242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3214 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3214  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  580  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1049  hypothetical protein  96.92 
 
 		 292 aa  540  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3163  hypothetical protein  62.12 
 
 		 292 aa  352  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0449219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2328  hypothetical protein  60.2 
 
 		 292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0372766  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  56.66 
 
 		 292 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2402  hypothetical protein  51.54 
 
 		 293 aa  298  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0682346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2287  hypothetical protein  55.07 
 
 		 291 aa  298  7e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1284  hypothetical protein  46.76 
 
 		 292 aa  251  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00734721  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  43.96 
 
 		 294 aa  246  4e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  43.54 
 
 		 292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1793  hypothetical protein  42.76 
 
 		 293 aa  235  6e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1599  hypothetical protein  46.76 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000017463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  39.53 
 
 		 293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  45.21 
 
 		 291 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2320  hypothetical protein  41.16 
 
 		 292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000274769  hitchhiker  0.00243432 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  39.33 
 
 		 294 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  44.48 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  39 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  44.15 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  40.48 
 
 		 291 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  40.48 
 
 		 291 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  40.48 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  40.48 
 
 		 291 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  40.48 
 
 		 291 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  40.14 
 
 		 291 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  40.14 
 
 		 291 aa  209  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  40.14 
 
 		 291 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  40.14 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  39.32 
 
 		 291 aa  208  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  40.48 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3896  hypothetical protein  41.72 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000579804  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  42.03 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  44.86 
 
 		 291 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0838  YicC domain protein  41.92 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  39 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1056  hypothetical protein  39.66 
 
 		 291 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000165495  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  40.27 
 
 		 292 aa  198  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  38.72 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1239  hypothetical protein  37.88 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.369152  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  37.54 
 
 		 290 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1912  hypothetical protein  39.39 
 
 		 294 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0397702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1946  hypothetical protein  39.46 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2051  YicC domain protein  38.38 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.974794  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1488  domain of unknown function DUF1732  37.54 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.283341 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1457  hypothetical protein  37.25 
 
 		 295 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0374  hypothetical protein  37.16 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00280201  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0305  hypothetical protein  36.27 
 
 		 295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000735483  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  37.07 
 
 		 288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0372  hypothetical protein  35.96 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.816164  normal  0.284607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0676  hypothetical protein  36.99 
 
 		 291 aa  162  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0741  hypothetical protein  36.77 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2690  hypothetical protein  37.12 
 
 		 290 aa  162  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1327  protein of unknown function DUF1732  31.74 
 
 		 291 aa  162  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0133754  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1774  hypothetical protein  36.58 
 
 		 295 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.593354  normal  0.167904 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0403  hypothetical protein  36.58 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0196247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0296  hypothetical protein  36.03 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1086  hypothetical protein  32.19 
 
 		 288 aa  158  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0783  domain of unknown function DUF1732  34.1 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000478658  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  36.18 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  37.84 
 
 		 287 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  34.69 
 
 		 287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5843  domain of unknown function DUF1732  36.59 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0407  hypothetical protein  35.22 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.122152  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  35.49 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1316  domain of unknown function DUF1732  35.96 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  33.22 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2900  hypothetical protein  32.67 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  34.81 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  34.8 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4196  hypothetical protein  33.9 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0846841  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1988  hypothetical protein  32.66 
 
 		 288 aa  149  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  35.15 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  35.15 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0377  hypothetical protein  34.47 
 
 		 287 aa  149  7e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000623436 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  33.9 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  34.47 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1448  hypothetical protein  35.57 
 
 		 302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0364721  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0417  hypothetical protein  31.97 
 
 		 295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1293  hypothetical protein  33.78 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  34.81 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  34.81 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  34.81 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  35.49 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  37.29 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  35.49 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  37.29 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  33.89 
 
 		 287 aa  146  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00647  hypothetical protein  33.45 
 
 		 288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4257  hypothetical protein  34.81 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  35.15 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  36.95 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0208  hypothetical protein  35.71 
 
 		 287 aa  145  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  36.27 
 
 		 287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  35.15 
 
 		 287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  35.47 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1404  hypothetical protein  33.11 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001828  protein YicC  33.79 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  35.59 
 
 		 287 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2055  hypothetical protein  31.51 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000329302  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  35.93 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>