182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3238 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 		 187 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  91.26 
 
 		 186 aa  345  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  74.05 
 
 		 193 aa  289  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  72.43 
 
 		 193 aa  283  8e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  69.95 
 
 		 186 aa  275  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  48.91 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  50.27 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  47.03 
 
 		 180 aa  162  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  46.96 
 
 		 182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  44.75 
 
 		 183 aa  154  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  45.6 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  46.2 
 
 		 177 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  46.2 
 
 		 177 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.7 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  45.57 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  43.04 
 
 		 173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  43.04 
 
 		 173 aa  128  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  41.01 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3842  bifunctional deaminase-reductase-like protein  48.73 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.21 
 
 		 181 aa  121  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25060  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  35.36 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.43 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  35.14 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  33.68 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  31.82 
 
 		 173 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.16 
 
 		 177 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  36.61 
 
 		 175 aa  88.6  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  32.2 
 
 		 173 aa  87.8  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  32.2 
 
 		 173 aa  87.8  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.3 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  32.2 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  31.64 
 
 		 173 aa  86.3  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  29.94 
 
 		 173 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.43 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.64 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  30.9 
 
 		 172 aa  85.5  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  31.07 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.07 
 
 		 174 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  31.07 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  36.56 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  28.9 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  29.94 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  35.08 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  30.86 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.84 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.95 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.7 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  32.48 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  30.73 
 
 		 390 aa  75.9  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  32.95 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  27.68 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1910  bifunctional deaminase-reductase, C-terminal  31.22 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  28.57 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  30.77 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5103  putative deaminase-reductase  32.98 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.196421  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  32.97 
 
 		 173 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5750  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.07 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  28.18 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  28.18 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.29 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1096  hypothetical protein  30.57 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.674946  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.17 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.98 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  27.81 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.25 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  31.79 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5086  bifunctional deaminase-reductase-like  28.18 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2144  deaminase-reductase domain-containing protein  28.34 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.542593 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3865  deaminase-reductase domain-containing protein  29.26 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0465  deaminase-reductase domain-containing protein  30.16 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0776  deaminase-reductase domain-containing protein  28.66 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00139517  hitchhiker  0.000808323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0531  deaminase-reductase domain-containing protein  28.27 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0474  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.26 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.11 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0449  deaminase-reductase domain-containing protein  28.19 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.66 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  27.51 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  25.91 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  26.18 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  25.42 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  27.85 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  26.18 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5799  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  26.98 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00712237  normal  0.320855 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.9 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  26.92 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.15 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  29.66 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  26.7 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.93 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3715  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.5 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.82 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.82 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  27.66 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  30.65 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.57 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.99 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>