39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3982 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3982  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  283  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0734  thioesterase superfamily protein  50.38 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254305  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3233  hypothetical protein  49.62 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3802  hypothetical protein  46.56 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  hitchhiker  0.000140852 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0155  thioesterase superfamily protein  48.46 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0128  hypothetical protein  42.42 
 
 		 129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000227024  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0086  hypothetical protein  43.18 
 
 		 130 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  41.18 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3066  thioesterase superfamily protein  41.04 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.22535e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  37.98 
 
 		 123 aa  90.5  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2252  thioesterase superfamily protein  37.12 
 
 		 134 aa  90.5  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2209  thioesterase superfamily protein  37.59 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000185786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2467  hypothetical protein  34.33 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2969  thioesterase  38.17 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1506  thioesterase  35.07 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0703562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1847  thioesterase superfamily protein  56.52 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3560  hypothetical protein  46.94 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0080  hypothetical protein  37.31 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1742  thioesterase superfamily protein  37.21 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  37.89 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2323  hypothetical protein  30 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0696  dihydrolipoamide acyltransferase  34.04 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2310  conserved hypothetical protein  39.77 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8316  hypothetical protein  35.79 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1320  thioesterase  29.69 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.262542 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2156  thioesterase-like protein  32.81 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1291  hypothetical protein  37.21 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  27.61 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1367  hypothetical protein  31.01 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.412504  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3033  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1187  hypothetical protein  30.71 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.238156 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3259  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0813  hypothetical protein  28.12 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.823237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7731  thioesterase superfamily protein  32.63 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0552  thioesterase superfamily protein  36.76 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000347456  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1708  thioesterase superfamily protein  31.31 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850113  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1520  thioesterase superfamily protein  32.98 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1901  thioesterase-like protein  30.37 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0573  hypothetical protein  30.3 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>