More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3071 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3071  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 144 aa  297  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1190  thioesterase superfamily protein  99.31 
 
 		 144 aa  295  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  50.78 
 
 		 157 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0769  thioesterase superfamily protein  52.89 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 		 176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  40.6 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  42.22 
 
 		 164 aa  107  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3174  thioesterase superfamily protein  40.44 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  36.81 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  37.12 
 
 		 178 aa  103  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  39.06 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  40.46 
 
 		 168 aa  97.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 167 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 167 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  37.04 
 
 		 180 aa  96.3  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  38.97 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  35.66 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  40.83 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  39.44 
 
 		 176 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  35.97 
 
 		 161 aa  94.4  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  37.06 
 
 		 161 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 		 161 aa  94  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.84 
 
 		 159 aa  93.6  8e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 		 167 aa  93.6  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  39.01 
 
 		 185 aa  93.6  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2645  thioesterase superfamily protein  39.82 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  37.76 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  43.7 
 
 		 188 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  39.64 
 
 		 175 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3513  thioesterase superfamily protein  42.48 
 
 		 143 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0813515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 		 182 aa  91.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2501  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  38.93 
 
 		 161 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 160 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  36 
 
 		 174 aa  91.3  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 		 166 aa  90.9  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 		 166 aa  90.9  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  36.96 
 
 		 161 aa  90.5  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  38.58 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1458  thioesterase superfamily protein  38.66 
 
 		 170 aa  89.7  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.110696  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2553  thioesterase superfamily protein  37.6 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.28298  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2720  thioesterase superfamily protein  39.47 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.779234  hitchhiker  0.00145511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2647  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.5 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  34.81 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 		 185 aa  89  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1589  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.043779  normal  0.0906316 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1664  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.159688  unclonable  0.0000126289 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2304  thioesterase superfamily protein  39.09 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1733  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00331681  normal  0.113032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2075  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  35.66 
 
 		 168 aa  88.2  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1033  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2605  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 		 154 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390891  hitchhiker  0.00248931 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 		 171 aa  87.8  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.49 
 
 		 170 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2492  thioesterase superfamily protein  38.05 
 
 		 154 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2485  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 		 154 aa  87.8  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1859  thioesterase superfamily protein  38.05 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0277741  decreased coverage  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5105  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  36.49 
 
 		 170 aa  87.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.441022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  35.62 
 
 		 170 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5278  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.49 
 
 		 170 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5122  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  36.49 
 
 		 170 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000417727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5675  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.49 
 
 		 170 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  35.62 
 
 		 170 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  35.62 
 
 		 170 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  39.23 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5521  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  36.49 
 
 		 170 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  35.81 
 
 		 170 aa  87  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  37.68 
 
 		 173 aa  87  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  33.33 
 
 		 170 aa  87  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2107  thioesterase superfamily protein  35.94 
 
 		 149 aa  86.7  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  34.35 
 
 		 166 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  32.35 
 
 		 176 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  32.35 
 
 		 176 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  34.68 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  36.15 
 
 		 166 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  36.11 
 
 		 167 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  39.64 
 
 		 173 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 167 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2246  thioesterase superfamily protein  38.05 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.9 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.9 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  37.9 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  37.9 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2813  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 		 180 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.9 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2218  putative Acyl-CoA thioester hydrolase  42.86 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1868  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000872149  hitchhiker  0.0000925313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.9 
 
 		 168 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  35.81 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0857  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.424877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2910  thioesterase superfamily protein  35.61 
 
 		 165 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0240786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  37.9 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1719  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 		 263 aa  85.1  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  38.19 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>