More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3629 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3734  multi-sensor signal transduction histidine kinase  94.74 
 
 
665 aa  1276    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
665 aa  1342    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0218  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.77 
 
 
695 aa  619  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.99 
 
 
710 aa  547  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.283964 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0144  sensory box histidine kinase  46.54 
 
 
709 aa  527  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0010  sensory box histidine kinase/response regulator  32.6 
 
 
727 aa  226  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
715 aa  225  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.99155  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
715 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0011  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
726 aa  213  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 
561 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.237401  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1630  sensory box histidine kinase  31.79 
 
 
710 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00580838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1945  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
690 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000961188  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2335  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
694 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1885  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
694 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2062  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
697 aa  145  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 
1064 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
641 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
620 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
639 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 
571 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  34.87 
 
 
461 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  30.9 
 
 
560 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  34.32 
 
 
461 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
639 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  34.54 
 
 
461 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
905 aa  130  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
640 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 
695 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
639 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
421 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
911 aa  128  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
608 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
880 aa  127  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
460 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
556 aa  127  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.12815  normal  0.758765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
701 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
453 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
592 aa  125  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
556 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.936608  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
489 aa  124  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
718 aa  124  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
592 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  30.42 
 
 
346 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  32.89 
 
 
464 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
519 aa  120  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
594 aa  120  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
637 aa  120  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 
725 aa  120  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
608 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
2161 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
906 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1267  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
542 aa  118  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
1039 aa  118  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
815 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
875 aa  117  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.15 
 
 
844 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  25.71 
 
 
582 aa  117  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.52 
 
 
844 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
464 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.64 
 
 
1168 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
581 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
585 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
619 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
612 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
614 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
609 aa  115  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 
823 aa  115  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.3 
 
 
1397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 
884 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
611 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1308  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
894 aa  114  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.455977  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 
763 aa  114  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
1042 aa  114  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  32.47 
 
 
1046 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
1010 aa  114  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 
933 aa  114  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
827 aa  113  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  31.11 
 
 
610 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2025  two component sensor histidine kinase  32.95 
 
 
613 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
401 aa  113  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  30.94 
 
 
613 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3217  ATP-binding region ATPase domain protein  32.73 
 
 
576 aa  113  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.644054  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
608 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  29.1 
 
 
608 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
467 aa  112  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
587 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 
853 aa  112  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 
607 aa  112  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 
587 aa  112  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
508 aa  112  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  27.61 
 
 
2051 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 
1426 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  30.36 
 
 
1119 aa  111  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0480  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.04 
 
 
577 aa  111  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.597415  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2558  histidine kinase  31.14 
 
 
397 aa  111  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  hitchhiker  0.000338162 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
612 aa  111  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
2153 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>