201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3325 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3325  Rubrerythrin  100 
 
 		 166 aa  337  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.939225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0921  Rubrerythrin  98.18 
 
 		 166 aa  331  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4255200000000004e-33 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0668  rubrerythrin  78.79 
 
 		 166 aa  270  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.807065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  66.67 
 
 		 166 aa  229  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0955  Rubrerythrin  67.47 
 
 		 166 aa  228  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  66.06 
 
 		 166 aa  221  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  59.26 
 
 		 166 aa  192  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  55.76 
 
 		 165 aa  186  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  57.23 
 
 		 166 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  56.63 
 
 		 166 aa  184  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1755  Rubrerythrin  56.63 
 
 		 166 aa  184  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368043  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  54.82 
 
 		 166 aa  181  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2474  Rubrerythrin  58.9 
 
 		 164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  53.94 
 
 		 165 aa  180  7e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  53.94 
 
 		 165 aa  180  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  60.13 
 
 		 165 aa  177  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  57.67 
 
 		 168 aa  177  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  58.82 
 
 		 168 aa  175  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  55.21 
 
 		 168 aa  174  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2612  rubrerythrin/rubredoxin protein, putative  61.33 
 
 		 168 aa  173  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  55.13 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  57.52 
 
 		 164 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3175  Rubrerythrin  58.82 
 
 		 164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.738943 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2740  rubrerythrin  52.47 
 
 		 173 aa  170  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  54.49 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2468  rubrerythrin  53.61 
 
 		 163 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0301  Rubrerythrin  52.9 
 
 		 166 aa  168  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.497237 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0940  rubrerythrin  59.48 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.828203  normal  0.659027 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0168  rubrerythrin  52.73 
 
 		 166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.364022  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  53.21 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1044  rubrerythrin  58.02 
 
 		 163 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  50.6 
 
 		 166 aa  161  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2295  Rubrerythrin  51.25 
 
 		 164 aa  160  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460498  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  53.61 
 
 		 165 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  52.41 
 
 		 172 aa  160  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3532  Rubrerythrin  55.48 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0897  Rubrerythrin  55.56 
 
 		 167 aa  157  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000170126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0084  rubrerythrin  62.75 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  47.88 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  51.9 
 
 		 166 aa  154  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0583  rubrerythrin  47.59 
 
 		 166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0179451  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0818  Rubrerythrin  48.8 
 
 		 166 aa  152  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0782088  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0444  rubrerythrin  43.83 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0467  rubrerythrin  47.2 
 
 		 167 aa  147  8e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000249666  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0739  rubrerythrin  48.47 
 
 		 165 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.491784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  42.86 
 
 		 182 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  43.48 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0274  rubrerythrin  47.47 
 
 		 170 aa  142  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207736  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0272  rubrerythrin  47.47 
 
 		 170 aa  142  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00220847  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  44.07 
 
 		 182 aa  141  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  44.44 
 
 		 168 aa  140  7e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  40.8 
 
 		 185 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  42.05 
 
 		 185 aa  138  3e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0418  Rubrerythrin  38.37 
 
 		 184 aa  136  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1771  rubrerythrin  41.95 
 
 		 184 aa  136  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0654519  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0111  hypothetical protein  44.24 
 
 		 168 aa  136  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.149828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1650  Rubrerythrin  42.24 
 
 		 170 aa  134  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.438503  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0631  rubrerythrin  41.36 
 
 		 169 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2369  Rubrerythrin  37.93 
 
 		 182 aa  128  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3121  rubrerythrin  38.51 
 
 		 184 aa  128  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00426378  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0112  hypothetical protein  41.21 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0127739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2736  rubrerythrin  37.85 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.542692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4631  Rubrerythrin  38.73 
 
 		 228 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000498251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  45.45 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  39.63 
 
 		 178 aa  103  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  37.58 
 
 		 178 aa  103  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  39.63 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  37.58 
 
 		 221 aa  99  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  38.18 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  37.42 
 
 		 392 aa  98.6  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0865  Rubrerythrin  39.66 
 
 		 182 aa  98.2  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.41243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  36.53 
 
 		 179 aa  96.7  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  43.08 
 
 		 146 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2375  rubrerythrin  44.62 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580283  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  43.08 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  36.75 
 
 		 233 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  35.47 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2098  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  45.38 
 
 		 168 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  38.18 
 
 		 177 aa  96.3  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  42.31 
 
 		 146 aa  95.5  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3638  rubrerythrin  44.62 
 
 		 140 aa  95.5  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000037438 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  35.47 
 
 		 179 aa  95.5  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3716  rubrerythrin  43.75 
 
 		 140 aa  94.4  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344603  normal  0.13516 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2183  rubrerythrin  40 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000223416  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  36.53 
 
 		 179 aa  91.7  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  43.08 
 
 		 139 aa  91.7  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2281  rubrerythrin  41.54 
 
 		 140 aa  90.5  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.146711 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1106  putative oxidative stress related rubrerythrin protein  42.31 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00173749  normal  0.749312 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  35.54 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  44.09 
 
 		 139 aa  90.5  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0924  rubrerythrin  40.94 
 
 		 140 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  41.73 
 
 		 139 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4548  rubrerythrin  41.54 
 
 		 140 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.565518  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4116  rubrerythrin  41.54 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3718  rubrerythrin  41.54 
 
 		 140 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.338821 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3709  rubrerythrin  41.54 
 
 		 140 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5541  rubrerythrin  41.54 
 
 		 140 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.334628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3815  rubrerythrin  41.54 
 
 		 140 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.293972 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2629  putative rubrerythrin  40.94 
 
 		 140 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0300  rubrerythrin  40.94 
 
 		 140 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.895239  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>