More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3765 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3765  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 306 aa  620  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3849  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  96.08 
 
 		 306 aa  579  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000469993 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3284  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  47.43 
 
 		 309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3446  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.39 
 
 		 308 aa  255  6e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4109  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.09 
 
 		 310 aa  247  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0428  NifH/frxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.55 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3054  ParA family protein  44.13 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1160  putative flagellar biosynthesis protein FlhG  41.18 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1337  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.01 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299825  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0984  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.27 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.69 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0590  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.6 
 
 		 301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2156  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  41.7 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1747  hypothetical protein  37.04 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1747  hypothetical protein  37.04 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0716  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39 
 
 		 276 aa  179  7e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.47964  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2165  flagellar number regulator FleN  40.91 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2291  flagellar biosynthesis protein FlhG (flagellar number regulator)  38.74 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.5 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02871  flagellar biosynthetic protein FlhG  36.97 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0742055  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3873  flagellar synthesis regulator FleN  39.84 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45640  flagellar synthesis regulator FleN  39.84 
 
 		 280 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.555509  normal  0.237681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3031  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.31 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1382  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.92 
 
 		 303 aa  169  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0481328  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1518  flagellar biosynthetic protein FlhG  37.22 
 
 		 280 aa  168  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2806  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.67 
 
 		 276 aa  168  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.992955  normal  0.186543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1978  flagellar synthesis regulator FleN  38.67 
 
 		 274 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.231627  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3438  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.67 
 
 		 277 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.704285  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30460  flagellar number regulator; FleN  35.71 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2560  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.92 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.110554  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2910  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.92 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3052  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.92 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3668  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.28 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0704909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1453  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.92 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.92 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0524451  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1298  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.92 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.206017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1365  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.92 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.613295  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1358  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.92 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  0.103677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3911  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.28 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3211  flagellar biosynthetic protein FlhG  39.51 
 
 		 283 aa  166  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1562  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.28 
 
 		 276 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100295  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4342  flagellar number regulator FleN  38.28 
 
 		 277 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422536  normal  0.723195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1525  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.28 
 
 		 277 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.44123  normal  0.658899 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3469  flagellar synthesis regulator FleN  38.33 
 
 		 271 aa  165  8e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3050  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.37 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.905912  normal  0.0847945 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.6 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.483613  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002831  flagellar synthesis regulator FleN  38.03 
 
 		 295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000517997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1634  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.21 
 
 		 293 aa  162  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1342  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.86 
 
 		 303 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.292285  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1198  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.27 
 
 		 293 aa  162  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000520334  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1655  ParA family protein  38.38 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000026019  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03145  hypothetical protein  37.68 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2029  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.33 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1746  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.78 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1377  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.45 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0384925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.94 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3038  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.02 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2012  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.59 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1356  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.23 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2501  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.29 
 
 		 296 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.29 
 
 		 296 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000736548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 		 288 aa  158  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0487  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.19 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0706  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.09 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4042  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.02 
 
 		 294 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0651768 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1764  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.61 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0478  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.52 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0871  ParA protein  30.15 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3025  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.83 
 
 		 275 aa  152  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.30922  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1597  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.61 
 
 		 295 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2277  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.23 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2390  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.21 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3289  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.03 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.99 
 
 		 278 aa  149  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0326  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.67 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.48097  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1415  flagellar number regulator  30.43 
 
 		 280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.682888  normal  0.589632 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1313  NifH/FrxC:cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.92 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1591  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.21 
 
 		 519 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1383  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.94 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1174  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.61 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.358901  normal  0.212206 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0792  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.93 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.3085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2151  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.83 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0158  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.67 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.726569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1400  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.67 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0382  flagellar synthesis regulator FleN  35.83 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.928835  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0698  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.29 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.6397 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0651  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.15 
 
 		 268 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2685  flagellar synthesis regulator FleN  27.34 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0515842  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1863  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.76 
 
 		 295 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0949609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0179  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.11 
 
 		 287 aa  136  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000347298  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1800  flagellar synthesis regulator FleN, putative  31.84 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000162806  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2698  flagellar biosynthesis like protein  35.63 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00958  flagellar synthesis regulator FleN  36.93 
 
 		 294 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.275874  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06208  flagellar synthesis regulator FleN  36.93 
 
 		 294 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.121136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4132  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.84 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0777217  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2027  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.93 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0275  ATP-binding protein  31.42 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1928  flagellar biosynthesis switch protein  35.43 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.965527 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1300  flagellar synthesis regulator FleN, putative  31.43 
 
 		 272 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.49294  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0368  ParaA family ATPase  30.94 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>