270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3831 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3831  flagellar hook capping protein  100 
 
 		 221 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  93.67 
 
 		 221 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4206  flagellar hook capping protein  59.36 
 
 		 221 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3105  flagellar hook capping protein  51.49 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0417  flagellar hook assembly protein FlgD  54.34 
 
 		 218 aa  209  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3433  flagellar hook capping protein  45.54 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3297  flagellar hook capping protein  43 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1185  flagellar hook initiation protein FlgD  40.28 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  37.32 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  37.32 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0782  flagellar hook capping protein  36.04 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  37.2 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5627  flagellar basal body rod modification protein  42.7 
 
 		 226 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1712  basal-body rod modification protein FlgD  38.61 
 
 		 263 aa  131  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1527  flagellar hook capping protein  39.78 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3736  flagellar basal body rod modification protein  42.26 
 
 		 222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0751  flagellar hook capping protein  43.58 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.873785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0576  flagellar hook capping protein  36.41 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0711  flagellar hook capping protein  39.9 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3712  flagellar hook capping protein  38.99 
 
 		 215 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.395074 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4789  flagellar hook capping protein  38.99 
 
 		 215 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.739847  normal  0.428557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0547  flagellar hook capping protein  38.29 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0186005  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4575  flagellar hook capping protein  38.92 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.639421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2186  flagellar hook capping protein  36.79 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4197  flagellar hook capping protein  40.23 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2433  flagellar hook capping protein  36 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4249  flagellar basal body rod modification protein  42 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5120  flagellar hook capping protein  39.09 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560681  normal  0.0108899 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1538  flagellar hook capping protein  29.95 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3164  putative basal-body rod modification protein flgD  38.34 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562782  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4094  flagellar hook capping protein  36.95 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.370214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4462  flagellar hook capping protein  37.13 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0756934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1466  flagellar basal body rod modification protein  31.12 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3730  flagellar basal body rod modification protein  31.13 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.468195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1555  flagellar basal body rod modification protein  37.22 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1635  flagellar hook capping protein  35.16 
 
 		 265 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.122808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5061  flagellar hook capping protein  37.44 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.433683  normal  0.0695109 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0344  basal-body rod modification protein FlgD  39.9 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.974182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24020  flagellar basal body rod modification protein  34.97 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1292  flagellar hook capping protein  33.53 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1617  flagellar hook capping protein  31.96 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0870  flagellar hook capping protein  41.67 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2968  flagellar basal body rod modification protein  38.74 
 
 		 225 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.127656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0764  flagellar hook capping protein  38.34 
 
 		 220 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.282848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1870  flagellar basal body rod modification protein  37.28 
 
 		 224 aa  104  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0256  flagellar hook capping protein  37.82 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2848  flagellar basal body rod modification protein  34.34 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128669 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3479  flagellar basal body rod modification protein  34.65 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.205954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0107  flagellar hook capping protein  33.86 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00091952  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1323  flagellar basal body rod modification protein  34.07 
 
 		 222 aa  102  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3327  flagellar basal body rod modification protein  41.61 
 
 		 277 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3352  flagellar basal body rod modification protein  41.61 
 
 		 277 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2996  flagellar basal body rod modification protein  41.61 
 
 		 277 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2097  flagellar basal body rod modification protein  41.61 
 
 		 277 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0258  flagellar hook capping protein  37.18 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0280  flagellar basal body rod modification protein  41.61 
 
 		 280 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1635  flagellar basal body rod modification protein  37.08 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.904883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0464  flagellar basal body rod modification protein  41.61 
 
 		 280 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0268  flagellar basal body rod modification protein  41.61 
 
 		 280 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501331  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0242  flagellar basal body rod modification protein  41.61 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2596  flagellar basal body rod modification protein  38.46 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.661244  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1009  flagellar hook capping protein  35.44 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.100104  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4298  flagellar basal body rod modification protein  35.76 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50460  flagellar basal body rod modification protein  35.76 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.021036 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2289  flagellar hook capping protein  33.85 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3042  flagellar basal body rod modification protein  39.33 
 
 		 248 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1104  flagellar hook capping protein  34.18 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2409  flagellar basal body rod modification protein  37.58 
 
 		 248 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3023  flagellar basal body rod modification protein  37.58 
 
 		 248 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112366  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1935  basal-body rod modification protein FlgD  32.14 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1288  flagellar basal body rod modification protein  35.38 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.126128  normal  0.0193993 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2196  flagellar basal body rod modification protein  35.38 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000763375 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1273  flagellar basal body rod modification protein  35.38 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.41149  normal  0.0170794 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1244  flagellar basal body rod modification protein  35.38 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.450688  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2012  flagellar basal body rod modification protein  35.38 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01071  flagellar basal body rod modification protein D  37.79 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.600835  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2053  flagellar basal body rod modification protein  37.79 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.251185 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01079  hypothetical protein  37.79 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.703206  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2571  flagellar hook capping protein  36.41 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.67756  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6369  flagellar basal body rod modification protein  37.58 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.338716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1198  flagellar basal body rod modification protein  37.79 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2525  flagellar basal body rod modification protein  37.79 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.414017  hitchhiker  0.00818545 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1454  flagellar basal body rod modification protein  37.79 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192771 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1198  flagellar basal body rod modification protein  36.41 
 
 		 231 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2423  flagellar basal body rod modification protein  34.52 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.563147  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2250  flagellar basal body rod modification protein  35.87 
 
 		 231 aa  95.5  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4422  flagellar hook capping protein  38.92 
 
 		 216 aa  95.5  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0689  flagellar hook capping protein  33.18 
 
 		 221 aa  95.1  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.603097  normal  0.525021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3950  flagellar basal body rod modification protein  34.44 
 
 		 233 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0247  flagellar hook capping protein  31.96 
 
 		 263 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00661658 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2322  flagellar basal body rod modification protein  34.01 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1472  flagellar hook capping protein  34.34 
 
 		 227 aa  94  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1956  flagellar hook capping protein  34.18 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3018  flagellar basal body rod modification protein  40.43 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2000  flagellar basal body rod modification protein  34.01 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4389  flagellar basal body rod modification protein  34.44 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6063  flagellar hook capping protein  35.82 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2922  flagellar hook capping protein  35.47 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1122  flagellar basal body rod modification protein  34.22 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.957551  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0030  flagellar hook capping protein  30 
 
 		 221 aa  92.4  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>