More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3096 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  78.97 
 
 		 413 aa  674    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  79.61 
 
 		 413 aa  683    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  77.59 
 
 		 415 aa  681    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 416 aa  859    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  96.15 
 
 		 416 aa  830    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  70.9 
 
 		 414 aa  616  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  66.91 
 
 		 419 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  61.82 
 
 		 419 aa  546  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 419 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 		 421 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 		 424 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 419 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 423 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 417 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 426 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 		 417 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 419 aa  421  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 421 aa  422  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 420 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 		 419 aa  413  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 418 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  49.62 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 415 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 414 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 414 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  47.41 
 
 		 423 aa  395  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 420 aa  391  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 420 aa  391  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 		 421 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 414 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 419 aa  384  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 421 aa  383  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0581  histidyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000550057  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0009  histidyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 416 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0511453  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 420 aa  381  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 425 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 426 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 426 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 423 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 426 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 423 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 406 aa  372  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 423 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 423 aa  375  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 446 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 446 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 446 aa  368  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 429 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 446 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  46 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  45.74 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 446 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 446 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 446 aa  368  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0006  histidyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 		 418 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 446 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  43.73 
 
 		 411 aa  366  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 429 aa  364  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 424 aa  365  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 423 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 429 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 415 aa  363  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>