More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3971 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3113  metallo-beta-lactamase family protein  77.3 
 
 		 533 aa  863    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3415  beta-lactamase domain protein  70.6 
 
 		 593 aa  823    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0366  hypothetical protein  77.24 
 
 		 558 aa  907    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0664287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3971  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 558 aa  1126    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1268  metallo-beta-lactamase family protein  54.69 
 
 		 553 aa  647    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000954754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4057  beta-lactamase domain protein  97.85 
 
 		 558 aa  1112    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0383  beta-lactamase domain-containing protein  73.54 
 
 		 569 aa  825    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4393  beta-lactamase domain-containing protein  84.95 
 
 		 558 aa  984    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0728616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1494  beta-lactamase domain-containing protein  53.28 
 
 		 560 aa  632  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000870726  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1597  beta-lactamase domain-containing protein  56.63 
 
 		 561 aa  629  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0947  beta-lactamase domain-containing protein  53.92 
 
 		 554 aa  626  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0645  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  54.83 
 
 		 564 aa  623  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000101529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2028  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  52.9 
 
 		 555 aa  624  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1938  beta-lactamase domain-containing protein  53.47 
 
 		 554 aa  618  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1069  hypothetical protein  52.74 
 
 		 555 aa  615  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000100194  normal  0.0563275 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3163  beta-lactamase domain protein  54.01 
 
 		 554 aa  618  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1772  beta-lactamase domain protein  53.25 
 
 		 555 aa  617  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0198506  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1745  RNA-metabolizing metallo-beta-lactamase family protein  52.36 
 
 		 555 aa  617  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3657  beta-lactamase domain protein  51.64 
 
 		 554 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000145039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1678  beta-lactamase domain protein  53.11 
 
 		 553 aa  607  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1302  hypothetical protein  53.1 
 
 		 555 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08700  beta-lactamase domain protein  52.18 
 
 		 558 aa  600  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000465654  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1816  beta-lactamase domain-containing protein  50.45 
 
 		 559 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000137497  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2294  beta-lactamase domain-containing protein  49.82 
 
 		 618 aa  585  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0627  beta-lactamase domain protein  50.27 
 
 		 555 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.223093  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0941  beta-lactamase domain protein  48.18 
 
 		 560 aa  568  1e-160  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1460  beta-lactamase domain protein  48.82 
 
 		 566 aa  566  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2585  beta-lactamase domain-containing protein  49.09 
 
 		 549 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0424665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1460  beta-lactamase domain protein  49.54 
 
 		 551 aa  547  1e-154  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000017363  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2092  beta-lactamase-like  48.56 
 
 		 556 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.471204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1150  beta-lactamase domain protein  47.81 
 
 		 548 aa  538  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1781  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.92 
 
 		 557 aa  538  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_380  metallo-beta-lactamase  48.28 
 
 		 551 aa  535  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0438  metallo-beta-lactamase family protein  48.09 
 
 		 551 aa  534  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.386369  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0415  beta-lactamase domain-containing protein  48.09 
 
 		 551 aa  534  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.223724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4026  hypothetical protein  46.32 
 
 		 555 aa  531  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0999117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3567  beta-lactamase domain-containing protein  46.74 
 
 		 556 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00558369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1522  metallo-beta-lactamase family protein  46.56 
 
 		 557 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0439193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1494  Zn-dependent hydrolase  46.38 
 
 		 557 aa  533  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000794402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2449  beta-lactamase domain-containing protein  46.38 
 
 		 583 aa  532  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1403  metallo-beta-lactamase family protein  46.38 
 
 		 556 aa  533  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0055609  hitchhiker  0.000000000000158477 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1707  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.56 
 
 		 557 aa  533  1e-150  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3896  metallo-beta-lactamase family protein  46.56 
 
 		 556 aa  535  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0341705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3804  beta-lactamase domain-containing protein  46.51 
 
 		 555 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.199247  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4097  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  46.32 
 
 		 555 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000534796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3992  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  46.32 
 
 		 555 aa  531  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3833  metallo-beta-lactamase family protein  46.2 
 
 		 556 aa  530  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000419922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3648  metallo-beta-lactamase family protein  46.2 
 
 		 556 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3887  hypothetical protein  46.32 
 
 		 555 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0624715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3538  metallo-beta-lactamase family protein  46.2 
 
 		 556 aa  531  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0178756  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3719  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  46.32 
 
 		 555 aa  531  1e-149  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.998295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1484  Zn-dependent hydrolase  46.38 
 
 		 557 aa  531  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000568728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3556  metallo-beta-lactamase family protein  46.2 
 
 		 556 aa  530  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3735  metallo-beta-lactamase superfamily hydrolase  46.32 
 
 		 555 aa  531  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4080  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  46.14 
 
 		 555 aa  530  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0747948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3933  metallo-beta-lactamase family protein  46.2 
 
 		 556 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00612119  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4190  hypothetical protein  46.32 
 
 		 555 aa  531  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3809  metallo-beta-lactamase family protein  46.2 
 
 		 556 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2993599999999999e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3668  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.56 
 
 		 557 aa  531  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3845  metallo-beta-lactamase family protein  46.2 
 
 		 556 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000592634  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2679  beta-lactamase domain-containing protein  45.96 
 
 		 555 aa  531  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000157483  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0796  beta-lactamase domain protein  47.56 
 
 		 553 aa  528  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1160  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  45.96 
 
 		 555 aa  528  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1676  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.38 
 
 		 557 aa  530  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0518689  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1420  hypothetical protein  46.9 
 
 		 547 aa  526  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1730  metallo-beta-lactamase family protein  45.47 
 
 		 557 aa  524  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.744262  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2926  beta-lactamase domain protein  46.74 
 
 		 553 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.440144 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1939  beta-lactamase domain protein  47.34 
 
 		 555 aa  520  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1616  beta-lactamase domain-containing protein  49.02 
 
 		 559 aa  521  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0224319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1333  beta-lactamase domain-containing protein  44.96 
 
 		 557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2447  beta-lactamase domain protein  46.2 
 
 		 557 aa  514  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0947  beta-lactamase domain protein  45.04 
 
 		 555 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1827  beta-lactamase domain protein  45.22 
 
 		 555 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4416  beta-lactamase domain-containing protein  44.68 
 
 		 569 aa  510  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2375  beta-lactamase domain protein  44.01 
 
 		 550 aa  496  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796055  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1747  metallo-beta-lactamase family protein  42.93 
 
 		 677 aa  489  1e-137  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1137  metallo-beta-lactamase family protein  48.33 
 
 		 554 aa  489  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025628  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4078  beta-lactamase domain-containing protein  45.68 
 
 		 561 aa  491  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35741  normal  0.385079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0875  beta-lactamase domain-containing protein  45.32 
 
 		 561 aa  489  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0942136  normal  0.212553 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2198  metallo-beta-lactamase superfamily protein  43.06 
 
 		 555 aa  487  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1149  beta-lactamase domain-containing protein  44.32 
 
 		 565 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1171  beta-lactamase domain-containing protein  44.32 
 
 		 565 aa  487  1e-136  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7858  beta-lactamase domain protein  46 
 
 		 561 aa  488  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.627673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3518  beta-lactamase domain protein  43.82 
 
 		 552 aa  485  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000333928  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0676  metallo-beta-lactamase family protein  42.75 
 
 		 560 aa  484  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07160  beta-lactamase domain protein  45.17 
 
 		 561 aa  483  1e-135  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0422873  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1230  beta-lactamase domain protein  45.39 
 
 		 561 aa  483  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1171  beta-lactamase domain protein  44.08 
 
 		 555 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000121599  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1033  beta-lactamase domain protein  45.27 
 
 		 561 aa  482  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.76638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2063  beta-lactamase domain protein  44.34 
 
 		 556 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1081  beta-lactamase domain-containing protein  46.2 
 
 		 561 aa  483  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177081  hitchhiker  0.00575165 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0478  beta-lactamase domain protein  43.88 
 
 		 572 aa  481  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1200  beta-lactamase domain-containing protein  44.75 
 
 		 561 aa  479  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.582889  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0647  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  44.26 
 
 		 561 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2106  beta-lactamase domain-containing protein  44.3 
 
 		 554 aa  480  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  45.37 
 
 		 561 aa  478  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.712095 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1115  hypothetical protein  42.73 
 
 		 573 aa  478  1e-133  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2465  beta-lactamase domain protein  45.85 
 
 		 561 aa  478  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.867081  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25240  predicted hydrolase of the metallo-beta-lactamase superfamily  45.8 
 
 		 565 aa  476  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0179  beta-lactamase domain protein  43.59 
 
 		 591 aa  476  1e-133  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>