12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3737 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3737  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  731    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4943  hypothetical protein  33.58 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.465908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0417  hypothetical protein  27.42 
 
 		 288 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0040  hypothetical protein  29.5 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2831  hypothetical protein  27.2 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4766  hypothetical protein  25.83 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1896  hypothetical protein  24.92 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  24.61 
 
 		 873 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4260  hypothetical protein  24.6 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.221119 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1898  hypothetical protein  23.75 
 
 		 364 aa  50.4  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.521574  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2757  hypothetical protein  20.8 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2729  lipopolysaccharide core biosynthesis domain-containing protein  27.12 
 
 		 262 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.097522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>