180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3754 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3754  flagellar hook-associated protein 3  100 
 
 		 306 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3838  flagellar hook-associated protein 3  94.44 
 
 		 306 aa  552  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0146959 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3274  flagellar hook-associated protein 3  44.01 
 
 		 299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3042  flagellar hook-associated protein FlgL  37.91 
 
 		 298 aa  215  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.947446  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3456  flagellar hook-associated protein 3  40.65 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4098  flagellar hook-associated protein 3  40.39 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0439  flagellin-like  34.2 
 
 		 294 aa  162  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2242  flagellar hook-associated protein FlgL  28.53 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0452  flagellar hook-associated protein FlgL  26.21 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0603  flagellar hook-associated protein 3  29.58 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.891148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4194  flagellar hook-associated protein 3  25.38 
 
 		 327 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0096  flagellar hook-associated protein FlgL  25.24 
 
 		 309 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3227  flagellar hook-associated protein FlgL  24.12 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1674  flagellar hook-associated protein FlgL  24.07 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0249  flagellar hook-associated protein FlgL  27.18 
 
 		 296 aa  99.4  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2240  flagellar hook-associated protein 3  26.45 
 
 		 310 aa  99  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  25.32 
 
 		 305 aa  99  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1621  flagellar hook-associated protein 3  27.64 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3030  flagellar hook-associated protein FlgL  24.6 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0390  flagellar hook-associated protein 3  26.65 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133052  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0021  flagellar hook-associated protein 3  25.32 
 
 		 301 aa  89.7  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0831  flagellar hook-associated protein 3  27.01 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.795766  normal  0.995497 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0842  flagellar hook-associated protein 3  21.38 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0865  flagellar hook-associated protein 3  21.38 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3001  flagellar hook-associated protein 3  26.58 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00024747 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2235  flagellar hook-associated protein 3  23.8 
 
 		 328 aa  86.3  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208019 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  29.44 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31340  flagellar hook-associated protein 3  27.24 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0213605 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17130  flagellar hook-associated protein 3  20.82 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04919  flagellar hook-associated protein FlgL  25.96 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2358  flagellar hook-associated protein 3  26.6 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1148  flagellar hook-filament junction protein  24.92 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0990  flagellar hook-associated protein 3  25.4 
 
 		 298 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1650  flagellar hook-associated protein 3  23.64 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2562  flagellin domain protein  22.85 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0329  flagellar hook-associated protein 3  22.29 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0671  flagellar hook-associated protein 3  24.38 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0367286 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0193  flagellin-like protein  26.67 
 
 		 870 aa  77  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0770  flagellar hook-associated protein 3  24.35 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2402  flagellar hook-associated protein 3  33.09 
 
 		 594 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2421  flagellar hook-associated protein 3  31.03 
 
 		 523 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.303682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2435  flagellar hook-associated protein 3  32.41 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  28.96 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  27.93 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3151  flagellar hook-associated protein FlgL, putative  31.47 
 
 		 504 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000730  flagellar hook-associated protein FlgL  24.84 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  27.14 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  23.24 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2042  flagellar hook-associated protein 3  24.85 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.75647 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0894  lagellar hook-associated protein FlgL  27.93 
 
 		 750 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0966  lagellar hook-associated protein FlgL  27.93 
 
 		 750 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2514  flagellar hook-associated protein 3  26.06 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0170039  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2525  flagellar hook-associated protein 3  28.99 
 
 		 507 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1019  flagellar hook-associated protein 3  24.53 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0392  flagellar hook-associated protein 3  23.03 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  25.14 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2610  flagellar hook-associated protein 3  28.31 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00831645  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1031  lagellar hook-associated protein FlgL  27.37 
 
 		 750 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.143804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  27.87 
 
 		 530 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  24.13 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1766  flagellar hook-associated protein 3  26.4 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  23.9 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0683  flagellar hook-associated protein  28.33 
 
 		 947 aa  67  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  23.22 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  24.46 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  24.75 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1343  flagellar hook-associated protein FlgL  28.31 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0130628  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0307  flagellar hook-associated protein 3  29.29 
 
 		 514 aa  62.8  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  28.42 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3641  flagellin-like protein  24.07 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1597  flagellar hook-associated protein FlgL  24.46 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1352  flagellar hook-associated protein FlgL  24.01 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  22.4 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  26.09 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4781  flagellar hook-associated protein 3  25.55 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.892762  normal  0.741415 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3704  flagellar hook-associated protein 3  25.55 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.218733  normal  0.125395 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  23.93 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  24.34 
 
 		 408 aa  59.3  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  27.37 
 
 		 523 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  23.5 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  22.46 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  22.46 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0968  flagellin domain protein  24.44 
 
 		 801 aa  58.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.743409  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3458  flagellar hook-associated protein 3  23.49 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  24.18 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1787  flagellar hook-associated protein 3  22.71 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  23.5 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  23.5 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  23.5 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  22.15 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  25 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2415  flagellar hook-associated protein FlgL  20.19 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.209645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2313  flagellar hook-associated protein FlgL  20.19 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  26.09 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  22.78 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  22.78 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  22.78 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  22.78 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3470  flagellar hook-associated protein FlgL  27.93 
 
 		 530 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>