More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3748 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3833  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  91.71 
 
 		 760 aa  1155    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00358812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1450 aa  2900    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 		 1827 aa  833    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  90.41 
 
 		 688 aa  1253    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 3145 aa  637    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  40.44 
 
 		 1005 aa  624  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.57 
 
 		 1034 aa  624  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  36.64 
 
 		 1038 aa  580  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  32.72 
 
 		 1677 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3354  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 		 1212 aa  446  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  42.47 
 
 		 602 aa  356  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  41.17 
 
 		 601 aa  346  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0208  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 923 aa  340  8e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.877042 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  39.84 
 
 		 574 aa  336  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  40.72 
 
 		 577 aa  332  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  41.12 
 
 		 608 aa  328  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  37.67 
 
 		 578 aa  315  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  38.04 
 
 		 714 aa  315  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  37.52 
 
 		 637 aa  314  5.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  40.55 
 
 		 556 aa  311  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  35.08 
 
 		 615 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  35.4 
 
 		 740 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  38.03 
 
 		 714 aa  305  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 		 681 aa  305  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  36.59 
 
 		 620 aa  305  5.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2537  TPR repeat-containing protein  44.42 
 
 		 412 aa  302  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.795786  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1547  TPR domain-containing protein  41.51 
 
 		 473 aa  298  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.661842  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 620 aa  298  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  40.04 
 
 		 472 aa  295  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  38.4 
 
 		 703 aa  296  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.85 
 
 		 689 aa  295  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  37.72 
 
 		 523 aa  291  8e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 767 aa  291  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  36.23 
 
 		 648 aa  290  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 955 aa  289  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  35.26 
 
 		 653 aa  288  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  35.26 
 
 		 653 aa  288  4e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  45.6 
 
 		 529 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  32.82 
 
 		 603 aa  283  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3075  TPR repeat-containing protein  37.72 
 
 		 780 aa  281  6e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  40.43 
 
 		 542 aa  281  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  38.02 
 
 		 646 aa  278  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 		 935 aa  277  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  37.45 
 
 		 649 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  33.93 
 
 		 626 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  37.45 
 
 		 649 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 		 747 aa  274  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  37.35 
 
 		 592 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1067  TPR repeat-containing protein  37.32 
 
 		 747 aa  268  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.56 
 
 		 454 aa  268  5e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 614 aa  268  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  34.05 
 
 		 626 aa  268  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 614 aa  268  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.57 
 
 		 614 aa  265  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  35.93 
 
 		 615 aa  265  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.57 
 
 		 614 aa  265  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.57 
 
 		 614 aa  265  4.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.57 
 
 		 626 aa  265  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  36.2 
 
 		 520 aa  264  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3353  Exostosin family protein  40.45 
 
 		 872 aa  264  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0479946  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2985  sulfotransferase  38.66 
 
 		 1077 aa  263  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  34.3 
 
 		 612 aa  258  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  39.22 
 
 		 505 aa  258  8e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3164  hypothetical protein  41.19 
 
 		 387 aa  257  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  29.02 
 
 		 1764 aa  257  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 639 aa  255  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 636 aa  254  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 662 aa  253  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6627  TPR repeat-containing protein  35.02 
 
 		 611 aa  251  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0378674 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1212  hypothetical protein  43.11 
 
 		 385 aa  251  7e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0257  TPR repeat-containing protein  36.91 
 
 		 457 aa  250  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1856  hypothetical protein  40.76 
 
 		 360 aa  249  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1398  TPR repeat-containing protein  35.49 
 
 		 484 aa  247  9.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  35.15 
 
 		 546 aa  247  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  35.31 
 
 		 607 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  39.72 
 
 		 636 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1219  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.9 
 
 		 604 aa  244  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 637 aa  240  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4266  hypothetical protein  42.44 
 
 		 389 aa  239  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1060  TPR repeat-containing protein  39.56 
 
 		 558 aa  239  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.325724  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3326  TPR repeat-containing protein  34.08 
 
 		 607 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 635 aa  238  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 635 aa  238  8e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  37.02 
 
 		 503 aa  237  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 		 583 aa  235  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  31.92 
 
 		 611 aa  235  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4040  TPR domain-containing protein  36.17 
 
 		 540 aa  234  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.186285 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0141  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 438 aa  230  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00386004  normal  0.115434 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2194  TPR repeat-containing protein  37.86 
 
 		 1451 aa  229  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.496906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2058  TPR repeat-containing protein  37.86 
 
 		 1454 aa  229  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0066  TPR repeat-containing protein  35.83 
 
 		 545 aa  228  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.152932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4384  hypothetical protein  32.82 
 
 		 546 aa  226  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6628  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 588 aa  224  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587879 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2618  hypothetical protein  30.67 
 
 		 630 aa  222  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0339  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.87 
 
 		 545 aa  221  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  37.76 
 
 		 527 aa  221  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3825  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 		 559 aa  219  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  34.4 
 
 		 1073 aa  218  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1712  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 595 aa  217  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2617  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 545 aa  216  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>