More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3051 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 947 aa  1935    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  88.15 
 
 		 962 aa  1629    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.52 
 
 		 604 aa  430  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  47.02 
 
 		 589 aa  349  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 		 1287 aa  348  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  47.07 
 
 		 982 aa  336  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.7 
 
 		 896 aa  332  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.59 
 
 		 785 aa  330  9e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  41.7 
 
 		 968 aa  329  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.5 
 
 		 667 aa  328  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.91 
 
 		 902 aa  325  3e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  47.35 
 
 		 578 aa  324  6e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  43.67 
 
 		 882 aa  323  8e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.21 
 
 		 1433 aa  323  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2811  PAS  44.61 
 
 		 1023 aa  323  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0211559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  47.48 
 
 		 588 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  44.55 
 
 		 661 aa  321  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 701 aa  320  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.34 
 
 		 965 aa  320  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  42.75 
 
 		 853 aa  319  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.54 
 
 		 973 aa  317  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.22 
 
 		 995 aa  317  5e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.29 
 
 		 882 aa  317  6e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.48 
 
 		 817 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.36 
 
 		 764 aa  316  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.62 
 
 		 662 aa  316  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0232  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  45.64 
 
 		 738 aa  314  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.35 
 
 		 767 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.37 
 
 		 765 aa  314  3.9999999999999997e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 		 974 aa  314  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 1791 aa  314  5.999999999999999e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 		 1135 aa  313  9e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  43.1 
 
 		 544 aa  313  9e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.07 
 
 		 1313 aa  313  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 		 1195 aa  312  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  45.72 
 
 		 620 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.85 
 
 		 969 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.15 
 
 		 874 aa  308  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 		 1287 aa  308  4.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  41.45 
 
 		 787 aa  308  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  41.54 
 
 		 758 aa  307  8.000000000000001e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.36 
 
 		 653 aa  306  9.000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  44.42 
 
 		 1028 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.62 
 
 		 724 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 		 1550 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.28 
 
 		 1127 aa  306  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  42.19 
 
 		 659 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.33 
 
 		 781 aa  304  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  43.69 
 
 		 606 aa  304  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  44.16 
 
 		 735 aa  303  8.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 		 940 aa  303  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.92 
 
 		 1199 aa  303  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0854  ATP-binding region ATPase domain protein  34.36 
 
 		 1871 aa  302  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  42.53 
 
 		 1193 aa  302  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  43.98 
 
 		 1560 aa  302  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.32 
 
 		 846 aa  302  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.79 
 
 		 1442 aa  302  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  39.82 
 
 		 671 aa  301  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1369 aa  301  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.95 
 
 		 1222 aa  301  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.13 
 
 		 763 aa  301  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.31 
 
 		 1452 aa  301  5e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.99 
 
 		 1229 aa  300  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.03 
 
 		 1055 aa  301  6e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.2 
 
 		 916 aa  300  6e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.93 
 
 		 606 aa  300  7e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.79 
 
 		 1358 aa  300  7e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1614  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.58 
 
 		 873 aa  300  8e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.499982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0688  histidine kinase  39.75 
 
 		 691 aa  300  8e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1822  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  43.67 
 
 		 582 aa  299  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.146561 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 		 932 aa  299  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4715  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.24 
 
 		 1350 aa  300  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.726459  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 		 1965 aa  300  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 1398 aa  299  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.28 
 
 		 1226 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.29 
 
 		 780 aa  299  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 		 881 aa  298  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  43.47 
 
 		 655 aa  298  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.65 
 
 		 1078 aa  298  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.07 
 
 		 717 aa  297  5e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.45 
 
 		 822 aa  298  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 		 911 aa  298  5e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1644  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.21 
 
 		 789 aa  297  6e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841521  normal  0.594738 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.03 
 
 		 827 aa  297  6e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 969 aa  297  6e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.55 
 
 		 1499 aa  297  8e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 		 1069 aa  296  8e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  45.2 
 
 		 571 aa  296  9e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 		 1120 aa  296  9e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 743 aa  296  9e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2934  PAS  33.01 
 
 		 955 aa  296  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000914767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.91 
 
 		 837 aa  296  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.79 
 
 		 718 aa  296  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 		 873 aa  296  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 		 982 aa  295  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.25 
 
 		 1204 aa  296  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  39.91 
 
 		 742 aa  295  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 		 1177 aa  296  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  43.54 
 
 		 794 aa  295  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.75 
 
 		 1070 aa  295  3e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>