More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0050 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0050  beta-lactamase  100 
 
 		 383 aa  770    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5383  beta-lactamase  58.91 
 
 		 390 aa  442  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.994545  hitchhiker  0.00195175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0164  beta-lactamase  62.77 
 
 		 373 aa  435  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105868  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08528  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  45.55 
 
 		 402 aa  343  2.9999999999999997e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.234552 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07085  beta-lactamase (AFU_orthologue; AFUA_5G09790)  48.45 
 
 		 737 aa  330  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5550  beta-lactamase  47.88 
 
 		 364 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.432624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2666  beta-lactamase  34.81 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00146634  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3079  beta-lactamase  40 
 
 		 373 aa  235  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.597951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50820  esterase  37.43 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4621  beta-lactamase  37.77 
 
 		 375 aa  232  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4333  esterase  37.17 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.277959  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1227  Beta-lactamase  36.17 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0571  beta-lactamase  35.57 
 
 		 406 aa  219  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1434  beta-lactamase  37.07 
 
 		 381 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.908777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3855  Beta-lactamase  35.32 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.026011  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12488  esterase/lipase lipP  36.46 
 
 		 394 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1163  beta-lactamase  35.32 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4288  beta-lactamase  34.81 
 
 		 381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3595  beta-lactamase  37.14 
 
 		 397 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3668  beta-lactamase  37.14 
 
 		 397 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1148  beta-lactamase  35.71 
 
 		 381 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.295491  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4119  carboxylesterase  34.72 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.780125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1998  beta-lactamase  52.91 
 
 		 409 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3600  beta-lactamase  36.87 
 
 		 397 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0635885  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19470  Carboxylesterase EstC  34.84 
 
 		 383 aa  209  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1127  beta-lactamase  34.81 
 
 		 381 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013499 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4193  beta-lactamase  33.08 
 
 		 377 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1384  beta-lactamase  32.91 
 
 		 408 aa  206  8e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2050  beta-lactamase  34.29 
 
 		 414 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4393  beta-lactamase  37.69 
 
 		 392 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.662219 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2880  beta-lactamase  35.06 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.912429 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0868  beta-lactamase  35.78 
 
 		 407 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2803  beta-lactamase  33.6 
 
 		 368 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00599204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1655  beta-lactamase  35.11 
 
 		 415 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11527  esterase lipL  35.53 
 
 		 428 aa  176  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.160563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0367  beta-lactamase  35.11 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.219007  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1577  beta-lactamase  34.66 
 
 		 415 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2295  Beta-lactamase  35.45 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2765  beta-lactamase  35.2 
 
 		 430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.79762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3647  beta-lactamase  33.33 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11952  lipase lipD  31.69 
 
 		 446 aa  156  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4403  carboxylesterase  32.47 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12783  normal  0.0117181 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6892  beta-lactamase  30.65 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4375  beta-lactamase  33.42 
 
 		 363 aa  153  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16190  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.67 
 
 		 367 aa  150  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3120  beta-lactamase  32.24 
 
 		 431 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3181  beta-lactamase  32.24 
 
 		 431 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0616495  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3131  beta-lactamase  32.24 
 
 		 431 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3355  beta-lactamase  32.41 
 
 		 395 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3097  beta-lactamase  33.52 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2148  beta-lactamase  32.92 
 
 		 378 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0217937  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2099  beta-lactamase  29.64 
 
 		 384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.303658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3310  beta-lactamase  31.04 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146111  normal  0.517695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1266  beta-lactamase  33.45 
 
 		 364 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1895  beta-lactamase  30.74 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000574027 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1067  beta-lactamase  30.13 
 
 		 355 aa  109  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.279878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5757  beta-lactamase  29.84 
 
 		 363 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13809  lipase lipE  31.18 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0420294  normal  0.302132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  29.75 
 
 		 566 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0097  beta-lactamase  27.72 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.734776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5564  beta-lactamase  29.71 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5183  beta-lactamase  29.71 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5272  beta-lactamase  29.71 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  34.57 
 
 		 582 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  25.33 
 
 		 423 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2265  beta-lactamase  27.82 
 
 		 417 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205356  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0294  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  27.98 
 
 		 834 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00108534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  27.42 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0106  beta-lactamase  25.08 
 
 		 378 aa  87.4  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1364  beta-lactamase  28.06 
 
 		 574 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.185265  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3223  putative penicillin-binding protein  32.79 
 
 		 691 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1955  beta-lactamase  33.51 
 
 		 694 aa  86.7  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.1377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0714  beta-lactamase  29.56 
 
 		 392 aa  86.3  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2036  putative penicillin-binding protein  32.79 
 
 		 691 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  26.72 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  26.33 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  27.4 
 
 		 966 aa  84  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1713  beta-lactamase  26.44 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  24.82 
 
 		 453 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2916  penicillin-binding protein  31.69 
 
 		 691 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2989  penicillin-binding protein  31.69 
 
 		 691 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3214  penicillin-binding protein  31.69 
 
 		 691 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38843  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  24.51 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4539  hypothetical protein  35.59 
 
 		 796 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00469106 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0098  beta-lactamase  33.74 
 
 		 691 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  25.14 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4406  hypothetical protein  35.59 
 
 		 796 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.343081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2172  beta-lactamase  26.71 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65714  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  26.01 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  30.89 
 
 		 793 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1830  beta-lactamase  26.71 
 
 		 452 aa  80.9  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.162579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  27.59 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  27.98 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5607  hypothetical protein  37.32 
 
 		 784 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  31.47 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6218  hypothetical protein  30.07 
 
 		 792 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  25.68 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  25.68 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0270  beta-lactamase  29.71 
 
 		 717 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1839  Beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins-like protein  29.84 
 
 		 681 aa  79.7  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000051234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>