More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_4010 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  100 
 
 		 167 aa  341  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  99.4 
 
 		 167 aa  338  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  71.78 
 
 		 171 aa  252  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  72.39 
 
 		 171 aa  250  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  71.78 
 
 		 169 aa  250  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  70.3 
 
 		 171 aa  249  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  66.67 
 
 		 171 aa  229  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  64.74 
 
 		 166 aa  216  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  63.8 
 
 		 171 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  64.1 
 
 		 166 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  59.76 
 
 		 166 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  59.76 
 
 		 166 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  59.76 
 
 		 166 aa  210  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  59.15 
 
 		 166 aa  208  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  64.29 
 
 		 171 aa  207  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  60.39 
 
 		 170 aa  202  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1832  redoxin domain-containing protein  60.78 
 
 		 172 aa  201  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286285  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  53.01 
 
 		 164 aa  199  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  58.97 
 
 		 166 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  58.97 
 
 		 166 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  58.97 
 
 		 166 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  58.97 
 
 		 166 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  58.97 
 
 		 166 aa  199  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  58.33 
 
 		 166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  58.33 
 
 		 166 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  54.82 
 
 		 164 aa  197  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  54.82 
 
 		 164 aa  197  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0010  redoxin domain-containing protein  49.4 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0754546  hitchhiker  0.00424359 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  50.31 
 
 		 171 aa  181  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2147  Redoxin domain protein  54.55 
 
 		 165 aa  180  6e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  54.14 
 
 		 167 aa  179  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  51.57 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  51.23 
 
 		 173 aa  174  6e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  47.56 
 
 		 164 aa  173  8e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  46.3 
 
 		 164 aa  170  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  50.96 
 
 		 228 aa  168  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0452  Redoxin domain protein  47.24 
 
 		 166 aa  167  5e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  49.39 
 
 		 197 aa  165  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  48.21 
 
 		 170 aa  164  5e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0524  Redoxin domain protein  49.32 
 
 		 171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  49.7 
 
 		 166 aa  162  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  50.91 
 
 		 166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  49.7 
 
 		 167 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0997  thiol peroxidase  45.4 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.985452  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  47.67 
 
 		 191 aa  159  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  49.4 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1036  redoxin domain-containing protein  48.99 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  49.4 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  47.88 
 
 		 166 aa  158  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0408  redoxin domain-containing protein  48.32 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.989776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0174  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  50 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  48.81 
 
 		 187 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1204  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.73 
 
 		 197 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1275  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.73 
 
 		 197 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000737792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1205  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.73 
 
 		 197 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0888601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1349  Redoxin domain protein  46.34 
 
 		 197 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251869  hitchhiker  0.0000000000448162 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3029  redoxin domain-containing protein  46.34 
 
 		 197 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000167246  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3172  redoxin domain-containing protein  46.34 
 
 		 197 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000900168  hitchhiker  0.000325363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3014  redoxin domain-containing protein  46.34 
 
 		 197 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000289393  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  47.53 
 
 		 165 aa  153  9e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2676  redoxin domain-containing protein  45.73 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.055079  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0425  Redoxin domain protein  47.17 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1360  antioxidant Tpx  44.51 
 
 		 204 aa  150  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000292969  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31810  thiol peroxidase  48.48 
 
 		 165 aa  150  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.230308  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  43.03 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0035  Redoxin domain protein  43.79 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  46.11 
 
 		 166 aa  147  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2869  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.71 
 
 		 166 aa  147  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2704  thiol peroxidase  47.85 
 
 		 165 aa  147  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.821537  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0624  thiol peroxidase  46.75 
 
 		 168 aa  147  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000437492  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  47.31 
 
 		 166 aa  147  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0630  thiol peroxidase  43.45 
 
 		 169 aa  147  8e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0146681  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  47.31 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1240  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  45.78 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  44.91 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0642  thiol peroxidase (scavengase P20)  47.06 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  44.91 
 
 		 166 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  45.51 
 
 		 181 aa  144  4.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1822  Redoxin domain protein  44.05 
 
 		 179 aa  144  6e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  46.11 
 
 		 166 aa  144  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0132  thiol peroxidase  44.64 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  44.64 
 
 		 165 aa  144  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1262  redoxin domain-containing protein  47.27 
 
 		 165 aa  143  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.828642 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1159  thiol peroxidase  45.24 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0532  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  46.01 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  43.11 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0950  thiol peroxidase  44.85 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1729  thiol peroxidase  45.83 
 
 		 179 aa  141  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  44.51 
 
 		 167 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  43.64 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  44.51 
 
 		 167 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3537  thiol peroxidase  46.75 
 
 		 169 aa  141  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.515371 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02074  Peroxiredoxin  44.05 
 
 		 166 aa  141  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.148963  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2534  Redoxin domain protein  43.56 
 
 		 167 aa  140  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1888  thiol peroxidase  45.73 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2505  thiol peroxidase  44.05 
 
 		 167 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155608  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3504  thiol peroxidase  44.05 
 
 		 167 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3507  thiol peroxidase  44.05 
 
 		 167 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3279  thiol peroxidase  44.05 
 
 		 167 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0426  thiol peroxidase  44.05 
 
 		 167 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>