More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0048 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11922  hypothetical protein  84.05 
 
 
376 aa  655    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3005  2-nitropropane dioxygenase, NPD  84.86 
 
 
376 aa  642    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2747  2-nitropropane dioxygenase, NPD  86.76 
 
 
376 aa  649    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0296981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0048  2-nitropropane dioxygenase NPD  100 
 
 
375 aa  767    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2717  2-nitropropane dioxygenase, NPD  86.76 
 
 
376 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.846884  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2761  2-nitropropane dioxygenase, NPD  86.76 
 
 
376 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.812595  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3286  2-nitropropane dioxygenase, NPD  84.64 
 
 
377 aa  631  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1477  hypothetical protein  53.48 
 
 
370 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3987  2-nitropropane dioxygenase NPD  50.4 
 
 
369 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0898704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3088  2-nitropropane dioxygenase NPD  50.4 
 
 
376 aa  357  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151695  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0700  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.84 
 
 
374 aa  318  7e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.225979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0706  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.11 
 
 
374 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0466586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0720  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.11 
 
 
374 aa  318  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0155051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2841  2-nitropropane dioxygenase NPD  48.45 
 
 
383 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000258118  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2724  2-nitropropane dioxygenase, NPD  47.77 
 
 
367 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3815  2-nitropropane dioxygenase NPD  47.11 
 
 
367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11566  hypothetical protein  47.49 
 
 
375 aa  299  4e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0037  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.5 
 
 
378 aa  297  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0883  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.09 
 
 
376 aa  296  5e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4714  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.81 
 
 
373 aa  292  6e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4626  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.81 
 
 
373 aa  292  6e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2988  2-nitropropane dioxygenase family oxidoreductase  46.46 
 
 
383 aa  292  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132342  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5008  2-nitropropane dioxygenase, NPD  45.55 
 
 
373 aa  291  9e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.498712  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1544  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.88 
 
 
373 aa  291  9e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2638  2-nitropropane dioxygenase, NPD  48.55 
 
 
373 aa  290  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.805043  normal  0.215652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3958  2-nitropropane dioxygenase NPD  44.68 
 
 
378 aa  287  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5214  2-nitropropane dioxygenase, NPD  46.75 
 
 
373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.149834 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2835  2-nitropropane dioxygenase NPD  46.28 
 
 
373 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1859  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.33 
 
 
377 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6298  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.22 
 
 
372 aa  276  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344947  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1149  2-nitropropane dioxygenase, NPD  44.42 
 
 
378 aa  268  8.999999999999999e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.811771  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4837  2-nitropropane dioxygenase NPD  39.41 
 
 
371 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000132292  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1469  hypothetical protein  39.63 
 
 
378 aa  237  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5309  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.48 
 
 
380 aa  187  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.1832 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1779  2-nitropropane dioxygenase NPD  35.28 
 
 
377 aa  177  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.883896  normal  0.0611887 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.03 
 
 
360 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0690438  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0758  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.31 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3924  nitropropane dioxygenase  29.38 
 
 
363 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1419  nitropropane dioxygenase  29.64 
 
 
363 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1526  2-nitropropane dioxygenase  27.65 
 
 
364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1290  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.97 
 
 
378 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.62886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0933  2-nitropropane dioxygenase NPD  32.31 
 
 
380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126178  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1283  2-nitropropane dioxygenase  27.91 
 
 
364 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1385  2-nitropropane dioxygenase  27.91 
 
 
364 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1852  2-nitropropane dioxygenase-like protein  29.89 
 
 
317 aa  126  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00272263  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1483  2-nitropropane dioxygenase  27.65 
 
 
364 aa  126  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1257  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  27.91 
 
 
364 aa  126  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1457  2-nitropropane dioxygenase  29.36 
 
 
365 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.907571 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1088  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.17 
 
 
363 aa  125  9e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1255  2-nitropropane dioxygenase (nitroalkane oxidase)  27.91 
 
 
364 aa  123  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1099  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.61 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000664093  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2074  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.18 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000655776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4574  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.62 
 
 
360 aa  116  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0964  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.87 
 
 
319 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0729206  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03855  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07940)  30.81 
 
 
346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0612  2-nitropropane dioxygenase NPD  25.66 
 
 
323 aa  114  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000694328  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4414  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.41 
 
 
321 aa  113  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0937  2-nitropropane dioxygenase NPD  28 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0919  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3819  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  29.44 
 
 
315 aa  110  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000661973  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1178  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  28.25 
 
 
316 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000736816  hitchhiker  0.00901561 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06031  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09850)  32.59 
 
 
355 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.796468 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2147  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.72 
 
 
354 aa  106  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1725  2-nitropropane dioxygenase, NPD  32.08 
 
 
313 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000021316  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1549  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.41 
 
 
366 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.486705  normal  0.142209 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1358  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  27.74 
 
 
316 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000252963  normal  0.0405419 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1591  dioxygenase  37.06 
 
 
318 aa  100  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.600793  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1435  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.54 
 
 
362 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212936  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0311  dioxygenase  38.06 
 
 
321 aa  100  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2965  2-nitropropane dioxygenase NPD  41.89 
 
 
338 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.752049  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1839  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.87 
 
 
319 aa  99.4  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2942  2-nitropropane dioxygenase NPD  31.06 
 
 
350 aa  99.4  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1587  2-nitropropane dioxygenase, NPD  30.23 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000431839  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0640  2-nitropropane dioxygenase, NPD  41.4 
 
 
316 aa  97.8  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000697959  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1989  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.49 
 
 
325 aa  96.7  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2091  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.07 
 
 
362 aa  96.3  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11150  2-nitropropane dioxygenase-like enzyme  26.45 
 
 
323 aa  96.3  8e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2392  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.48 
 
 
363 aa  95.9  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.895701 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.93 
 
 
314 aa  95.9  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0565011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2755  2-nitropropane dioxygenase, NPD  26.09 
 
 
359 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0669905  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0126  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  26.93 
 
 
314 aa  95.9  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0317277  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3542  2-nitropropane dioxygenase NPD  29.43 
 
 
361 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0130805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2940  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.81 
 
 
353 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.917216  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3082  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.76 
 
 
354 aa  94  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.926981  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0544  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase II  26.09 
 
 
326 aa  92  1e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4621  2-nitropropane dioxygenase NPD  33.58 
 
 
358 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2147  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.38 
 
 
334 aa  92.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0029  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.7 
 
 
346 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.58495  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6375  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.36 
 
 
353 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3371  2-nitropropane dioxygenase, NPD  28.62 
 
 
354 aa  92  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.940632  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0597  2-nitropropane dioxygenase NPD  30.29 
 
 
338 aa  90.9  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5538  2-nitropropane dioxygenase NPD  28.27 
 
 
364 aa  90.5  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal  0.0535988 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1035  2-nitropropane dioxygenase NPD  26.37 
 
 
317 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0997484  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02830  2-nitropropane dioxygenase, putative  28.8 
 
 
409 aa  90.1  6e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3196  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.67 
 
 
358 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2972  oxidoreductase, 2-nitropropane dioxygenase family  25.74 
 
 
359 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24605  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2452  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.57 
 
 
345 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5128  2-nitropropane dioxygenase, NPD  33.88 
 
 
376 aa  88.6  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.241888  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0084  2-nitropropane dioxygenase NPD  27.24 
 
 
343 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00133989  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1015  2-nitropropane dioxygenase, NPD  27.51 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>