More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3437 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  100 
 
 		 258 aa  520  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  94.47 
 
 		 266 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  64.68 
 
 		 256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  60.17 
 
 		 255 aa  290  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  61.3 
 
 		 258 aa  289  4e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  53.85 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  53.62 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  43.88 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 260 aa  178  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  38.98 
 
 		 251 aa  161  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  35.74 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  34.31 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  35.32 
 
 		 249 aa  155  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  34.04 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  34.47 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  37.8 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  32.92 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  34.45 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  34.04 
 
 		 241 aa  141  9e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  36.82 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  34.91 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  34.04 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  35.98 
 
 		 249 aa  129  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  31.22 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  31.49 
 
 		 241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  31.33 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  31.33 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  32.47 
 
 		 237 aa  125  7e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  30.9 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  30.9 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  30.9 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  30.25 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  30.9 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  30.9 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  30.9 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  30.47 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  30.47 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  31.91 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  27.62 
 
 		 240 aa  122  8e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  28.75 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  36.41 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  29.67 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  32.34 
 
 		 249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  28.94 
 
 		 241 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  28.94 
 
 		 241 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  26.81 
 
 		 330 aa  116  3.9999999999999997e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  29.61 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  30.7 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  28.17 
 
 		 228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  27.35 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  29.49 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  32.73 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  28.37 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  35.17 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  28.85 
 
 		 233 aa  102  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  28.85 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  28.07 
 
 		 231 aa  101  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  28.37 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  32.89 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  33.63 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  28.74 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  26.5 
 
 		 338 aa  99  7e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  28.87 
 
 		 250 aa  99  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  27.23 
 
 		 233 aa  98.6  9e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  32.29 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  25.76 
 
 		 237 aa  97.8  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  25.43 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  28.69 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  28.87 
 
 		 250 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  34.3 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  28.63 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  29.57 
 
 		 262 aa  97.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  30.17 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  28.21 
 
 		 232 aa  94.4  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  29.67 
 
 		 222 aa  92.4  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  28.03 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  34.5 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1759  hypothetical protein  26.75 
 
 		 398 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  30.96 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  28.95 
 
 		 260 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  22.01 
 
 		 262 aa  85.9  5e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  29.32 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  28.91 
 
 		 259 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  30.6 
 
 		 288 aa  82  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  23.39 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  23.04 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  29.69 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  29.55 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  34.48 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  27.31 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2590  methyltransferase small  30.43 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.31 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  27.31 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  27.31 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  27.31 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  27.31 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  28.75 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  27.31 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  27.31 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  29.08 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>