More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3805 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3805  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 278 aa  566  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3889  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  97.48 
 
 		 278 aa  554  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4179  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  82.31 
 
 		 282 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.968728  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  78.39 
 
 		 279 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0475  cobalt transport protein ATP-binding subunit  76.81 
 
 		 280 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.33 
 
 		 278 aa  251  1e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.34 
 
 		 281 aa  248  7e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.17 
 
 		 281 aa  247  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.79 
 
 		 278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.01 
 
 		 285 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.01 
 
 		 285 aa  238  6.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.02 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.71 
 
 		 281 aa  224  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.07 
 
 		 288 aa  219  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.32 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.6 
 
 		 281 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  40.23 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  40.23 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  42 
 
 		 281 aa  206  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 		 456 aa  202  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.9 
 
 		 403 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.74 
 
 		 277 aa  199  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.95 
 
 		 277 aa  199  6e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  41.32 
 
 		 453 aa  195  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0246  ABC transporter related  42.45 
 
 		 283 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  42.63 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 		 541 aa  193  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.26 
 
 		 283 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  41.32 
 
 		 571 aa  192  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.2 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  40.14 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  41.74 
 
 		 398 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.29 
 
 		 273 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  39.03 
 
 		 574 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  40.77 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  40.7 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  40.77 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12570  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  42.74 
 
 		 344 aa  187  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.5 
 
 		 285 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50.73 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  36.6 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.96 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.85 
 
 		 276 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.12 
 
 		 276 aa  185  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  38.66 
 
 		 263 aa  185  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.87 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  44.17 
 
 		 325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.19 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.44 
 
 		 395 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.84 
 
 		 277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  40.5 
 
 		 568 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  39.78 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.2 
 
 		 281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  40.68 
 
 		 278 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  38.13 
 
 		 380 aa  182  6e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.82 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  39.18 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.67 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  38.71 
 
 		 288 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.24 
 
 		 259 aa  179  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.21 
 
 		 440 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  35.87 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0225  ABC transporter related  41.09 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.758643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.59 
 
 		 411 aa  176  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  35.88 
 
 		 299 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  41.26 
 
 		 277 aa  175  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24070  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.91 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.850026  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2150  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.63 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1701  ABC transporter related  37.92 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0930  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.48 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.064976  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0289  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.45 
 
 		 288 aa  173  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0412656  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1419  ABC transporter related  36.3 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  40.34 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.98 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.55 
 
 		 293 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.91 
 
 		 243 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  36.54 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.13 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0171  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.82 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000671668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.26 
 
 		 270 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0317  ABC transporter related  38.55 
 
 		 283 aa  168  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000872921  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.94 
 
 		 293 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.94 
 
 		 293 aa  168  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.168047  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0161  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.18 
 
 		 293 aa  168  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  42.24 
 
 		 271 aa  168  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.94 
 
 		 293 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000645208  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  39.02 
 
 		 568 aa  168  9e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.13 
 
 		 270 aa  168  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2734  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.37 
 
 		 285 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  35.19 
 
 		 593 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.33 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0137  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.53 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.59 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.79 
 
 		 402 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.74 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.43 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.85 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl153  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.91 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  39.26 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>