More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0027 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 		 495 aa  1002    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  57.14 
 
 		 504 aa  539  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  54.62 
 
 		 491 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  54.62 
 
 		 491 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  54.62 
 
 		 491 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  53.52 
 
 		 491 aa  502  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  52.73 
 
 		 491 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  52.31 
 
 		 491 aa  472  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  50.1 
 
 		 489 aa  443  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.91 
 
 		 493 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.75 
 
 		 488 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  46.18 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  44.24 
 
 		 482 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.6 
 
 		 480 aa  368  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  41.18 
 
 		 480 aa  355  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  43 
 
 		 493 aa  347  3e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.94 
 
 		 483 aa  342  7e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  40.88 
 
 		 490 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  42.18 
 
 		 489 aa  336  7e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.68 
 
 		 489 aa  333  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.6 
 
 		 485 aa  330  3e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.2 
 
 		 485 aa  326  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  39.34 
 
 		 503 aa  326  6e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.28 
 
 		 483 aa  325  9e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  40.6 
 
 		 485 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  39.02 
 
 		 501 aa  315  9e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  38.71 
 
 		 481 aa  314  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  39.88 
 
 		 488 aa  306  5.0000000000000004e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.2 
 
 		 490 aa  305  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.68 
 
 		 484 aa  302  8.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  38.76 
 
 		 482 aa  301  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  39.21 
 
 		 488 aa  301  2e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.04 
 
 		 487 aa  285  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.4 
 
 		 490 aa  279  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  37.01 
 
 		 492 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  36.73 
 
 		 486 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.35 
 
 		 486 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  38.03 
 
 		 481 aa  259  9e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  37.04 
 
 		 504 aa  247  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  35.13 
 
 		 489 aa  240  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  32.68 
 
 		 473 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  31.38 
 
 		 972 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.3 
 
 		 478 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  32.8 
 
 		 461 aa  209  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.93 
 
 		 472 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.12 
 
 		 458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  32.05 
 
 		 471 aa  196  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  33.78 
 
 		 493 aa  196  9e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  30.85 
 
 		 470 aa  194  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  30.99 
 
 		 487 aa  187  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  30.8 
 
 		 487 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.33 
 
 		 476 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.66 
 
 		 503 aa  183  6e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.16 
 
 		 924 aa  174  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.65 
 
 		 573 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  30.55 
 
 		 933 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  29.98 
 
 		 579 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  29.92 
 
 		 921 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  30.64 
 
 		 570 aa  164  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.83 
 
 		 547 aa  160  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  31.38 
 
 		 578 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  29.59 
 
 		 574 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.6 
 
 		 642 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  30.63 
 
 		 577 aa  146  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  29.28 
 
 		 610 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  29.07 
 
 		 640 aa  140  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  29.8 
 
 		 639 aa  140  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  30.06 
 
 		 584 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  28.68 
 
 		 701 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  29.26 
 
 		 709 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  30.84 
 
 		 643 aa  136  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  29.16 
 
 		 645 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  29.72 
 
 		 647 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  29.07 
 
 		 646 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.79 
 
 		 954 aa  132  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 643 aa  130  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  30.32 
 
 		 636 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  29.95 
 
 		 641 aa  130  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  28.67 
 
 		 645 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2560  penicillin-binding protein 2  27.65 
 
 		 700 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  29.66 
 
 		 535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0246  hypothetical protein  28.57 
 
 		 596 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.62 
 
 		 822 aa  128  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  28.02 
 
 		 634 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  28.86 
 
 		 636 aa  126  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  29.34 
 
 		 597 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  28.35 
 
 		 600 aa  124  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1455  peptidoglycan glycosyltransferase  28.84 
 
 		 657 aa  123  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991408  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  30.2 
 
 		 646 aa  123  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  28.24 
 
 		 629 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  29.44 
 
 		 646 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  26.67 
 
 		 628 aa  122  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  28.25 
 
 		 626 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  32.2 
 
 		 619 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  26.3 
 
 		 716 aa  120  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0890  peptidoglycan glycosyltransferase  27.34 
 
 		 547 aa  119  9e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  30.96 
 
 		 766 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  26.95 
 
 		 647 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  28.6 
 
 		 629 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  29.03 
 
 		 629 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>