More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3695 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3090  DNA primase  58.97 
 
 		 587 aa  686    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  100 
 
 		 583 aa  1189    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  59.45 
 
 		 588 aa  700    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  96.74 
 
 		 582 aa  1150    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  59.42 
 
 		 587 aa  705    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  49.83 
 
 		 584 aa  550  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  46.98 
 
 		 588 aa  541  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  41.8 
 
 		 604 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  36.9 
 
 		 613 aa  360  4e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 604 aa  353  5e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  32.95 
 
 		 626 aa  345  8.999999999999999e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  41.43 
 
 		 614 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  35.04 
 
 		 599 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  43.41 
 
 		 599 aa  341  2e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  42.25 
 
 		 619 aa  335  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  34 
 
 		 593 aa  333  6e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  33.21 
 
 		 599 aa  332  9e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  40.78 
 
 		 605 aa  332  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  39.29 
 
 		 600 aa  330  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  36.16 
 
 		 601 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  39.53 
 
 		 605 aa  327  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  35.89 
 
 		 623 aa  321  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  34.91 
 
 		 571 aa  320  5e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  35.04 
 
 		 598 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  35.04 
 
 		 598 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  35.04 
 
 		 598 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  35.04 
 
 		 598 aa  319  9e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  35.04 
 
 		 598 aa  319  9e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  35.04 
 
 		 598 aa  319  9e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  39.11 
 
 		 595 aa  319  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  39.5 
 
 		 651 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  37.01 
 
 		 604 aa  318  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  37.84 
 
 		 633 aa  317  4e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  33.83 
 
 		 601 aa  317  4e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  40.76 
 
 		 660 aa  316  8e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  38.21 
 
 		 674 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  39.27 
 
 		 652 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  34.84 
 
 		 598 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  39.9 
 
 		 655 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  34.84 
 
 		 598 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  40.52 
 
 		 660 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  34.49 
 
 		 600 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  40.28 
 
 		 660 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  36.56 
 
 		 632 aa  313  5.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  40.28 
 
 		 660 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  37.8 
 
 		 660 aa  311  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  34.63 
 
 		 598 aa  310  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  33.39 
 
 		 630 aa  309  6.999999999999999e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  33.11 
 
 		 631 aa  309  8e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  38.57 
 
 		 663 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  36.76 
 
 		 636 aa  307  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  38.6 
 
 		 632 aa  306  6e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  39.05 
 
 		 623 aa  306  9.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  39.19 
 
 		 647 aa  306  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  37.68 
 
 		 595 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  39.34 
 
 		 663 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  38.29 
 
 		 638 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  37.41 
 
 		 704 aa  305  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  39.34 
 
 		 664 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  39.6 
 
 		 636 aa  304  3.0000000000000004e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0757  DNA primase  39.61 
 
 		 647 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.255391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  36.98 
 
 		 598 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  34.54 
 
 		 657 aa  302  1e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  36.21 
 
 		 660 aa  302  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  37.2 
 
 		 595 aa  301  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  32.07 
 
 		 596 aa  301  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  35.33 
 
 		 673 aa  300  6e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  33.12 
 
 		 653 aa  300  6e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  33.73 
 
 		 703 aa  299  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  36.21 
 
 		 629 aa  296  6e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  38.24 
 
 		 601 aa  296  1e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  36.36 
 
 		 616 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  34.35 
 
 		 662 aa  293  7e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  35.53 
 
 		 656 aa  292  1e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  36.92 
 
 		 658 aa  291  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  34.46 
 
 		 577 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  38.53 
 
 		 617 aa  291  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  33.95 
 
 		 544 aa  291  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  34.3 
 
 		 592 aa  291  3e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  38.04 
 
 		 656 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  39.16 
 
 		 645 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  34.25 
 
 		 578 aa  289  9e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  37.74 
 
 		 646 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  36.28 
 
 		 656 aa  289  1e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  36.72 
 
 		 640 aa  289  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  38.9 
 
 		 639 aa  289  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  37.29 
 
 		 675 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  35.5 
 
 		 634 aa  289  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  37.74 
 
 		 646 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  34.03 
 
 		 640 aa  288  2e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0014  DNA primase  32.46 
 
 		 645 aa  288  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0081672  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  35.01 
 
 		 582 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0757  DNA primase  39.25 
 
 		 617 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  34.67 
 
 		 581 aa  288  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  34.18 
 
 		 553 aa  287  2.9999999999999996e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  34.18 
 
 		 572 aa  287  4e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  33.83 
 
 		 584 aa  287  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  32.51 
 
 		 584 aa  286  5.999999999999999e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  33.89 
 
 		 584 aa  286  8e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5044  DNA primase  36.96 
 
 		 677 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764772  normal  0.79995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>