More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0028 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  100 
 
 
476 aa  937    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  60.76 
 
 
470 aa  549  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  59.96 
 
 
469 aa  528  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  59.92 
 
 
470 aa  525  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  59.92 
 
 
470 aa  525  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  59.92 
 
 
470 aa  525  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  60.13 
 
 
470 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  57.93 
 
 
543 aa  505  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  61.47 
 
 
475 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  60 
 
 
487 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  53.42 
 
 
487 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  53.8 
 
 
493 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  51.6 
 
 
498 aa  434  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  58.3 
 
 
473 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  49.9 
 
 
496 aa  429  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  49 
 
 
460 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  48.67 
 
 
496 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  53.45 
 
 
459 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  51.03 
 
 
468 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  47.48 
 
 
517 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  49.12 
 
 
533 aa  392  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  49.66 
 
 
459 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  45.71 
 
 
529 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  47.45 
 
 
463 aa  388  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  53.2 
 
 
457 aa  388  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  44.47 
 
 
659 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  47.1 
 
 
563 aa  380  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  46.77 
 
 
486 aa  363  3e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  47.94 
 
 
462 aa  363  5.0000000000000005e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  40.84 
 
 
517 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  43.97 
 
 
469 aa  351  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  50.25 
 
 
474 aa  348  2e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  44.63 
 
 
496 aa  347  3e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  49.39 
 
 
494 aa  335  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  45.51 
 
 
463 aa  331  2e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  43.24 
 
 
519 aa  318  9e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  40.69 
 
 
429 aa  302  7.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  43.9 
 
 
493 aa  296  7e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.07 
 
 
924 aa  288  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  37.36 
 
 
426 aa  273  6e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3063  FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein  40 
 
 
480 aa  268  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00913088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  41.78 
 
 
435 aa  269  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.22 
 
 
954 aa  268  2e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  41.76 
 
 
933 aa  261  3e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  39.37 
 
 
441 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  39.28 
 
 
921 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  40.92 
 
 
405 aa  252  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  42.56 
 
 
444 aa  246  8e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  41.04 
 
 
439 aa  244  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  41.79 
 
 
481 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  39.45 
 
 
472 aa  239  6.999999999999999e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  38.19 
 
 
428 aa  236  9e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  39.01 
 
 
480 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  37.66 
 
 
472 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  36.81 
 
 
409 aa  230  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  35.56 
 
 
422 aa  230  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  35.99 
 
 
443 aa  229  8e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  36.07 
 
 
443 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  36.81 
 
 
409 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  31.86 
 
 
414 aa  223  7e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000372052  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  33.78 
 
 
399 aa  216  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  35.61 
 
 
463 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  32.58 
 
 
422 aa  213  7e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  33.07 
 
 
368 aa  189  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  33.33 
 
 
368 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  41.25 
 
 
972 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  34.91 
 
 
423 aa  170  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  33.25 
 
 
420 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  34.43 
 
 
367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  36.93 
 
 
374 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  33.87 
 
 
367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  32.41 
 
 
380 aa  163  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  34.55 
 
 
364 aa  162  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  35 
 
 
511 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  35 
 
 
511 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  35 
 
 
511 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  31.84 
 
 
371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3975  cell division protein FtsW  33.79 
 
 
359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  30.43 
 
 
375 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1276  stage V sporulation protein E  33.94 
 
 
374 aa  152  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  31.48 
 
 
365 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3524  cell division protein FtsW  36.58 
 
 
501 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.336809  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1303  cell division protein FtsW  35.02 
 
 
365 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3070  cell cycle protein FtsW  33.84 
 
 
354 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  29.4 
 
 
509 aa  150  4e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2650  cell cycle protein  31.71 
 
 
391 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.115542  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2851  cell division protein FtsW  32.94 
 
 
424 aa  149  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2645  cell division protein FtsW  33.68 
 
 
400 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3738  stage V sporulation protein E  34.49 
 
 
363 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29605  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  32.14 
 
 
391 aa  146  9e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  32.14 
 
 
391 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1229  stage V sporulation protein E  34.22 
 
 
363 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000285067  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2987  cell division protein FtsW  34.1 
 
 
506 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0447497 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3957  stage V sporulation protein E  33.96 
 
 
363 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3762  stage V sporulation protein E  33.96 
 
 
363 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3653  stage V sporulation protein E  33.96 
 
 
363 aa  144  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3670  stage V sporulation protein E  33.96 
 
 
363 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4050  stage V sporulation protein E  33.96 
 
 
363 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1980  cell division protein FtsW  30.85 
 
 
398 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3512  cell division protein FtsW  30.58 
 
 
480 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>