More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0068 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  100 
 
 		 867 aa  1698    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  46.53 
 
 		 864 aa  633  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  44.05 
 
 		 880 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  38.55 
 
 		 865 aa  426  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  34.55 
 
 		 884 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3613  transcriptional regulator, LuxR family  35.62 
 
 		 884 aa  365  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00449283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0244  response regulator receiver protein  32.57 
 
 		 868 aa  249  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140274 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11228  hypothetical protein  33.63 
 
 		 562 aa  221  6e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  36.34 
 
 		 879 aa  185  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4239  AAA ATPase  32.97 
 
 		 690 aa  137  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4009  ATPas  32.97 
 
 		 690 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4083  AAA ATPase  32.97 
 
 		 690 aa  137  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0947323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2183  tetratricopeptide TPR_4  31.76 
 
 		 660 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0244754  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 926 aa  130  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4512  ATPas  31.47 
 
 		 640 aa  125  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.360294  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3560  transcriptional regulator, LuxR family  30.22 
 
 		 893 aa  125  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 910 aa  115  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3551  cyclic nucleotide-binding protein  33.15 
 
 		 1001 aa  107  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1247  transcriptional regulator, LuxR family  36.73 
 
 		 871 aa  105  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1292  transcriptional regulator, LuxR family  29.45 
 
 		 845 aa  103  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000215082 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  32.96 
 
 		 903 aa  102  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 907 aa  102  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1224  LuxR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 894 aa  100  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  27.64 
 
 		 908 aa  94.7  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  26.28 
 
 		 912 aa  82  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3551  transcriptional regulator, LuxR family  27.94 
 
 		 893 aa  80.1  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0011  AAA ATPase  29.71 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.40888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1234  LuxR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 856 aa  65.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  57.69 
 
 		 895 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  53.45 
 
 		 956 aa  61.6  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  36.45 
 
 		 953 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.46 
 
 		 907 aa  60.1  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36930  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  60.78 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.42 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 814 aa  58.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  43.04 
 
 		 923 aa  58.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 889 aa  57.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.86 
 
 		 881 aa  56.2  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 919 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  24.78 
 
 		 919 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  24.78 
 
 		 919 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  50 
 
 		 923 aa  55.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  54.9 
 
 		 217 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  49.15 
 
 		 206 aa  55.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3799  LuxR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 952 aa  55.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00558742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5410  LuxR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 952 aa  55.1  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1940  LuxR response regulator receiver  47.37 
 
 		 222 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.95717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  51.02 
 
 		 212 aa  54.7  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  54.55 
 
 		 862 aa  54.7  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2130  DNA-binding response regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 222 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  41.28 
 
 		 937 aa  53.9  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7160  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.82 
 
 		 224 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  28.39 
 
 		 876 aa  53.9  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34130  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  29.53 
 
 		 853 aa  53.9  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  54.17 
 
 		 928 aa  53.9  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  51.61 
 
 		 1084 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  58.82 
 
 		 221 aa  53.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0244  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.41 
 
 		 216 aa  53.5  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  53.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.66 
 
 		 206 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3387  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.83 
 
 		 223 aa  53.5  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000386408  hitchhiker  0.000570848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  49.09 
 
 		 963 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  34.74 
 
 		 916 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1731  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.85 
 
 		 224 aa  53.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  51.56 
 
 		 959 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0367  transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 556 aa  53.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  31.55 
 
 		 925 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 755 aa  53.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6049  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.86 
 
 		 224 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0894  putative outer membrane component of efflux system  47.06 
 
 		 211 aa  53.1  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00401485  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4855  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.9 
 
 		 244 aa  53.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.093919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  21.73 
 
 		 1134 aa  52.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  38.54 
 
 		 215 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  45.68 
 
 		 981 aa  52.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 927 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  56.25 
 
 		 970 aa  52.8  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3390  two component LuxR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 226 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 1030 aa  52.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1125  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.77 
 
 		 229 aa  52.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 231 aa  52.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4059  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 212 aa  52.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  45.45 
 
 		 221 aa  52  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2140  response regulator receiver  42.11 
 
 		 218 aa  52  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.95288  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2430  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 223 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1565  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 200 aa  52  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.1 
 
 		 211 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.17 
 
 		 213 aa  52  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  54.9 
 
 		 230 aa  52  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3680  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 223 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.233635 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 203 aa  51.6  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4133  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 240 aa  51.6  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 982 aa  51.6  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  54.9 
 
 		 221 aa  51.6  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1758  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 181 aa  51.6  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.86 
 
 		 232 aa  51.2  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1495  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 207 aa  51.6  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194449  normal  0.395611 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2537  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.83 
 
 		 242 aa  51.2  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.64 
 
 		 836 aa  51.2  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.116502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 992 aa  51.6  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6511  two component LuxR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 215 aa  51.6  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>