190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3578 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3578  acyltransferase 3  100 
 
 		 378 aa  776    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2831  acyltransferase 3  27 
 
 		 401 aa  92.8  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0149  cellulose-binding family II protein  28.35 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  27.1 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2067  acyltransferase 3  25.06 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  25.13 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  25.81 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2461  acyltransferase 3  28.7 
 
 		 437 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1143  acyltransferase 3  25.06 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.757162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  25.28 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  27.2 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5770  acyltransferase 3  32.3 
 
 		 394 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  25.64 
 
 		 656 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  25.23 
 
 		 671 aa  63.9  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0330  acyltransferase 3  24.92 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.278208 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  25.33 
 
 		 645 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0638  acyltransferase family protein  25.56 
 
 		 647 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  24.03 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  35.95 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011315  VSAL_p54_03  acyltransferase  25.08 
 
 		 642 aa  61.2  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.362945  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  23.85 
 
 		 683 aa  60.1  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3190  acyltransferase 3  33.99 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  25 
 
 		 587 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  25.85 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  24.19 
 
 		 635 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0443  acyltransferase 3  25.61 
 
 		 625 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0119902 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00411  hypothetical protein  25.35 
 
 		 622 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.258731  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0306  acyltransferase 3  22.96 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.363832  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  22.67 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  21.86 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  21.86 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  23.47 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  24.4 
 
 		 673 aa  57  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4702  acyltransferase 3  26.33 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.787426  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  23.04 
 
 		 637 aa  56.2  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  26.18 
 
 		 333 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  25.52 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  24.48 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  25.53 
 
 		 696 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  24.8 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  25.14 
 
 		 656 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  31.84 
 
 		 690 aa  55.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  25.96 
 
 		 658 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2697  acyltransferase 3  23.81 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0111732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  24.44 
 
 		 386 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  25.71 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  24.46 
 
 		 627 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  24.47 
 
 		 629 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  24.06 
 
 		 660 aa  54.3  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  31.25 
 
 		 354 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  24.14 
 
 		 660 aa  53.9  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  26.47 
 
 		 384 aa  53.9  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  23.36 
 
 		 647 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  25.15 
 
 		 642 aa  53.5  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  22.66 
 
 		 629 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2754  acyltransferase 3  30 
 
 		 362 aa  53.5  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  0.201159 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2746  acyltransferase 3  24.73 
 
 		 408 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  25.98 
 
 		 327 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  24.14 
 
 		 638 aa  52.8  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  26.23 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  22.87 
 
 		 598 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  21.19 
 
 		 339 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  24.52 
 
 		 695 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  23.54 
 
 		 607 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  26.26 
 
 		 681 aa  51.6  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1056  acyltransferase 3  28.81 
 
 		 561 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  26.38 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4010  acyltransferase 3  25.58 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.54643  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  24.73 
 
 		 684 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  23.5 
 
 		 665 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  20.57 
 
 		 393 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4615  acyltransferase 3  23.7 
 
 		 630 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0173701  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0431  acyltransferase 3  25.08 
 
 		 357 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0932564  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  31.97 
 
 		 362 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3532  acyltransferase 3  38.64 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  22.66 
 
 		 629 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  24.12 
 
 		 368 aa  50.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1161  acyltransferase 3  24.49 
 
 		 365 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  25.39 
 
 		 378 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  26.03 
 
 		 662 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  30.57 
 
 		 405 aa  50.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000035035  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0479  acyltransferase 3  24.69 
 
 		 405 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.907036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1808  acyltransferase 3  32.93 
 
 		 376 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  29.09 
 
 		 713 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3255  acyltransferase family protein  34.09 
 
 		 364 aa  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.354775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1887  acyltransferase 3  34.18 
 
 		 376 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.9 
 
 		 639 aa  50.1  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1872  acyltransferase 3  25.58 
 
 		 422 aa  49.7  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.341977  normal  0.27235 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2132  O-antigen acetylase, putative  29.69 
 
 		 760 aa  49.7  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  24.11 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3862  acyltransferase 3  30.77 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.419554 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  31.37 
 
 		 360 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  25.72 
 
 		 691 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0472  putative acyltransferase  31.98 
 
 		 702 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0751  putative lipopolysaccharide biosynthesis-related membrane protein  27.23 
 
 		 410 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1805  O-antigen acetylase  31.98 
 
 		 728 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4745  acyltransferase 3  25.7 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0151092  normal  0.0124888 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  23.15 
 
 		 635 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3527  acyltransferase 3  32.24 
 
 		 408 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2287  putative acyltransferase  27.23 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>