32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3572 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3303  hypothetical protein  75.44 
 
 		 448 aa  717    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.877956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3572  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  922    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.544352  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1428  hypothetical protein  65.85 
 
 		 441 aa  596  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2826  hypothetical protein  66.15 
 
 		 441 aa  594  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3299  hypothetical protein  61.57 
 
 		 448 aa  565  1e-160  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2148  hypothetical protein  61.01 
 
 		 447 aa  554  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0946706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5280  hypothetical protein  39.71 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2599  hypothetical protein  37.82 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.444399  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0557  hypothetical protein  25 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2049  hypothetical protein  32.37 
 
 		 455 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.717116 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1630  hypothetical protein  23.14 
 
 		 450 aa  57  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1456  hypothetical protein  23.92 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1859  hypothetical protein  29.55 
 
 		 393 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1780  hypothetical protein  29.55 
 
 		 393 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0604  hypothetical protein  28.43 
 
 		 468 aa  53.5  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0671  hypothetical protein  25.97 
 
 		 444 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0035  hypothetical protein  24.63 
 
 		 425 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0051  hypothetical protein  24.1 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2098  hypothetical protein  28.17 
 
 		 393 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268023  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1995  hypothetical protein  28.99 
 
 		 572 aa  50.1  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.290719  normal  0.0311795 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1730  hypothetical protein  31.2 
 
 		 365 aa  48.5  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3753  hypothetical protein  29.33 
 
 		 344 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.30057 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1498  hypothetical protein  28.57 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0114368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0039  hypothetical protein  24.34 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3973  putative secreted protein  28.92 
 
 		 475 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2624  hypothetical protein  28.41 
 
 		 470 aa  44.7  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.573828  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0510  secreted porin family protein  32.26 
 
 		 400 aa  44.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.938246  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1530  porin  26.28 
 
 		 380 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.232384  normal  0.862821 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3415  hypothetical protein  27.87 
 
 		 549 aa  43.9  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1077  hypothetical protein  29.27 
 
 		 551 aa  43.9  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.350555 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2395  porin  31.03 
 
 		 477 aa  43.1  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  0.306848 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2501  hypothetical protein  28.27 
 
 		 408 aa  43.1  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>