More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0093 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 210 aa  417  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  68.93 
 
 		 208 aa  302  3.0000000000000004e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  58.57 
 
 		 210 aa  264  8e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  60.59 
 
 		 205 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  60.1 
 
 		 209 aa  256  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  60.78 
 
 		 209 aa  256  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  62.14 
 
 		 207 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  59.33 
 
 		 210 aa  251  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  59.33 
 
 		 210 aa  251  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  59.33 
 
 		 210 aa  251  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  59.42 
 
 		 208 aa  247  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  57.97 
 
 		 211 aa  246  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  56.73 
 
 		 209 aa  241  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  52.2 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.88 
 
 		 208 aa  238  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  53.11 
 
 		 213 aa  238  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  57.92 
 
 		 202 aa  235  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  57.43 
 
 		 204 aa  232  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  54.42 
 
 		 218 aa  231  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  54.73 
 
 		 204 aa  231  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  59.28 
 
 		 202 aa  230  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  54.46 
 
 		 206 aa  229  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  56.85 
 
 		 206 aa  227  8e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  54.19 
 
 		 205 aa  218  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  54.82 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  54.29 
 
 		 216 aa  214  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  55.28 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  51.42 
 
 		 215 aa  211  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  50.26 
 
 		 574 aa  198  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  49.05 
 
 		 211 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  40.98 
 
 		 235 aa  160  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  43.85 
 
 		 195 aa  148  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  38.57 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  39.11 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  43.01 
 
 		 209 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  36.45 
 
 		 339 aa  134  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 275 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  39.04 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  37.82 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  36.65 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  38.42 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  36.32 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  35.79 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  36.84 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  34.36 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  35.18 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  35.75 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  36.98 
 
 		 205 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  33.33 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  36.92 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  34.38 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  32.29 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  36.7 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  35.64 
 
 		 213 aa  101  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  33.68 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  37.23 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  37.1 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  36.22 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.16 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  36.98 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3134  beta-lactamase domain-containing protein  36.13 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.0207681 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  34.55 
 
 		 209 aa  99  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3342  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 		 217 aa  98.2  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  hitchhiker  0.000156681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  35.64 
 
 		 205 aa  97.8  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 		 210 aa  97.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  36.13 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  35.08 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  32.98 
 
 		 251 aa  95.5  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  33.99 
 
 		 218 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  31.94 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  33 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  35.9 
 
 		 225 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  34.57 
 
 		 198 aa  93.2  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3706  beta-lactamase domain-containing protein  30.85 
 
 		 201 aa  92.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000121895  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  35.9 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  35.91 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  35.9 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  31.75 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  31.75 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.8 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 		 212 aa  91.3  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1731  beta-lactamase domain protein  29.79 
 
 		 208 aa  91.3  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00010066  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 209 aa  91.3  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3114  beta-lactamase domain-containing protein  34.55 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  32.18 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  31.22 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  31.22 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  31.77 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  30.69 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2522  beta-lactamase domain-containing protein  32.82 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.344384  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.38 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5619  beta-lactamase domain protein  36.13 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0608479  normal  0.170178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  32.68 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  33.68 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  34.21 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>