62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3018 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 		 183 aa  370  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  94.51 
 
 		 187 aa  349  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  69.78 
 
 		 188 aa  254  7e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  67.76 
 
 		 185 aa  246  9e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  65.56 
 
 		 182 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  67.21 
 
 		 188 aa  239  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  62.64 
 
 		 182 aa  236  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.99 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  42.96 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  42.96 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  41.48 
 
 		 201 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.58 
 
 		 187 aa  97.8  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.08 
 
 		 184 aa  97.8  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  34.51 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  36.69 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  31.41 
 
 		 183 aa  87.8  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1012  hemerythrin HHE cation binding region  28.32 
 
 		 180 aa  86.7  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0505  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.09 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.581987  normal  0.213341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.77 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1509  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.77 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0220946  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.32 
 
 		 316 aa  77.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.1 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000791976  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0065  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.94 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.73098  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1917  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.88 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.71 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.09 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0395  hypothetical protein  32.93 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0288  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.65 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00932018 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.37 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  28.21 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0292536 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.99 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  27.01 
 
 		 437 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  26.32 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.71 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  27.45 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1353  hypothetical protein  26.79 
 
 		 180 aa  47.8  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.086878 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  27.07 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2519  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  21.14 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0120  hypothetical protein  29.17 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  21.34 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  21.34 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1277  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.97 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000400802  normal  0.0499569 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.79 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.66 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  20.86 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.22 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  22.22 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  23.61 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  22.22 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  22.22 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  25.79 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  22.22 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  31.82 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  26.9 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  28.68 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  26.81 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  22.58 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2304  putative regulator of cell morphogenesis and NO signaling  34.74 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.904148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1182  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  20.73 
 
 		 178 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  20.73 
 
 		 178 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0022  hypothetical protein  24.2 
 
 		 180 aa  40.8  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>