More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3240 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3240  MgtE intracellular region  100 
 
 
433 aa  873    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2041  MgtE intracellular region  60.92 
 
 
426 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1158  MgtE intracellular region  51.21 
 
 
420 aa  430  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1738  MgtE intracellular region  38.98 
 
 
430 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0656  MgtE intracellular region  37.53 
 
 
417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000076098  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0076  MgtE intracellular region  35.85 
 
 
459 aa  254  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2338  MgtE intracellular region  32.78 
 
 
421 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1530  CBS domain-containing protein  29.36 
 
 
423 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000568419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1323  CBS domain-containing protein  29.12 
 
 
423 aa  223  8e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0069  MgtE intracellular region  32.35 
 
 
625 aa  218  2e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2656  Mg/Co/Ni transporter MgtE  36.45 
 
 
412 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2396  CBS domain-containing protein  30.17 
 
 
425 aa  189  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  39.82 
 
 
450 aa  172  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1436  MgtE intracellular region  28.4 
 
 
425 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00000684076  decreased coverage  0.0000760195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  36.21 
 
 
451 aa  170  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0092  MgtE intracellular region  27.6 
 
 
425 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0286357 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  36.44 
 
 
442 aa  156  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  35.19 
 
 
452 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  36.29 
 
 
453 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  36.65 
 
 
460 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  36.25 
 
 
449 aa  154  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0701  MgtE intracellular region  26.99 
 
 
431 aa  153  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1125  magnesium transporter  36 
 
 
444 aa  149  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2510  MgtE intracellular region  27.55 
 
 
427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104929 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2483  MgtE intracellular region  28.64 
 
 
435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0317832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  32.76 
 
 
463 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2790  MgtE intracellular region  27.42 
 
 
427 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045049  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1818  MgtE intracellular region  28.22 
 
 
429 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.705628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27830  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  26.65 
 
 
427 aa  144  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.885994 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  32.27 
 
 
461 aa  143  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  34.68 
 
 
463 aa  144  5e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19370  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  25.71 
 
 
440 aa  143  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503098  normal  0.0197915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1864  MgtE intracellular region  27.27 
 
 
438 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1190  MgtE intracellular region  26.67 
 
 
445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.067335  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  32.74 
 
 
449 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0122  MgtE intracellular region  28.57 
 
 
454 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2430  divalent cation transporter  32.76 
 
 
466 aa  140  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0143004 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  34.23 
 
 
542 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1447  MgtE intracellular region  28.12 
 
 
424 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.202567  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  37.08 
 
 
461 aa  139  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1172  divalent cation transporter  32.77 
 
 
450 aa  139  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000987618  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0901  MgtE intracellular region  31.78 
 
 
474 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.885625  normal  0.115332 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15330  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  27.54 
 
 
422 aa  139  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.346083  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11290  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  35.5 
 
 
453 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.371515  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2208  MgtE intracellular region  27.64 
 
 
432 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  31.03 
 
 
462 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  31.03 
 
 
462 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0092  magnesium transporter  32.44 
 
 
486 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2114  magnesium transporter  33.77 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1722  magnesium transporter  31.84 
 
 
462 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  31.22 
 
 
451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20831  Mg2+ transporter  31.25 
 
 
469 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  37.85 
 
 
461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  37.85 
 
 
461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1208  Mg2+ transporter  31.25 
 
 
469 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0681  transcriptional regulator  36.72 
 
 
454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1158  MgtE intracellular region  26.62 
 
 
435 aa  133  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03669  hypothetical protein  33.77 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0766  MgtE intracellular region  28.1 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  35.11 
 
 
454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0523  magnesium transporter  37.38 
 
 
467 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.461011 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0138  divalent cation transporter  32.89 
 
 
486 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3817  MgtE intracellular region  24.76 
 
 
447 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446632  normal  0.333957 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01631  Mg2+ transporter  32.44 
 
 
473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1354  magnesium transporter  39.37 
 
 
456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0828283  normal  0.438937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  33.33 
 
 
454 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4001  MgtE intracellular region  25.52 
 
 
431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114119  normal  0.413173 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4061  MgtE intracellular region  25.52 
 
 
431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803121  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1134  MgtE intracellular region  25.76 
 
 
412 aa  130  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8408  MgtE intracellular region  26.91 
 
 
426 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.879169  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  30.6 
 
 
446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002398  magnesium transporter  32.46 
 
 
452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4488  MgtE intracellular region  27.08 
 
 
431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.837041  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2282  magnesium transporter  36.11 
 
 
453 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0198685  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1681  MgtE intracellular region  25.65 
 
 
431 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106965  normal  0.399701 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3987  MgtE intracellular region  26.02 
 
 
417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576405  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  29.31 
 
 
468 aa  127  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1703  magnesium transporter  30.67 
 
 
445 aa  126  7e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18221  Mg2+ transporter  29.26 
 
 
468 aa  126  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0471  magnesium transporter  30 
 
 
482 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.963916 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  30.64 
 
 
453 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0664  MgtE intracellular region  25.58 
 
 
427 aa  126  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.108649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0802  MgtE intracellular region  25.77 
 
 
416 aa  126  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1723  Mg2+ transporter  29.26 
 
 
468 aa  126  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.20289  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3016  magnesium transporter  30.87 
 
 
443 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000242012  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  30.6 
 
 
460 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  30.6 
 
 
446 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  28.87 
 
 
449 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0725  magnesium transporter  32.58 
 
 
484 aa  124  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0267  magnesium transporter  31.12 
 
 
456 aa  124  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000106938  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3009  MgtE intracellular region  26.35 
 
 
402 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.315291  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18401  Mg2+ transporter  28.82 
 
 
468 aa  124  5e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.297681  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18191  Mg2+ transporter  28.82 
 
 
469 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0134  magnesium transporter  33.33 
 
 
450 aa  123  7e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.149732 
 
 
-
 
NC_002620  TC0466  magnesium transporter  31.33 
 
 
490 aa  123  8e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2913  MgtE intracellular region  24.29 
 
 
430 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.553029  normal  0.0535058 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  31.11 
 
 
451 aa  122  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17571  Mg2+ transporter  29.91 
 
 
471 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.161452  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  31.56 
 
 
458 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0475  MgtE intracellular region  25.52 
 
 
413 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>