More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3942 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  72.67 
 
 		 610 aa  862    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  96.69 
 
 		 604 aa  1129    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  75.83 
 
 		 598 aa  913    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  73.37 
 
 		 607 aa  865    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  70.18 
 
 		 606 aa  819    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 603 aa  1202    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  69.09 
 
 		 601 aa  814    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  47.46 
 
 		 769 aa  555  1e-157  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  47.22 
 
 		 769 aa  555  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  47.22 
 
 		 769 aa  551  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  46.35 
 
 		 785 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  46.5 
 
 		 770 aa  536  1e-151  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  47.63 
 
 		 770 aa  536  1e-151  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  45.77 
 
 		 783 aa  530  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  45.61 
 
 		 774 aa  527  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  44.88 
 
 		 803 aa  524  1e-147  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  46.26 
 
 		 770 aa  511  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 652 aa  432  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  38.47 
 
 		 650 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  41 
 
 		 639 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  38.09 
 
 		 801 aa  402  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 		 653 aa  404  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  39.53 
 
 		 766 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  49.29 
 
 		 681 aa  395  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 796 aa  395  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 		 728 aa  394  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  47.6 
 
 		 701 aa  391  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  40.97 
 
 		 742 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  51.79 
 
 		 685 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 1031 aa  389  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  46.1 
 
 		 696 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 760 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 		 730 aa  381  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  45.94 
 
 		 767 aa  381  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  48.06 
 
 		 695 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  49.36 
 
 		 666 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 654 aa  372  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  38.07 
 
 		 910 aa  373  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 878 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  45.67 
 
 		 719 aa  372  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  35.28 
 
 		 654 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 		 759 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2694  CheA signal transduction histidine kinase  46.27 
 
 		 558 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  35.43 
 
 		 654 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  49.22 
 
 		 729 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  35.43 
 
 		 654 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  36.26 
 
 		 888 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  35.43 
 
 		 654 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 		 745 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  35.19 
 
 		 942 aa  371  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  47.93 
 
 		 673 aa  372  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  35.43 
 
 		 654 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 697 aa  372  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  43.36 
 
 		 736 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  49.48 
 
 		 677 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  44.71 
 
 		 675 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  35.43 
 
 		 654 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  48.04 
 
 		 747 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  34.99 
 
 		 598 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 747 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  45.98 
 
 		 954 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  47.79 
 
 		 660 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  48.04 
 
 		 743 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  35.4 
 
 		 652 aa  368  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  46.17 
 
 		 713 aa  365  1e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  47.78 
 
 		 747 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  47.78 
 
 		 737 aa  364  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  44.34 
 
 		 746 aa  365  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 		 871 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  47.78 
 
 		 739 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  46.35 
 
 		 655 aa  363  7.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  42.71 
 
 		 760 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 911 aa  362  8e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 		 747 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  47.52 
 
 		 691 aa  362  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 746 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  46.21 
 
 		 748 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  45.5 
 
 		 741 aa  361  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  47.41 
 
 		 666 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  47 
 
 		 753 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  47.16 
 
 		 715 aa  360  5e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  43.62 
 
 		 701 aa  359  6e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  44.24 
 
 		 734 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0933  CheA signal transduction histidine kinase  45.6 
 
 		 674 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 934 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 738 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  45.52 
 
 		 762 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  46.21 
 
 		 709 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 		 733 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  45.27 
 
 		 762 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 		 690 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  44.71 
 
 		 714 aa  356  7.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  46.21 
 
 		 758 aa  356  7.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  34.9 
 
 		 655 aa  356  7.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  45.43 
 
 		 692 aa  355  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  46.21 
 
 		 748 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 		 673 aa  355  1e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  45.02 
 
 		 741 aa  355  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 		 686 aa  355  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  45.32 
 
 		 754 aa  355  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>