199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_4019 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  96.33 
 
 
356 aa  697    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  100 
 
 
357 aa  724    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  58.57 
 
 
358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  52.56 
 
 
369 aa  359  4e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  56.7 
 
 
348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  52.16 
 
 
359 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  53.8 
 
 
349 aa  312  5.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  42.17 
 
 
391 aa  248  9e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  43.23 
 
 
391 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  39.61 
 
 
405 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  38.81 
 
 
386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  38.68 
 
 
386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  38.46 
 
 
383 aa  242  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  44.18 
 
 
349 aa  239  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  40.42 
 
 
388 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  38.99 
 
 
383 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  38.99 
 
 
383 aa  236  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  38.99 
 
 
383 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  39.44 
 
 
355 aa  236  4e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  40.39 
 
 
387 aa  236  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  38.98 
 
 
388 aa  235  8e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  39.82 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  37.4 
 
 
385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  39.94 
 
 
382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  39.38 
 
 
384 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  41.11 
 
 
372 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  38.3 
 
 
387 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  39.64 
 
 
382 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  38.24 
 
 
385 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  39.05 
 
 
382 aa  230  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  39.05 
 
 
382 aa  230  2e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  39.05 
 
 
382 aa  230  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  39.05 
 
 
382 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  38.78 
 
 
393 aa  230  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  39.05 
 
 
382 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  39.38 
 
 
383 aa  229  5e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4902  galactokinase  43.94 
 
 
379 aa  229  8e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.227753  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  38.76 
 
 
382 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  35.34 
 
 
379 aa  224  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  39.4 
 
 
383 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  38.21 
 
 
350 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  38.21 
 
 
350 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  37.5 
 
 
382 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  37.5 
 
 
382 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  37.5 
 
 
382 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  38.17 
 
 
382 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  38.17 
 
 
382 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  40.5 
 
 
389 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  35.83 
 
 
385 aa  221  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  42.39 
 
 
404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  37.01 
 
 
388 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  37.74 
 
 
351 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  37.68 
 
 
412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  42.52 
 
 
376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  37.77 
 
 
403 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  36.31 
 
 
398 aa  210  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  35.76 
 
 
387 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  36.23 
 
 
387 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  37.88 
 
 
392 aa  206  4e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  33.42 
 
 
394 aa  205  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  35.92 
 
 
387 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0694  galactokinase  36.16 
 
 
381 aa  202  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0536  galactokinase  37.01 
 
 
382 aa  202  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0132306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3249  galactokinase  36.02 
 
 
381 aa  202  8e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  34.89 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4206  galactokinase  43.42 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  37.03 
 
 
409 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  36.42 
 
 
381 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  35.15 
 
 
389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  36.42 
 
 
381 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  36.42 
 
 
381 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  41.84 
 
 
373 aa  199  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  36.42 
 
 
381 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  33.42 
 
 
392 aa  199  6e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  38.78 
 
 
387 aa  199  7.999999999999999e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  36.31 
 
 
385 aa  199  9e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4056  galactokinase  38.78 
 
 
403 aa  199  9e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37616  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2952  galactokinase  38.19 
 
 
387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  38.59 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  35.71 
 
 
380 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  39.23 
 
 
418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  38.17 
 
 
389 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  37 
 
 
394 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0544  galactokinase  38.18 
 
 
380 aa  196  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  36.16 
 
 
385 aa  196  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0544  galactokinase  35.31 
 
 
381 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.319757  normal  0.225468 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0414  galactokinase  34.35 
 
 
381 aa  195  9e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  37.32 
 
 
396 aa  195  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  35.69 
 
 
399 aa  195  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  41.42 
 
 
414 aa  195  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3408  galactokinase  35.59 
 
 
381 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0618615 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3578  galactokinase  35.03 
 
 
381 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  38.44 
 
 
394 aa  193  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  36.21 
 
 
389 aa  192  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  37.47 
 
 
388 aa  192  8e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  33.06 
 
 
386 aa  192  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  35.29 
 
 
383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  34.56 
 
 
391 aa  190  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  34.47 
 
 
395 aa  189  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  36.29 
 
 
405 aa  189  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>