More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3637 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 		 303 aa  632  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  98.35 
 
 		 303 aa  624  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0227  ornithine carbamoyltransferase  83.11 
 
 		 305 aa  550  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  75.25 
 
 		 303 aa  501  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  75.25 
 
 		 303 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  73.6 
 
 		 303 aa  486  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  69.21 
 
 		 305 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  64.24 
 
 		 302 aa  418  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  57.57 
 
 		 315 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  59.08 
 
 		 314 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  55.81 
 
 		 307 aa  371  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  56.67 
 
 		 300 aa  363  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  53.8 
 
 		 309 aa  360  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2492  ornithine carbamoyltransferase  51.99 
 
 		 305 aa  360  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0062  ornithine carbamoyltransferase  53.64 
 
 		 312 aa  358  8e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.366315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  56.25 
 
 		 320 aa  355  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  55.45 
 
 		 313 aa  355  5.999999999999999e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3743  ornithine carbamoyltransferase  53.92 
 
 		 321 aa  355  6.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875067 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  55 
 
 		 302 aa  354  1e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0246  ornithine carbamoyltransferase  56.42 
 
 		 298 aa  353  2e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  55.45 
 
 		 355 aa  352  2.9999999999999997e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0839  ornithine carbamoyltransferase  53.8 
 
 		 303 aa  352  4e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.40698 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3512  ornithine carbamoyltransferase  52.81 
 
 		 302 aa  349  3e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.661553 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2358  ornithine carbamoyltransferase  52.81 
 
 		 303 aa  349  4e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0999  ornithine carbamoyltransferase  52.32 
 
 		 309 aa  349  4e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0647018  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0315  ornithine carbamoyltransferase  52.65 
 
 		 305 aa  347  2e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.624865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  52.3 
 
 		 309 aa  345  7e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  54.3 
 
 		 304 aa  345  8e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  53.95 
 
 		 305 aa  344  8.999999999999999e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  55 
 
 		 301 aa  344  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4527  ornithine carbamoyltransferase  54.15 
 
 		 307 aa  340  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  53.27 
 
 		 306 aa  341  1e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  53.33 
 
 		 300 aa  339  2.9999999999999998e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 		 303 aa  339  2.9999999999999998e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  53.18 
 
 		 313 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  53.49 
 
 		 303 aa  338  5e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2685  ornithine carbamoyltransferase  52.79 
 
 		 309 aa  338  8e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.570167  normal  0.0624155 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3901  ornithine carbamoyltransferase  53 
 
 		 306 aa  335  7e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4164  ornithine carbamoyltransferase  52.67 
 
 		 306 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1108  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 		 306 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  52.16 
 
 		 305 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  52.49 
 
 		 305 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 301 aa  333  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  54.33 
 
 		 304 aa  333  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0781  ornithine carbamoyltransferase  53.16 
 
 		 306 aa  332  5e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0769217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  50.98 
 
 		 304 aa  332  5e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  52.16 
 
 		 312 aa  330  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  51.82 
 
 		 312 aa  328  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  51.67 
 
 		 309 aa  326  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 304 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2532  ornithine carbamoyltransferase  53.93 
 
 		 300 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.120857  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2430  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3003  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  51.33 
 
 		 298 aa  326  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2178  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 310 aa  326  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.280829  normal  0.684526 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0323  ornithine carbamoyltransferase  52.16 
 
 		 309 aa  325  4.0000000000000003e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1120  ornithine carbamoyltransferase  52.16 
 
 		 306 aa  324  9e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1079  ornithine carbamoyltransferase  51.83 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  51.5 
 
 		 307 aa  323  2e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4333  ornithine carbamoyltransferase  52.16 
 
 		 306 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0394  ornithine carbamoyltransferase  51.48 
 
 		 312 aa  323  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  51.69 
 
 		 306 aa  322  4e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 311 aa  322  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0375  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 309 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1073  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 309 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0917  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 309 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0921  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 309 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0124  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 309 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2510  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 309 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0675  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 309 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3342  ornithine carbamoyltransferase  51.16 
 
 		 306 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0493063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5885  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 		 309 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0732  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 309 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2472  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.893068  normal  0.0170187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 306 aa  319  3e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2577  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 309 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1942  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 309 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2553  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 309 aa  319  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 308 aa  319  3.9999999999999996e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0743  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.511035 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2601  ornithine carbamoyltransferase  50.67 
 
 		 560 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.766266  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0046  ornithine carbamoyltransferase  52.36 
 
 		 300 aa  318  6e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2130  ornithine carbamoyltransferase  50.83 
 
 		 305 aa  318  6e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2675  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 308 aa  318  7e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 		 326 aa  318  7e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 306 aa  317  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1850  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 		 305 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1469  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 326 aa  317  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.808206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14030  ornithine carbamoyltransferase  50.5 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1899  ornithine carbamoyltransferase  54.04 
 
 		 300 aa  317  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2877  ornithine carbamoyltransferase  51.15 
 
 		 309 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 		 311 aa  316  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  50.33 
 
 		 306 aa  316  4e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  51 
 
 		 311 aa  316  4e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0529  ornithine carbamoyltransferase  49.33 
 
 		 309 aa  315  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2784  ornithine carbamoyltransferase  51.15 
 
 		 309 aa  316  4e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1756  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 		 323 aa  315  5e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1345  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 		 312 aa  315  8e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>