60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0099 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0099  protein of unknown function DUF1295  100 
 
 		 267 aa  536  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00353634  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3586  protein of unknown function DUF1295  63.46 
 
 		 264 aa  328  7e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.347664  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1254  protein of unknown function DUF1295  52.42 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4539  hypothetical protein  50.95 
 
 		 260 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2922  hypothetical protein  52.12 
 
 		 264 aa  234  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1333  hypothetical protein  48.21 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4267  protein of unknown function DUF1295  47.56 
 
 		 275 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.646792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5181  protein of unknown function DUF1295  46.79 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2902  hypothetical protein  49.13 
 
 		 264 aa  192  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104878 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0352  hypothetical protein  41.3 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10452  transmembrane protein  54.75 
 
 		 178 aa  178  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0131  hypothetical protein  41.25 
 
 		 258 aa  178  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0560  hypothetical protein  44.77 
 
 		 265 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0320  hypothetical protein  40.71 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64062  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2323  hypothetical protein  41.47 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1241  protein of unknown function DUF1295  43.83 
 
 		 263 aa  158  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00447547  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1034  hypothetical protein  37.94 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0805  hypothetical protein  38.82 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0080875  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2438  protein of unknown function DUF1295  38.78 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1271  hypothetical protein  39.77 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  hitchhiker  0.00680562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3566  hypothetical protein  45.7 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0198  hypothetical protein  36.22 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1839  protein of unknown function DUF1295  38.13 
 
 		 253 aa  135  5e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114993 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7081  protein of unknown function DUF1295  37.4 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0694  hypothetical protein  40.17 
 
 		 297 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.542124  normal  0.086316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6937  hypothetical protein  37.84 
 
 		 271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0993  protein of unknown function DUF1295  34.85 
 
 		 275 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1337  steroid 5-alpha reductase family protein  35.54 
 
 		 263 aa  128  8.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0107524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4841  hypothetical protein  33.7 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0246  hypothetical protein  37.89 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0631937  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4336  hypothetical protein  36.64 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4486  hypothetical protein  35.5 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192564  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5825  hypothetical protein  34.38 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.613373 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01775  hypothetical protein  33.2 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.207255  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2027  protein of unknown function DUF1295  32.35 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34095  predicted protein  31.6 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00801461  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2806  hypothetical protein  33.76 
 
 		 271 aa  98.6  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1952  protein of unknown function DUF1295  35.11 
 
 		 261 aa  98.6  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0634907 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0946  hypothetical protein  30.08 
 
 		 288 aa  96.3  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1055  protein of unknown function DUF1295  27.82 
 
 		 289 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5276  hypothetical protein  34.24 
 
 		 273 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5187  hypothetical protein  34.24 
 
 		 273 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5568  hypothetical protein  33.17 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4370  protein of unknown function DUF1295  31.07 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6586  hypothetical protein  32.13 
 
 		 277 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534338  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0261  hypothetical protein  28.76 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0256  hypothetical protein  28.72 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02404  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G05810)  26.8 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.809933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10451  transmembrane protein  55.77 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3535  protein of unknown function DUF1295  29.48 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3389  hypothetical protein  32.31 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.718483 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33955  predicted protein  31.03 
 
 		 488 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16639  predicted protein  26.98 
 
 		 208 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3611  protein of unknown function DUF1295  26.19 
 
 		 269 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2346  hypothetical protein  29.41 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2218  protein of unknown function DUF1295  31.58 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.817403  normal  0.0389914 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3119  hypothetical protein  29.63 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258518  normal  0.88738 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04556  DUF1295 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02670)  30.11 
 
 		 359 aa  45.8  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.114313  normal  0.885943 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2271  hypothetical protein  31.96 
 
 		 476 aa  45.4  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1455  steroid 5-alpha reductase-like  18.9 
 
 		 205 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>