More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3014 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  100 
 
 		 359 aa  707    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  97.77 
 
 		 361 aa  689    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  73.54 
 
 		 362 aa  534  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  72.7 
 
 		 363 aa  521  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  71.03 
 
 		 363 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  61.84 
 
 		 363 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  57.26 
 
 		 364 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  56.58 
 
 		 365 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  55.18 
 
 		 373 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  56.94 
 
 		 370 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  55.43 
 
 		 368 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  52.94 
 
 		 366 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  52.94 
 
 		 365 aa  363  2e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  53.89 
 
 		 364 aa  361  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  51.82 
 
 		 360 aa  350  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  52.05 
 
 		 372 aa  349  5e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  49.72 
 
 		 368 aa  348  7e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  51.12 
 
 		 356 aa  346  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  51.39 
 
 		 365 aa  346  4e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  51.51 
 
 		 372 aa  345  5e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  49.44 
 
 		 370 aa  339  4e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  52.06 
 
 		 344 aa  334  1e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  50.41 
 
 		 368 aa  333  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  49.17 
 
 		 363 aa  329  4e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  50.7 
 
 		 358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  49.72 
 
 		 359 aa  323  2e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  48.48 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  49.45 
 
 		 369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  49.28 
 
 		 348 aa  315  6e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  47.91 
 
 		 375 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  49.56 
 
 		 341 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  46.24 
 
 		 372 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  47.78 
 
 		 360 aa  308  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  49.3 
 
 		 341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  46.39 
 
 		 350 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  46.39 
 
 		 350 aa  300  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  48.39 
 
 		 341 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  49.44 
 
 		 360 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  49.85 
 
 		 341 aa  297  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  49.44 
 
 		 360 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  47.21 
 
 		 343 aa  295  9e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  47.21 
 
 		 343 aa  294  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  45.92 
 
 		 343 aa  293  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  45.86 
 
 		 362 aa  291  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  46.74 
 
 		 341 aa  291  9e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  48.82 
 
 		 340 aa  291  9e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  47.24 
 
 		 366 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  48.39 
 
 		 341 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  46.74 
 
 		 342 aa  290  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  47.03 
 
 		 342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  50 
 
 		 342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  45.15 
 
 		 365 aa  289  7e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  48.09 
 
 		 341 aa  288  8e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  48.09 
 
 		 342 aa  287  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  47.8 
 
 		 341 aa  285  7e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  46.25 
 
 		 341 aa  285  8e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  46.92 
 
 		 346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  46.89 
 
 		 341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  44.79 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  44.79 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  44.79 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  45.95 
 
 		 340 aa  280  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  45.16 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  46.87 
 
 		 345 aa  278  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  44.81 
 
 		 349 aa  272  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  46.67 
 
 		 340 aa  271  9e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  45.95 
 
 		 343 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  46.49 
 
 		 351 aa  266  4e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  44.44 
 
 		 341 aa  266  5e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  44.41 
 
 		 344 aa  259  4e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  47.35 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  44.38 
 
 		 342 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  43.82 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  41.07 
 
 		 378 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  46.99 
 
 		 342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3044  6-phosphofructokinase  45.11 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0957436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  45.45 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1263  6-phosphofructokinase  40.66 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4626  6-phosphofructokinase  42.52 
 
 		 390 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  44.35 
 
 		 342 aa  249  4e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  44.64 
 
 		 344 aa  248  8e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  42.65 
 
 		 346 aa  248  9e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2651  6-phosphofructokinase  42.93 
 
 		 355 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  45.45 
 
 		 341 aa  245  9.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  39.83 
 
 		 319 aa  239  5.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0592  6-phosphofructokinase  40.65 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00575817  normal  0.643142 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0191  6-phosphofructokinase  39.75 
 
 		 390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0186  6-phosphofructokinase  39.49 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.404214 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  40.23 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1916  6-phosphofructokinase  39.83 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  39.55 
 
 		 319 aa  227  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  40.59 
 
 		 319 aa  226  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1624  6-phosphofructokinase  40.23 
 
 		 326 aa  225  9e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.664156  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  41.57 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  38.7 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  40.29 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1703  6-phosphofructokinase  38.7 
 
 		 319 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  39.59 
 
 		 322 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0397  6-phosphofructokinase  39.65 
 
 		 324 aa  222  7e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1343  6-phosphofructokinase  39.71 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>