173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0076 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_12120  predicted acetamidase/formamidase  76.79 
 
 
418 aa  666    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181447  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1721  Formamidase  84.41 
 
 
418 aa  706    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787514  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19680  predicted acetamidase/formamidase  73.3 
 
 
414 aa  640    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0111175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2262  formamidase  85.37 
 
 
417 aa  727    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2309  formamidase  85.37 
 
 
417 aa  727    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215194  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2301  formamidase  85.61 
 
 
417 aa  728    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.506693 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0076  Formamidase  100 
 
 
418 aa  851    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  83.17 
 
 
417 aa  692    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2158  Formamidase  81.06 
 
 
417 aa  687    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.062604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0422  Formamidase  66.83 
 
 
415 aa  579  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2658  formamidase  61.11 
 
 
416 aa  506  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2309  Formamidase  58.5 
 
 
397 aa  497  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  58.27 
 
 
408 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  57 
 
 
406 aa  475  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  55.98 
 
 
410 aa  468  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  55.05 
 
 
410 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  54.44 
 
 
410 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  55.31 
 
 
410 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3737  formamidase  55.53 
 
 
412 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4631  formamidase  55.53 
 
 
412 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250924  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5673  formamidase  55.53 
 
 
412 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0225  formamidase  55.5 
 
 
409 aa  461  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  54.57 
 
 
409 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  56.3 
 
 
411 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  55.8 
 
 
409 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0569  formamidase  54.09 
 
 
410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0179  formamidase  54.09 
 
 
410 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2157  Formamidase  56.4 
 
 
420 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174868  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  54.68 
 
 
409 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  54.68 
 
 
409 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2970  formamidase  55.16 
 
 
410 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  55.88 
 
 
408 aa  444  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3592  formamidase  55.56 
 
 
409 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3140  Formamidase  55.75 
 
 
410 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  54.93 
 
 
409 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  54.93 
 
 
409 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_54476  formidase  51.9 
 
 
451 aa  434  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.185862  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  55.06 
 
 
409 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  53.24 
 
 
409 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  53.83 
 
 
409 aa  427  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2285  Acetamidase/Formamidase  50.61 
 
 
423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.117842 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  51.39 
 
 
411 aa  400  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28914  formamidase  50.13 
 
 
426 aa  394  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0986635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21390  predicted acetamidase/formamidase  46.72 
 
 
401 aa  323  4e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.737575  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2612  formamidase  53.68 
 
 
206 aa  210  4e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0583639  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  36.96 
 
 
393 aa  196  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  36.04 
 
 
388 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0022  Formamidase  33.33 
 
 
459 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.846742  normal  0.0101399 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  32.28 
 
 
318 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  30.97 
 
 
322 aa  153  7e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  28.93 
 
 
328 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  30.75 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  30.75 
 
 
319 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  30.75 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  28.69 
 
 
312 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  28.15 
 
 
312 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  28.13 
 
 
315 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  27.97 
 
 
314 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  27.06 
 
 
313 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  27.32 
 
 
314 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3454  formamidase  29.17 
 
 
224 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172386  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  28.64 
 
 
314 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  26.43 
 
 
303 aa  82.8  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  27.99 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  32 
 
 
491 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  28.37 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  26.77 
 
 
324 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  29.68 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  31.91 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  33.79 
 
 
481 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  28.48 
 
 
311 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  31.56 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  32.53 
 
 
791 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  29.12 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  27.88 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  28.75 
 
 
337 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  27.69 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  29.86 
 
 
310 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  26.74 
 
 
418 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  26.78 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  28.25 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  25.34 
 
 
379 aa  72.8  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  28.88 
 
 
329 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  33.48 
 
 
479 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  33.48 
 
 
479 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  26.69 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  25.34 
 
 
438 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  26.86 
 
 
313 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  28.36 
 
 
777 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  32.74 
 
 
479 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  26.33 
 
 
438 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 
791 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  30.36 
 
 
483 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  28.87 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  25.56 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  28.12 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  23.7 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  26.46 
 
 
358 aa  69.7  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  29.37 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  27.39 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409829 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>