716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  25.78 
 
 		 1143 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  25.78 
 
 		 1143 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  25.78 
 
 		 1143 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0336  hypothetical protein  24.41 
 
 		 487 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0524  RecB family-like nuclease  21.09 
 
 		 396 aa  49.3  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  24.3 
 
 		 1082 aa  47.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1116 aa  45.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  27.61 
 
 		 1228 aa  44.3  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>