More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3431 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 88 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 88 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  87.5 
 
 		 88 aa  161  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  78.41 
 
 		 88 aa  150  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  85.37 
 
 		 95 aa  150  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  78.05 
 
 		 85 aa  135  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  68.67 
 
 		 86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  71.26 
 
 		 87 aa  124  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  61.45 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  60.24 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  56.63 
 
 		 88 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  60.24 
 
 		 90 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  56.63 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  54.12 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  55.42 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  57.83 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  58.54 
 
 		 85 aa  103  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  55.42 
 
 		 90 aa  103  8e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  62.67 
 
 		 81 aa  103  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  60.76 
 
 		 81 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  60.49 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  53.01 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  54.22 
 
 		 88 aa  102  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 81 aa  101  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  57.32 
 
 		 204 aa  99.8  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  59.49 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  53.01 
 
 		 93 aa  99.8  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  53.01 
 
 		 91 aa  99.4  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  53.01 
 
 		 92 aa  99.4  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  62.03 
 
 		 82 aa  98.2  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  56.96 
 
 		 197 aa  97.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  53.16 
 
 		 191 aa  97.8  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  53.01 
 
 		 96 aa  97.8  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0109  30S ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 119 aa  97.4  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  57.89 
 
 		 81 aa  97.4  6e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  54.76 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  54.76 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  50.6 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  48.15 
 
 		 111 aa  96.3  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  55.29 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2540  ribosomal protein S16  51.81 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  54.12 
 
 		 86 aa  95.5  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  51.81 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 192 aa  95.1  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 188 aa  94.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  54.12 
 
 		 119 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  55.56 
 
 		 81 aa  94.4  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  53.57 
 
 		 91 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 82 aa  94  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  47.62 
 
 		 174 aa  94  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  54.12 
 
 		 120 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  50.6 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1167  ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 120 aa  92  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  54.12 
 
 		 120 aa  92  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 81 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 81 aa  91.7  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  51.76 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  51.76 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1945  30S ribosomal protein S16  50.6 
 
 		 168 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.917027 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2011  30S ribosomal protein S16  50.6 
 
 		 168 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32221 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  49.4 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1965  30S ribosomal protein S16  50.6 
 
 		 210 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257102  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3136  ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0537506  normal  0.10713 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0326  ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 156 aa  90.1  8e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.679786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2187  30S ribosomal protein S16  50.6 
 
 		 158 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0623355  normal  0.816199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5926  ribosomal protein S16  45.78 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277333  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23750  SSU ribosomal protein S16P  48.19 
 
 		 149 aa  89.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 86 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 81 aa  89.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4175  30S ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 170 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1470  ribosomal protein S16  48.19 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.935451  normal  0.120504 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1194  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 158 aa  89.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.282957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2083  ribosomal protein S16  48.19 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 86 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  47.56 
 
 		 82 aa  89.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  46.99 
 
 		 146 aa  88.6  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  51.76 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  48.24 
 
 		 201 aa  88.6  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0271  ribosomal protein S16  50 
 
 		 80 aa  88.6  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000138146  normal  0.906741 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1827  ribosomal protein S16  48.19 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2982  30S ribosomal protein S16  51.76 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.117081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>