218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_4009 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 133 aa  277  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4102  hemerythrin-like metal-binding protein  88.51 
 
 		 90 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  42.42 
 
 		 133 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  38.71 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1467  hemerythrin-like metal-binding protein  42.97 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.437815 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  38.71 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  40.16 
 
 		 135 aa  103  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2773  hemerythrin-like metal-binding protein  43.75 
 
 		 145 aa  103  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0368703  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  37.01 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.21 
 
 		 518 aa  100  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.21 
 
 		 722 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  35.16 
 
 		 135 aa  95.9  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  35.16 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1324  hemerythrin-like metal-binding protein  33.33 
 
 		 135 aa  94.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149718  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  35.77 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  35.48 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.8 
 
 		 529 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.8 
 
 		 529 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.8 
 
 		 529 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.8 
 
 		 529 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.13 
 
 		 529 aa  90.1  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  34.4 
 
 		 529 aa  89.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  33.59 
 
 		 132 aa  89.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.13 
 
 		 529 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  34.11 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.13 
 
 		 529 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.54 
 
 		 779 aa  88.2  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1302  hemerythrin family protein  35.38 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.45 
 
 		 559 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.191486  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.97 
 
 		 526 aa  87.4  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  36.07 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.66 
 
 		 963 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2752  hemerythrin-like, metal-binding  33.87 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.82 
 
 		 515 aa  84.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.45 
 
 		 689 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  31.97 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.71 
 
 		 518 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4100  hypothetical protein  73.58 
 
 		 53 aa  83.6  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.07 
 
 		 927 aa  83.6  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3168  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.59 
 
 		 926 aa  82.8  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000240071  normal  0.0523799 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.06 
 
 		 515 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0465  hemerythrin-like metal-binding protein  36.07 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0529238  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  32.81 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1399  hemerythrin-like metal-binding protein  31.01 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.746875  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  39.02 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  32.03 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  36.43 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  38.21 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  33.87 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1655  hemerythrin HHE cation binding region  33.87 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00000138474  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  30 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1074  hemerythrin-like metal-binding protein  30.77 
 
 		 360 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  33.06 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1745  hemerythrin family protein  36 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1617  hypothetical protein  36.89 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.602038  normal  0.512571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  28.68 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  34.15 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.23 
 
 		 518 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0715  hemerythrin family protein  32.81 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3696  hemerythrin HHE cation binding region  34.88 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.97 
 
 		 1032 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000134562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.15 
 
 		 994 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  29.01 
 
 		 736 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.93 
 
 		 963 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.67 
 
 		 530 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  32.31 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4355  hypothetical protein  36.59 
 
 		 213 aa  73.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.340338  normal  0.157708 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0256  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  28.79 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0434  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.71 
 
 		 579 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1969  hemerythrin-like metal-binding protein  29.46 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  33.83 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2231  hemerythrin-like metal-binding protein  34.75 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.29139  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  33.83 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2359  hemerythrin-like metal-binding protein  31.71 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236367  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4221  hemerythrin family protein  33.09 
 
 		 188 aa  70.5  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.568355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3118  hemerythrin-like metal-binding protein  37.39 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1401  hemerythrin-like metal-binding protein  27.91 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 		 997 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0506564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  32.09 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  33.59 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1351  histidine kinase  31.78 
 
 		 596 aa  68.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4236  hemerythrin family protein  33.6 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2255  hemerythrin-like metal-binding protein  26.56 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.547247  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  30.6 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  32.79 
 
 		 470 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0548  hemerythrin-like metal-binding protein  29.03 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.962714 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  32.03 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  29.75 
 
 		 667 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0794  cation-binding hemerythrin HHE family protein  27.34 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0187514  normal  0.130272 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2168  iron-binding protein, hemerythrin  31.75 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0820701  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  30 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  32.03 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4695  response regulator  31.75 
 
 		 519 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.111468  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2447  hemerythrin-like metal-binding protein  34.23 
 
 		 615 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.148826  normal  0.0273457 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.51 
 
 		 941 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0724  cation-binding hemerythrin HHE family protein  25.78 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.98022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  30.47 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3091  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.89 
 
 		 662 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2484  hemerythrin-like metal-binding protein  29.37 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0423908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>