34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3294 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  401  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  86.75 
 
 
195 aa  259  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  36.84 
 
 
188 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  40.98 
 
 
213 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  40 
 
 
288 aa  98.2  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  48.98 
 
 
173 aa  97.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000963449  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  34.83 
 
 
265 aa  94.4  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  51.06 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  39.47 
 
 
145 aa  93.2  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  48.39 
 
 
183 aa  89.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.4783800000000001e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  33.51 
 
 
184 aa  90.5  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  35.14 
 
 
353 aa  88.6  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1180  hypothetical protein  40.85 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  31.22 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3095  hypothetical protein  35.79 
 
 
214 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  36.11 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1040  hypothetical protein  43.02 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194155  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  33.16 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3170  hypothetical protein  41.51 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1035  hypothetical protein  43.75 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1092  hypothetical protein  39.62 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  33.1 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000542792  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0782  hypothetical protein  43.1 
 
 
177 aa  72  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.674637  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0131  hypothetical protein  47.83 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1038  hypothetical protein  34.45 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  31.87 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1095  hypothetical protein  31.97 
 
 
171 aa  67  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000152193  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  32.65 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  29.49 
 
 
165 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1497  hypothetical protein  30.05 
 
 
170 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.844823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  28.85 
 
 
165 aa  62.8  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3436  hypothetical protein  30.49 
 
 
283 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1053  hypothetical protein  28 
 
 
192 aa  42.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.308187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0935  hypothetical protein  28 
 
 
192 aa  42.4  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.879201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>