178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0080 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0080  Glutaminase  100 
 
 		 422 aa  841    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.742612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3622  glutaminase  57.38 
 
 		 418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22150  L-glutaminase  48.78 
 
 		 456 aa  401  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  48.94 
 
 		 601 aa  376  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  44.72 
 
 		 483 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  48.81 
 
 		 425 aa  342  7e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  42.86 
 
 		 608 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  45.05 
 
 		 624 aa  315  7e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  43.78 
 
 		 412 aa  313  2.9999999999999996e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  47.23 
 
 		 331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  46.1 
 
 		 334 aa  288  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  45.51 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  36.83 
 
 		 624 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  47.56 
 
 		 613 aa  279  5e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  39.4 
 
 		 620 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  43 
 
 		 343 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  42.67 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00310  glutaminase  42.78 
 
 		 645 aa  268  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  44.19 
 
 		 343 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1163  glutaminase  51 
 
 		 331 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06680  glutaminase  47.59 
 
 		 347 aa  253  5.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  46.15 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  43.99 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  40.2 
 
 		 305 aa  242  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  40.2 
 
 		 305 aa  242  1e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3760  glutaminase  42.54 
 
 		 332 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  43.31 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2917  glutaminase  43.15 
 
 		 434 aa  223  7e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  40.41 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0305  Glutaminase  42.05 
 
 		 309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  40.07 
 
 		 311 aa  219  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2143  glutaminase  37.38 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2130  glutaminase  37.38 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2254  glutaminase  37.38 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0426  glutaminase  37.74 
 
 		 309 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000693628  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  44.72 
 
 		 304 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  44.72 
 
 		 304 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  44.72 
 
 		 304 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1503  Glutaminase  38.36 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  44.72 
 
 		 304 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  44.72 
 
 		 304 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  44.72 
 
 		 304 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1407  glutaminase  40.14 
 
 		 331 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0553  glutaminase  37.42 
 
 		 309 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00275922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0471  glutaminase  37.42 
 
 		 309 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.233073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0410  glutaminase  37.42 
 
 		 309 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0499  glutaminase  37.42 
 
 		 309 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0044437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0555  glutaminase  37.42 
 
 		 309 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000637393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4820  glutaminase  37.42 
 
 		 309 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2796  glutaminase  42.58 
 
 		 318 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.394459 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0480  glutaminase  37.42 
 
 		 309 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  37.88 
 
 		 307 aa  213  7e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0557  glutaminase  37.88 
 
 		 307 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  42.62 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000632239 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0416  glutaminase  37.1 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00235106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3164  glutaminase  36.81 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.566002 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0414  glutaminase  37.1 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000025535  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2907  glutaminase  36.81 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0924561  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1788  glutaminase  41.78 
 
 		 346 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  42.28 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  43.06 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000018103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  43.06 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2932  glutaminase  36.48 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2857  glutaminase  36.48 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.872371  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3155  glutaminase  36.48 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2097  glutaminase  36.25 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  40.92 
 
 		 315 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  42.57 
 
 		 308 aa  210  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0502  glutaminase  37.1 
 
 		 309 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3142  glutaminase  36.48 
 
 		 326 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  42.46 
 
 		 304 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3171  glutaminase  36.48 
 
 		 326 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  42.7 
 
 		 304 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  42.46 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1127  glutaminase  42.19 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5773  glutaminase  41.06 
 
 		 304 aa  207  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1143  glutaminase  43.16 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.118169 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0536  glutaminase  39.14 
 
 		 306 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  40.8 
 
 		 311 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5532  glutaminase  41.46 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25618 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  40.59 
 
 		 306 aa  204  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  41.58 
 
 		 309 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  40.58 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  40 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1383  glutaminase  40.47 
 
 		 311 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4504  glutaminase  40.86 
 
 		 309 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34383  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  40.92 
 
 		 309 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002449  glutaminase  40 
 
 		 306 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25660  L-glutaminase  39.25 
 
 		 333 aa  199  9e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  40.2 
 
 		 309 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2048  glutaminase  40.77 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0340  glutaminase  43.7 
 
 		 317 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2867  glutaminase  38.78 
 
 		 307 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.705763 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3965  Glutaminase  42.16 
 
 		 306 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0038  glutaminase  37.15 
 
 		 313 aa  196  5.000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.744531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7656  Glutaminase  42.67 
 
 		 316 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03588  glutaminase  38.67 
 
 		 306 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  41.11 
 
 		 309 aa  193  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3725  glutaminase  41.02 
 
 		 309 aa  193  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.259027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4564  glutaminase  41.7 
 
 		 306 aa  193  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>