128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2864 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  95.96 
 
 		 396 aa  788    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  100 
 
 		 396 aa  818    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  64.81 
 
 		 402 aa  551  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4040  domain of unknown function DUF1745  61.87 
 
 		 396 aa  527  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  61.11 
 
 		 396 aa  522  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  27.86 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  26.85 
 
 		 408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  27.3 
 
 		 401 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  27.3 
 
 		 387 aa  135  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  26.41 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  25.68 
 
 		 417 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2659  hypothetical protein  27.74 
 
 		 406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  29.23 
 
 		 381 aa  126  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1055  domain of unknown function DUF1745  31.41 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  26.98 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0012  hypothetical protein  27.95 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0572769  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  27.96 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3246  domain of unknown function DUF1745  25.39 
 
 		 396 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116005  normal  0.61148 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  27.65 
 
 		 395 aa  111  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  24.16 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  28.4 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3113  hypothetical protein  27.27 
 
 		 397 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  hitchhiker  0.0000208643 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3254  domain of unknown function DUF1745  27.97 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8558  hypothetical protein  27.11 
 
 		 398 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  23.29 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3184  hypothetical protein  25.07 
 
 		 377 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1520  domain of unknown function DUF1745  25.54 
 
 		 1101 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.593307 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  25.68 
 
 		 365 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0444  hypothetical protein  28.08 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1561  hypothetical protein  23.72 
 
 		 404 aa  100  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0331  hypothetical protein  26.43 
 
 		 387 aa  99.8  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0354  hypothetical protein  25.89 
 
 		 387 aa  99.8  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  24.48 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4044  hypothetical protein  25.27 
 
 		 401 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0091  domain of unknown function DUF1745  25.71 
 
 		 383 aa  93.6  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  23.58 
 
 		 389 aa  92.8  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1400  domain of unknown function DUF1745  24.46 
 
 		 398 aa  90.1  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.653815  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1891  hypothetical protein  25.86 
 
 		 391 aa  89.7  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.473859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3657  domain of unknown function DUF1745  25 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3884  domain of unknown function DUF1745  28.57 
 
 		 1852 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0889  hypothetical protein  28.21 
 
 		 374 aa  87.4  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0360  hypothetical protein  25.3 
 
 		 398 aa  87.4  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.435591  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2191  diguanylate cyclase  26.6 
 
 		 806 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00068502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10639  hypothetical protein  23.42 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000135133  normal  0.805152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1049  hypothetical protein  23.27 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198533 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0940  domain of unknown function DUF1745  23.15 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0913  domain of unknown function DUF1745  23.15 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10891  hypothetical protein  22.9 
 
 		 386 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.824347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4241  domain of unknown function DUF1745  23.17 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000432273  hitchhiker  0.00000452646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3242  domain of unknown function DUF1745  26.76 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0186777  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3390  hypothetical protein  23.88 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.0973611 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0438  domain of unknown function DUF1745  27.04 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  26.54 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4078  domain of unknown function DUF1745  22.3 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1561  hypothetical protein  22.79 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0408772  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3953  hypothetical protein  27.54 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2247  hypothetical protein  25.33 
 
 		 382 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.316904 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3636  hypothetical protein  26.86 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0371475  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2568  FIST C domain protein  24.62 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0105627  normal  0.0110126 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1108  domain of unknown function DUF1745  23.28 
 
 		 378 aa  67  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1387  hypothetical protein  23.28 
 
 		 378 aa  67  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3887  hypothetical protein  25.56 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.894307 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1476  domain of unknown function DUF1745  26.07 
 
 		 629 aa  65.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.153758  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  21.97 
 
 		 512 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0294  hypothetical protein  25.09 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3160  domain of unknown function DUF1745  25.56 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0140  FIST C domain protein  25.33 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1203  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  24.12 
 
 		 932 aa  65.1  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00343755  normal  0.259486 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1204  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  24.75 
 
 		 931 aa  65.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271509 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2063  hypothetical protein  22.73 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.748308  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  25.27 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5581  hypothetical protein  27.35 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19369  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4508  hypothetical protein  25.2 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260066 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0895  FIST C domain protein  21.58 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000443325  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1369  hypothetical protein  23.9 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0268  diguanylate cyclase  24.58 
 
 		 933 aa  59.7  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0380534  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2538  hypothetical protein  27.06 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0281  hypothetical protein  23.38 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.812324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0288  hypothetical protein  21.28 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6102  domain of unknown function DUF1745  23.53 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1202  fused sensor protein/response regulator  23 
 
 		 934 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127641  normal  0.087847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4934  hypothetical protein  24.91 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0615  hypothetical protein  21.41 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.948448  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2912  hypothetical protein  23.87 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2592  hypothetical protein  26.19 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.71341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0306  hypothetical protein  24.11 
 
 		 447 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1250  hypothetical protein  26.19 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.7579 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0550  hypothetical protein  22.71 
 
 		 467 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0622  hypothetical protein  25.26 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1435  hypothetical protein  25 
 
 		 501 aa  53.9  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1892  hypothetical protein  23.94 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.056146  normal  0.181862 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2339  domain of unknown function DUF1745  24.08 
 
 		 383 aa  53.5  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  25.58 
 
 		 402 aa  53.1  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0852  hypothetical protein  20.98 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.214609  normal  0.0568349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0996  hypothetical protein  20.98 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0343118  normal  0.112953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1939  hypothetical protein  24.34 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  24.45 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02305  hypothetical protein  24.27 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0750  domain of unknown function DUF1745  24.46 
 
 		 426 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0732  hypothetical protein  22.82 
 
 		 386 aa  50.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>