155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0078 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0078  beta-Ig-H3/fasciclin  100 
 
 		 214 aa  419  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12890  major secreted immunogenic protein mpt70  72.5 
 
 		 193 aa  234  8e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12888  cell surface lipoprotein mpt83 (lipoprotein P23)  63.27 
 
 		 220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2041  beta-Ig-H3/fasciclin  60.45 
 
 		 240 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.267388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2087  beta-Ig-H3/fasciclin  60.45 
 
 		 240 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal  0.529139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2024  beta-Ig-H3/fasciclin  60.45 
 
 		 240 aa  225  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4084  beta-Ig-H3/fasciclin  60 
 
 		 227 aa  222  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2040  beta-Ig-H3/fasciclin  70 
 
 		 197 aa  221  8e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2086  beta-Ig-H3/fasciclin  70 
 
 		 197 aa  221  8e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  0.504905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2023  beta-Ig-H3/fasciclin  70 
 
 		 197 aa  221  8e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.113432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2259  beta-Ig-H3/fasciclin  68.75 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.646176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2547  beta-Ig-H3/fasciclin  63.74 
 
 		 224 aa  217  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0457535  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3760  beta-Ig-H3/fasciclin  66.05 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.812819  normal  0.0116816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0328  beta-Ig-H3/fasciclin  63.25 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2284  beta-Ig-H3/fasciclin  63.58 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000481809 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0159  beta-Ig-H3/fasciclin  62.96 
 
 		 226 aa  208  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4085  beta-Ig-H3/fasciclin  67.32 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771867  normal  0.954365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2258  beta-Ig-H3/fasciclin  67.48 
 
 		 194 aa  202  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17100  secreted/surface protein with fasciclin-like repeats  60.13 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4534  beta-Ig-H3/fasciclin  46.88 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4266  beta-Ig-H3/fasciclin  54.32 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.629053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5633  beta-Ig-H3/fasciclin  51.08 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.134039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0737  beta-Ig-H3/fasciclin  53.61 
 
 		 212 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2119  beta-Ig-H3/fasciclin  49.37 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4586  beta-Ig-H3/fasciclin  45.62 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5363  beta-Ig-H3/fasciclin  51.55 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4788  beta-Ig-H3/fasciclin  46.67 
 
 		 222 aa  134  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0780342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5904  beta-Ig-H3/fasciclin  43.08 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.640348 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4077  beta-Ig-H3/fasciclin  47.76 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4153  beta-Ig-H3/fasciclin  47.76 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4307  beta-Ig-H3/fasciclin  47.76 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.615408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6732  beta-Ig-H3/fasciclin  42.94 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4787  beta-Ig-H3/fasciclin  41.52 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0736899  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2081  beta-Ig-H3/fasciclin  39.49 
 
 		 199 aa  98.6  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2251  beta-Ig-H3/fasciclin  43.38 
 
 		 160 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5571  beta-Ig-H3/fasciclin  43.48 
 
 		 134 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3985  twin-arginine translocation pathway signal  44.78 
 
 		 169 aa  91.7  7e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0926621  normal  0.568461 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2172  beta-Ig-H3/fasciclin  41.91 
 
 		 164 aa  90.9  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.711656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2207  beta-Ig-H3/fasciclin  41.91 
 
 		 160 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1387  beta-Ig-H3/fasciclin  38.27 
 
 		 167 aa  86.3  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0247716 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1271  hypothetical protein  42.96 
 
 		 161 aa  86.3  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.235173  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1606  Beta-Ig-H3/fasciclin  40.3 
 
 		 186 aa  85.1  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.922484 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1014  beta-Ig-H3/fasciclin  45.45 
 
 		 187 aa  84.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001125  fasciclin domain-containing protein  38.19 
 
 		 166 aa  84.7  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0298812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2016  Beta-Ig-H3/fasciclin  41.46 
 
 		 139 aa  84.7  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000921903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06660  hypothetical protein  38.89 
 
 		 187 aa  84.7  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  42.45 
 
 		 558 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1655  beta-Ig-H3/fasciclin  39.1 
 
 		 596 aa  84.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0779815 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1043  beta-Ig-H3/fasciclin  44.55 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.363938  hitchhiker  0.000000478309 
 
 
-
 
NC_002936  DET1303  fasciclin domain-containing protein  33.57 
 
 		 134 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196893  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0621  fasciclin domain protein  40.58 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2167  Beta-Ig-H3/fasciclin  47.22 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.277927 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2325  beta-Ig-H3/fasciclin  39.42 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1375  putative adhesion lipoprotein  39.86 
 
 		 611 aa  82.4  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3984  beta-Ig-H3/fasciclin  46.3 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal  0.572954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3373  beta-Ig-H3/fasciclin  46.67 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0555818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1485  beta-Ig-H3/fasciclin  42.31 
 
 		 163 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2373  beta-Ig-H3/fasciclin  42.31 
 
 		 163 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4495  beta-Ig-H3/fasciclin  45.08 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.454582  normal  0.0107081 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4362  beta-Ig-H3/fasciclin  45.08 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0704  hypothetical protein  42.99 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.563111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1085  fasciclin domain protein  34.31 
 
 		 134 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2096  beta-Ig-H3/fasciclin  31.46 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03050  beta-Ig-H3/fasciclin repeat containing protein  36.99 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2034  beta-Ig-H3/fasciclin  45.9 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1108  beta-Ig-H3/fasciclin  44.95 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1409  beta-Ig-H3/fasciclin  46.49 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1725  beta-Ig-H3/fasciclin  33.33 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0336  Fas1 domain-containing protein  45.22 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0076  beta-Ig-H3/fasciclin  46.49 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.268608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0244  beta-Ig-H3/fasciclin  44.35 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.263365  normal  0.0636307 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3576  beta-Ig-H3/fasciclin  44.14 
 
 		 161 aa  74.7  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1113  beta-Ig-H3/fasciclin  32.86 
 
 		 134 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1101  beta-Ig-H3/fasciclin  35.77 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4447  beta-Ig-H3/fasciclin  41.44 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0485  beta-Ig-H3/fasciclin  46.96 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3372  beta-Ig-H3/fasciclin  39.6 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6577  beta-Ig-H3/fasciclin repeat-containing protein  41.46 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2326  beta-Ig-H3/fasciclin  36.5 
 
 		 160 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1399  beta-Ig-H3/fasciclin  35.4 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.409432 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6236  Beta-Ig-H3/fasciclin  40.56 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1409  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.3 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.92932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3256  beta-Ig-H3/fasciclin  44.26 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0331  beta-Ig-H3/fasciclin  43.48 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1335  beta-Ig-H3/fasciclin  35.04 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.286381  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4241  beta-Ig-H3/fasciclin  27.46 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0622  fasciclin domain protein  40.71 
 
 		 163 aa  69.3  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.951207  normal  0.83741 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1719  beta-Ig-H3/fasciclin  35.66 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2816  beta-Ig-H3/fasciclin  43.36 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal  0.235425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1908  Beta-Ig-H3/fasciclin  36.07 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0298726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2980  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.31 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.231392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1823  beta-Ig-H3/fasciclin  40.3 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0234116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1696  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2869  beta-Ig-H3/fasciclin  41.28 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1035  beta-Ig-H3/fasciclin  37.96 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.882693  hitchhiker  0.000102964 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1006  beta-Ig-H3/fasciclin  37.96 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2872  beta-Ig-H3/fasciclin  36.07 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0637604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3919  beta-Ig-H3/fasciclin  40.98 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.509564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3627  beta-Ig-H3/fasciclin  40.98 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3921  beta-Ig-H3/fasciclin  41.13 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00329996  normal  0.130645 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>