95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0062 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1666  hypothetical protein  96.15 
 
 		 557 aa  984    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0266  hypothetical protein  91.69 
 
 		 602 aa  1007    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0062  hypothetical protein  100 
 
 		 572 aa  1136    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161525  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1476  HNH endonuclease  34.15 
 
 		 586 aa  276  8e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266278  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3886  hypothetical protein  35.71 
 
 		 554 aa  262  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00540166  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3616  hypothetical protein  39.88 
 
 		 204 aa  100  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  40.4 
 
 		 567 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  40.4 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  38.54 
 
 		 550 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  40.45 
 
 		 637 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  37.89 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2721  hypothetical protein  36.08 
 
 		 553 aa  58.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  37.89 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  37.89 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  32.26 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  33.68 
 
 		 539 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  30.21 
 
 		 566 aa  57.4  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  34.41 
 
 		 567 aa  57.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02410  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1291  hypothetical protein  30.11 
 
 		 582 aa  57  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322843  normal  0.107817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  32.26 
 
 		 443 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00460  HNH endonuclease  35.42 
 
 		 565 aa  56.2  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.711457 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4183  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 434 aa  56.6  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  34.41 
 
 		 426 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4927  hypothetical protein  29.44 
 
 		 546 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.929076 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3219  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 427 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  35.35 
 
 		 581 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  35.35 
 
 		 578 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  35.35 
 
 		 581 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  35.4 
 
 		 441 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  34.34 
 
 		 578 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  34.34 
 
 		 578 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  35.56 
 
 		 748 aa  53.9  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  37.37 
 
 		 535 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3935  hypothetical protein  26.84 
 
 		 514 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0910355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 516 aa  53.5  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  40.74 
 
 		 360 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  34.04 
 
 		 519 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  36 
 
 		 602 aa  52.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  34.34 
 
 		 578 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 593 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  33.33 
 
 		 593 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4350  hypothetical protein  34.04 
 
 		 579 aa  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000306151  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  35.37 
 
 		 603 aa  51.2  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  27.78 
 
 		 519 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2332  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 620 aa  51.2  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.934407  normal  0.611085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 580 aa  50.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  37.37 
 
 		 519 aa  50.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5006  hypothetical protein  25.79 
 
 		 508 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5188  hypothetical protein  28.65 
 
 		 586 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0262711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4917  hypothetical protein  25.79 
 
 		 508 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150474  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2144  hypothetical protein  28.89 
 
 		 593 aa  50.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0179  hypothetical protein  37.37 
 
 		 524 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  34.78 
 
 		 502 aa  50.4  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  39.13 
 
 		 521 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  39.29 
 
 		 605 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  37.8 
 
 		 566 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  41.07 
 
 		 551 aa  49.7  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  35.56 
 
 		 512 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2714  hypothetical protein  28.89 
 
 		 601 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.707807  normal  0.117401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  39.29 
 
 		 584 aa  48.5  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  39.29 
 
 		 499 aa  48.5  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  39.29 
 
 		 628 aa  48.5  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  36.71 
 
 		 485 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  31 
 
 		 512 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  39.29 
 
 		 558 aa  48.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3499  HNH endonuclease  34.38 
 
 		 117 aa  48.5  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5546  hypothetical protein  27.04 
 
 		 571 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  39.29 
 
 		 580 aa  47.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 620 aa  47.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  31.11 
 
 		 714 aa  47.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  39.18 
 
 		 709 aa  47.4  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1354  hypothetical protein  41.07 
 
 		 496 aa  47.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  30.53 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  38.33 
 
 		 530 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  33.77 
 
 		 561 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  35.44 
 
 		 620 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1272  HNH endonuclease  30.09 
 
 		 532 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  34.72 
 
 		 469 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  30.53 
 
 		 511 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0740  hypothetical protein  31.17 
 
 		 618 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  33.77 
 
 		 577 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  36.36 
 
 		 517 aa  46.2  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  28.57 
 
 		 550 aa  45.8  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4696  hypothetical protein  34.95 
 
 		 635 aa  45.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  40.38 
 
 		 535 aa  45.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  32.95 
 
 		 169 aa  44.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1741  hypothetical protein  24.47 
 
 		 475 aa  45.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  32.17 
 
 		 507 aa  44.7  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3176  hypothetical protein  32.29 
 
 		 601 aa  44.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436761  normal  0.0313411 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  29.2 
 
 		 556 aa  44.3  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5774  HNH endonuclease  34.34 
 
 		 516 aa  44.3  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.300125  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  33.33 
 
 		 508 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  33.33 
 
 		 508 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  29.79 
 
 		 464 aa  43.9  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>