165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2926 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_0984  hypothetical protein  48.25 
 
 		 725 aa  650    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.29848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1299  protein of unknown function DUF255  93.57 
 
 		 750 aa  1394    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000120536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2926  protein of unknown function DUF255  100 
 
 		 746 aa  1531    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0943  hypothetical protein  50.36 
 
 		 718 aa  618  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1001  protein of unknown function DUF255  51.22 
 
 		 718 aa  605  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.657059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1004  protein of unknown function DUF255  51.15 
 
 		 718 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2540  hypothetical protein  46.46 
 
 		 685 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.352542  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  42.59 
 
 		 686 aa  575  1.0000000000000001e-162  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2853  hypothetical protein  42.4 
 
 		 690 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.329251  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  41.84 
 
 		 711 aa  555  1e-157  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3335  protein of unknown function DUF255  43.51 
 
 		 699 aa  555  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000801567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  42.92 
 
 		 680 aa  557  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1111  protein of unknown function DUF255  44.02 
 
 		 699 aa  558  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.992934  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1680  protein of unknown function DUF255  41.51 
 
 		 686 aa  554  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2547  hypothetical protein  44.01 
 
 		 684 aa  549  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  39.16 
 
 		 703 aa  547  1e-154  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0215  protein of unknown function DUF255  42.25 
 
 		 673 aa  546  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0959  protein of unknown function DUF255  42.05 
 
 		 686 aa  546  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2330  protein of unknown function DUF255  43.97 
 
 		 693 aa  537  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00802642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2279  hypothetical protein  42.92 
 
 		 700 aa  536  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1041  hypothetical protein  41.98 
 
 		 681 aa  536  1e-151  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11330  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  39.77 
 
 		 691 aa  536  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.234255  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  43.31 
 
 		 696 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1765  hypothetical protein  41.24 
 
 		 711 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17317  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  42.92 
 
 		 678 aa  518  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  41.13 
 
 		 705 aa  515  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2759  protein of unknown function DUF255  40.74 
 
 		 756 aa  511  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  40.06 
 
 		 720 aa  511  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1723  protein of unknown function DUF255  42.67 
 
 		 665 aa  511  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1191  hypothetical protein  39.51 
 
 		 675 aa  510  1e-143  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2324  hypothetical protein  40.32 
 
 		 721 aa  503  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  39.23 
 
 		 737 aa  503  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2595  hypothetical protein  40.17 
 
 		 681 aa  497  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1677  protein of unknown function DUF255  40.14 
 
 		 733 aa  496  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1072  protein of unknown function DUF255  38.73 
 
 		 712 aa  498  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4232  protein of unknown function DUF255  42.94 
 
 		 666 aa  494  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0871403  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1665  hypothetical protein  41.99 
 
 		 752 aa  492  1e-137  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.590351  hitchhiker  0.000463934 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  36.78 
 
 		 687 aa  489  1e-137  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1372  protein of unknown function DUF255  40.45 
 
 		 706 aa  490  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1630  hypothetical protein  40.03 
 
 		 751 aa  488  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0345  hypothetical protein  40.11 
 
 		 700 aa  483  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.308049  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1448  hypothetical protein  40.86 
 
 		 672 aa  482  1e-135  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.411428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2283  hypothetical protein  42.07 
 
 		 700 aa  482  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1395  protein of unknown function DUF255  40.45 
 
 		 720 aa  480  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0132403  normal  0.87283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1180  protein of unknown function DUF255  41.27 
 
 		 707 aa  480  1e-134  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0225  hypothetical protein  40.74 
 
 		 697 aa  479  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2314  protein of unknown function DUF255  39.11 
 
 		 715 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2477  hypothetical protein  41.29 
 
 		 679 aa  462  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2991  protein of unknown function DUF255  38.81 
 
 		 722 aa  464  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.784863  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0485  protein of unknown function DUF255  39.17 
 
 		 680 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0471944  normal  0.48167 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2549  hypothetical protein  39.86 
 
 		 694 aa  462  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282595  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2172  protein of unknown function DUF255  39.59 
 
 		 714 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0500393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1171  hypothetical protein  40.51 
 
 		 660 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0507  protein of unknown function DUF255  39.33 
 
 		 717 aa  458  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.056256  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1697  hypothetical protein  40.65 
 
 		 669 aa  456  1e-127  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1214  hypothetical protein  38.57 
 
 		 723 aa  457  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.372382  normal  0.0723033 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0451  hypothetical protein  39.6 
 
 		 665 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2247  protein of unknown function DUF255  38.89 
 
 		 700 aa  453  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2744  hypothetical protein  41.18 
 
 		 676 aa  452  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.426615  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2244  hypothetical protein  39.23 
 
 		 715 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0027  protein of unknown function DUF255  37.07 
 
 		 671 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000809407  normal  0.496902 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01090  hypothetical protein  36.53 
 
 		 681 aa  449  1e-125  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.796364  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  39.47 
 
 		 677 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1443  protein of unknown function DUF255  37.55 
 
 		 670 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4477  protein of unknown function DUF255  40.28 
 
 		 681 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2727  hypothetical protein  39.34 
 
 		 673 aa  444  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.461963 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0099  hypothetical protein  38.51 
 
 		 676 aa  444  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0429958 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0107  hypothetical protein  38.93 
 
 		 682 aa  445  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.926575  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1532  hypothetical protein  40 
 
 		 641 aa  442  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1071  protein of unknown function DUF255  40.17 
 
 		 662 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0945  protein of unknown function DUF255  39.86 
 
 		 665 aa  439  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1067  hypothetical protein  40.12 
 
 		 687 aa  438  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1832  hypothetical protein  39.51 
 
 		 669 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.569096  normal  0.0946187 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1296  protein of unknown function DUF255  37.77 
 
 		 744 aa  436  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.212217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0830  hypothetical protein  39.4 
 
 		 669 aa  435  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2401  hypothetical protein  38.18 
 
 		 706 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000573334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  37.86 
 
 		 676 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0098  protein of unknown function DUF255  39.43 
 
 		 677 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31750  highly conserved protein containing a thioredoxin domain protein  36.05 
 
 		 667 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1310  protein of unknown function DUF255  40.16 
 
 		 615 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.92977  normal  0.0463256 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3622  hypothetical protein  38.87 
 
 		 680 aa  421  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.250871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3473  hypothetical protein  37.63 
 
 		 676 aa  422  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1883  hypothetical protein  37.29 
 
 		 658 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.788472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8541  hypothetical protein  38.97 
 
 		 682 aa  419  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1422  protein of unknown function DUF255  35.64 
 
 		 688 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3900  hypothetical protein  38.03 
 
 		 673 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2384  hypothetical protein  34.94 
 
 		 705 aa  410  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249366  normal  0.331232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1052  hypothetical protein  38.03 
 
 		 652 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1388  protein of unknown function DUF255  35.22 
 
 		 688 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2996  hypothetical protein  35.58 
 
 		 700 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0929  hypothetical protein  37.03 
 
 		 699 aa  404  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991859  normal  0.115087 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1983  hypothetical protein  38.43 
 
 		 666 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0871  hypothetical protein  37.62 
 
 		 699 aa  405  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_004310  BR2063  hypothetical protein  40.52 
 
 		 666 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.130883  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3705  protein of unknown function DUF255  40.14 
 
 		 703 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164339  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0938  protein of unknown function DUF255  34.21 
 
 		 687 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0704  protein of unknown function DUF255  37.67 
 
 		 710 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108569 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01057  DUF255 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G12370)  35.95 
 
 		 774 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0181431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4140  hypothetical protein  38.04 
 
 		 664 aa  395  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4215  hypothetical protein  38.04 
 
 		 664 aa  395  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>