More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0088 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1351  steroid monooxygenase  61.58 
 
 
541 aa  701    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.881234  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0088  steroid monooxygenase  100 
 
 
533 aa  1100    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2283  phenylacetone monooxygenase  69.17 
 
 
554 aa  780    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3904  FAD dependent oxidoreductase  66.42 
 
 
548 aa  764    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.955647  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1837  FAD dependent oxidoreductase  73.5 
 
 
547 aa  817    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131168  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3461  FAD dependent oxidoreductase  71.4 
 
 
548 aa  809    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00115116  normal  0.0283002 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0610  steroid monooxygenase  61.58 
 
 
606 aa  708    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0189312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0898  steroid monooxygenase  55.37 
 
 
539 aa  635    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0124072  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0393  steroid monooxygenase  62.71 
 
 
543 aa  701    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1038  cyclohexanone monooxygenase  44.99 
 
 
540 aa  484  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1840  FAD dependent oxidoreductase  45.39 
 
 
573 aa  472  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.445434  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0320  FAD dependent oxidoreductase  44.7 
 
 
543 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0643133  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0330  FAD dependent oxidoreductase  44.7 
 
 
540 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2915  cyclohexanone monooxygenase  43.98 
 
 
546 aa  451  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.245138  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1220  flavin-containing monooxygenase FMO  42.99 
 
 
552 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.366472  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4546  FAD dependent oxidoreductase  44.36 
 
 
524 aa  450  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3838  cyclohexanone monooxygenase  42.99 
 
 
554 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0813  cyclohexanone monooxygenase  43.58 
 
 
543 aa  447  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322706  normal  0.777116 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0311  FAD dependent oxidoreductase  44.32 
 
 
540 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1860  FAD dependent oxidoreductase  42.53 
 
 
554 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135048  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1490  putative monooxygenase  43.37 
 
 
542 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.211285  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2894  cyclohexanone monooxygenase  42.91 
 
 
536 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293401  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3429  FAD dependent oxidoreductase  44.42 
 
 
544 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3588  cyclohexanone monooxygenase  43.87 
 
 
540 aa  435  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558327  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1781  cyclohexanone monooxygenase  41.09 
 
 
544 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.177006 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7142  FAD dependent oxidoreductase  40.75 
 
 
555 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.47055  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5034  Cyclohexanone monooxygenase  41.5 
 
 
541 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.623836 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5461  flavin-containing monooxygenase FMO  43.4 
 
 
530 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1558  flavin-containing monooxygenase FMO  40.19 
 
 
567 aa  422  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228791  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0607  cyclohexanone monooxygenase  40.6 
 
 
550 aa  423  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195368 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0579  cyclohexanone monooxygenase  40.26 
 
 
559 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000280037 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5565  flavin-containing monooxygenase FMO  40.23 
 
 
539 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.192347  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  40.19 
 
 
884 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0500  cyclohexanone monooxygenase  39.58 
 
 
548 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0522  cyclohexanone monooxygenase  39.39 
 
 
548 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.430737  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1530  flavin-containing monooxygenase FMO  39.59 
 
 
540 aa  399  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0511  cyclohexanone monooxygenase  39.39 
 
 
548 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.016866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2013  cyclohexanone monooxygenase  40.74 
 
 
542 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157904  normal  0.467237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4332  cyclohexanone monooxygenase  40.93 
 
 
541 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483661  normal  0.91016 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5297  FAD dependent oxidoreductase  39.01 
 
 
552 aa  390  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1771  hypothetical protein  38.86 
 
 
539 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1837  hypothetical protein  38.86 
 
 
539 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2176  cyclohexanone monooxygenase  40.68 
 
 
559 aa  388  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.665097  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0337  cyclohexanone monooxygenase  37.71 
 
 
547 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922158  normal  0.0121848 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1790  hypothetical protein  38.86 
 
 
539 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.784099  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00027  steroid monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00440)  37.07 
 
 
544 aa  385  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0766369  normal  0.112462 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1480  cyclohexanone monooxygenase  39.15 
 
 
549 aa  383  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.693995  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0276  putative cyclohexanone monooxygenase  35.71 
 
 
551 aa  382  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03488  cyclohexanone monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09400)  37.5 
 
 
554 aa  373  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04151  steroid monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00440)  36.74 
 
 
542 aa  372  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57936  Cyclopentanone 1,2-monooxygenase (CPMO)  36.11 
 
 
540 aa  359  6e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07793  conserved hypothetical protein  36.96 
 
 
717 aa  352  8.999999999999999e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.185522 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0510  cyclohexanone monooxygenase  38 
 
 
545 aa  343  4e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2102  cyclohexanone monooxygenase  34.94 
 
 
517 aa  303  7.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200217  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05421  steroid monooxygenase (CpmA), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07490)  31.64 
 
 
542 aa  290  7e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.465779  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3505  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.38 
 
 
818 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5336  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.58 
 
 
816 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3703  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 
662 aa  213  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.61 
 
 
816 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0721  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.98 
 
 
495 aa  207  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0504093 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.41 
 
 
816 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0184  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.41 
 
 
495 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11422  monoxygenase  29.11 
 
 
491 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.178527  normal  0.251324 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  31.2 
 
 
505 aa  201  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3696  hypothetical protein  29.89 
 
 
608 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.761481  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3530  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.6 
 
 
500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  29.42 
 
 
816 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16420  predicted flavoprotein involved in K+ transport  30.1 
 
 
525 aa  195  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4961  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 
613 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4607  cyclohexanone monooxygenase  28.12 
 
 
529 aa  194  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3325  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.98 
 
 
529 aa  194  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3109  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.04 
 
 
494 aa  193  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  29.98 
 
 
491 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3203  putative monooxygenase  28.35 
 
 
505 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0255813  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3194  putative monooxygenase  28.35 
 
 
505 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3256  putative monooxygenase  28.35 
 
 
505 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2452  cyclohexanone monooxygenase  30.34 
 
 
650 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0366  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 
484 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7122  flavin-containing monooxygenase FMO  27.33 
 
 
490 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4690  Cyclohexanone monooxygenase  30.08 
 
 
490 aa  188  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.557659  normal  0.132484 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3747  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 
484 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1882  FAD dependent oxidoreductase  30.04 
 
 
487 aa  187  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4867  Cyclohexanone monooxygenase  32.09 
 
 
653 aa  186  8e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2855  hypothetical protein  30.43 
 
 
492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.189256  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2870  hypothetical protein  30.43 
 
 
492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.38934  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4786  cyclohexanone monooxygenase  29.05 
 
 
611 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4492  cyclohexanone monooxygenase  29.05 
 
 
611 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315924  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2826  hypothetical protein  30.43 
 
 
492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0123091  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4405  cyclohexanone monooxygenase  29.05 
 
 
611 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339327  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1842  hypothetical protein  29.57 
 
 
645 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1697  monooxygenase FAD-binding protein  31.08 
 
 
605 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.293831 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0043  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.02 
 
 
487 aa  184  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1165  cyclohexanone monooxygenase  30.04 
 
 
604 aa  184  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785376  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4546  Cyclohexanone monooxygenase  29.48 
 
 
503 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3377  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 
494 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.968772  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3708  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
494 aa  184  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0275457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6818  putative flavin-binding monooxygenase  29.8 
 
 
479 aa  183  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1636  Phenylacetone monooxygenase  28.69 
 
 
603 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.672961  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2770  hypothetical protein  29.16 
 
 
641 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.911109  normal  0.95794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3598  flavin-containing monooxygenase FMO  29.54 
 
 
524 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>