More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3822 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 
261 aa  507  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  96.17 
 
 
261 aa  493  1e-138  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  62.45 
 
 
261 aa  329  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  50.76 
 
 
264 aa  266  3e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  53.12 
 
 
264 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  51.17 
 
 
264 aa  259  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  50.78 
 
 
265 aa  253  1e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  37.98 
 
 
258 aa  169  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  32.79 
 
 
259 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  31.43 
 
 
257 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  32.65 
 
 
265 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  33.74 
 
 
260 aa  141  9e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  32 
 
 
261 aa  141  1e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  38.83 
 
 
253 aa  139  4e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  34.02 
 
 
255 aa  139  5e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  33.47 
 
 
264 aa  134  1e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  36.93 
 
 
255 aa  134  2e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  3.89137e-10  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  32.59 
 
 
260 aa  129  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  37.05 
 
 
260 aa  127  1e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  34.44 
 
 
260 aa  127  2e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  31.76 
 
 
263 aa  127  2e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  34.58 
 
 
253 aa  126  4e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  33.61 
 
 
262 aa  125  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  33.74 
 
 
265 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  30.8 
 
 
253 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  34.78 
 
 
261 aa  123  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  32.91 
 
 
260 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  34.05 
 
 
264 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  32.91 
 
 
260 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  34.05 
 
 
264 aa  119  4e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  34.05 
 
 
264 aa  119  4e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  34.05 
 
 
264 aa  119  4e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  33.62 
 
 
264 aa  119  5e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.10874e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  35.65 
 
 
261 aa  119  5e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  32.93 
 
 
257 aa  114  2e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  32.23 
 
 
259 aa  114  2e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  31 
 
 
255 aa  113  4e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  28.29 
 
 
261 aa  113  4e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2050  flagellar biosynthesis protein FliR  34.05 
 
 
261 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.09328e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  31.58 
 
 
260 aa  112  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  30.74 
 
 
247 aa  112  7e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  32.31 
 
 
256 aa  112  7e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1698  flagellar biosynthetic protein FliR  34.05 
 
 
261 aa  112  8e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.12821e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  30.74 
 
 
256 aa  112  8e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2727  flagellar biosynthesis protein FliR  34.05 
 
 
261 aa  111  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00116197  normal  0.508279 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2183  flagellar biosynthesis protein FliR  34.05 
 
 
261 aa  111  9e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.59397e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1692  flagellar biosynthesis protein FliR  35.47 
 
 
261 aa  111  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  5.55568e-06  normal  0.0138418 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  27.39 
 
 
257 aa  111  9e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1234  flagellar biosynthesis protein FliR  34.05 
 
 
261 aa  111  1e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.14634e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1071  flagellar biosynthesis protein FliR  34.05 
 
 
261 aa  111  1e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.09979e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  32.89 
 
 
264 aa  111  1e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1564  flagellar biosynthetic protein FliR  34.3 
 
 
260 aa  111  1e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  29.44 
 
 
255 aa  110  2e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  31.54 
 
 
258 aa  110  2e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  29.37 
 
 
258 aa  110  2e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  29.24 
 
 
255 aa  110  2e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  34.78 
 
 
260 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  34.78 
 
 
260 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  34.78 
 
 
260 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  33.47 
 
 
261 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  34.78 
 
 
260 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  34.78 
 
 
260 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  34.78 
 
 
260 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  34.78 
 
 
260 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  34.78 
 
 
260 aa  108  7e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2959  flagellar biosynthesis protein FliR  35.47 
 
 
260 aa  108  9e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  29.66 
 
 
255 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  31.51 
 
 
263 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  33.74 
 
 
266 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  31.4 
 
 
261 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  32.38 
 
 
257 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  32.17 
 
 
247 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  31.91 
 
 
261 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  30.83 
 
 
261 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  32.41 
 
 
261 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  29.61 
 
 
260 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  32.48 
 
 
256 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  28.81 
 
 
256 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  31.8 
 
 
240 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  30.73 
 
 
256 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  31.44 
 
 
259 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2160  flagellar biosynthesis protein FliR  34.13 
 
 
236 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  31.35 
 
 
253 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  30.73 
 
 
256 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  30.17 
 
 
260 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  30.08 
 
 
256 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  30.36 
 
 
247 aa  102  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  29.79 
 
 
260 aa  102  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  28.27 
 
 
253 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  28.81 
 
 
260 aa  102  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  29.92 
 
 
258 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  30.77 
 
 
260 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  30.77 
 
 
260 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  30.77 
 
 
260 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1632  flagellar biosynthetic protein FliR  28.69 
 
 
257 aa  100  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  31.75 
 
 
253 aa  100  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  24.18 
 
 
254 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  31.34 
 
 
265 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  28.81 
 
 
267 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  28.34 
 
 
258 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>