More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0029 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  100 
 
 
505 aa  1019  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  58.06 
 
 
477 aa  453  1e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  53.69 
 
 
514 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  57.34 
 
 
491 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  57.34 
 
 
491 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  57.34 
 
 
491 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  53.4 
 
 
516 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  51.39 
 
 
517 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  53.52 
 
 
478 aa  356  5e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  63.35 
 
 
472 aa  347  4e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  71.77 
 
 
474 aa  330  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  49.85 
 
 
482 aa  315  9e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  50.58 
 
 
478 aa  315  1e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  49.86 
 
 
463 aa  313  6e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  60.91 
 
 
519 aa  310  3e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  47.27 
 
 
441 aa  308  2e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  48.5 
 
 
474 aa  301  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  45.27 
 
 
540 aa  293  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  58.14 
 
 
421 aa  292  8e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  55.09 
 
 
426 aa  289  7e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  46.72 
 
 
469 aa  278  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  51.51 
 
 
449 aa  277  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  43.62 
 
 
466 aa  270  4e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  60 
 
 
467 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  40.77 
 
 
479 aa  266  6e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  54.39 
 
 
241 aa  261  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  54.47 
 
 
463 aa  259  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  52.72 
 
 
241 aa  259  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  44.97 
 
 
462 aa  254  4e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  52.61 
 
 
500 aa  251  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  58.52 
 
 
364 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  54.37 
 
 
265 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  51.69 
 
 
507 aa  242  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  53.16 
 
 
239 aa  234  2e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  41.58 
 
 
564 aa  231  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  52.54 
 
 
239 aa  230  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  52.19 
 
 
253 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  52.07 
 
 
259 aa  220  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  49.58 
 
 
247 aa  219  8e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  31.72 
 
 
554 aa  214  2e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  45.34 
 
 
567 aa  210  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0022  protein serine/threonine phosphatase  50.21 
 
 
511 aa  208  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  46.03 
 
 
571 aa  207  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0035  protein serine/threonine phosphatase  57.54 
 
 
687 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  41.79 
 
 
558 aa  203  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  49.8 
 
 
255 aa  199  8e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  50.22 
 
 
404 aa  198  2e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  49.34 
 
 
519 aa  191  3e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  43.59 
 
 
425 aa  188  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.89 
 
 
438 aa  186  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  41.25 
 
 
395 aa  186  8e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  47.66 
 
 
239 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  47.81 
 
 
236 aa  181  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  35.9 
 
 
452 aa  177  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1155  protein serine/threonine phosphatase  48.25 
 
 
267 aa  174  2e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.44 
 
 
237 aa  170  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  45.8 
 
 
355 aa  170  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  43.93 
 
 
369 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 
394 aa  166  9e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  41.09 
 
 
258 aa  163  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  39 
 
 
238 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.61 
 
 
247 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  42 
 
 
276 aa  157  5e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  35.97 
 
 
422 aa  156  8e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  41.84 
 
 
361 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  42.13 
 
 
416 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  39.36 
 
 
386 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  35.83 
 
 
319 aa  152  9e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  37.35 
 
 
597 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  38.33 
 
 
239 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.08 
 
 
280 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  37.66 
 
 
241 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  35.86 
 
 
236 aa  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.59 
 
 
238 aa  149  1e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.07 
 
 
611 aa  149  1e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.75 
 
 
271 aa  147  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  39.75 
 
 
271 aa  147  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  37.13 
 
 
244 aa  147  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  40.79 
 
 
234 aa  146  7e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  37.39 
 
 
538 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  34.85 
 
 
245 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  38.33 
 
 
240 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.67 
 
 
261 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.68 
 
 
470 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  40.43 
 
 
256 aa  144  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  33.97 
 
 
449 aa  143  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  33.61 
 
 
241 aa  143  9e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  39.33 
 
 
261 aa  143  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  38.87 
 
 
323 aa  142  1e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.24067e-08 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  42.92 
 
 
267 aa  141  2e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  32.23 
 
 
245 aa  142  2e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  1.79403e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  38.49 
 
 
236 aa  141  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  39.15 
 
 
325 aa  140  4e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  38.27 
 
 
270 aa  140  5e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  38.17 
 
 
259 aa  140  8e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  38.46 
 
 
250 aa  139  9e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  38.17 
 
 
259 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  2.23411e-06  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  38.19 
 
 
250 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  38.82 
 
 
250 aa  137  3e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0438  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.74 
 
 
287 aa  138  3e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285486  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>