More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2840 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1068  sodium/solute symporter family protein  68.95 
 
 		 584 aa  810    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272224  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  69.98 
 
 		 584 aa  850    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  70.33 
 
 		 584 aa  855    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1373  SSS sodium solute transporter superfamily  93.5 
 
 		 662 aa  1138    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174329 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2856  SSS sodium solute transporter superfamily  62.58 
 
 		 657 aa  793    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2840  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 661 aa  1311    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1424  SSS sodium solute transporter superfamily  65.25 
 
 		 659 aa  786    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  70.33 
 
 		 584 aa  853    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3288  Na+/solute symporter  74.07 
 
 		 655 aa  859    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  64.7 
 
 		 661 aa  768    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  69.15 
 
 		 659 aa  856    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1340  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  79.31 
 
 		 655 aa  953    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  65.2 
 
 		 665 aa  779    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  68.47 
 
 		 665 aa  798    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  69.14 
 
 		 664 aa  807    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1480  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  45.27 
 
 		 516 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1672  sodium/solute symporter family protein  45.27 
 
 		 516 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.206426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1726  sodium/solute symporter family protein  45.09 
 
 		 516 aa  464  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1518  sodium/solute symporter family protein  44.92 
 
 		 516 aa  465  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.782594  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1490  sodium/solute symporter family protein; sodium/proline symporter  44.92 
 
 		 516 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0960795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3672  sodium/solute symporter family protein  44.92 
 
 		 516 aa  465  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0653794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1703  sodium/solute symporter family protein  44.92 
 
 		 516 aa  465  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1635  sodium/solute symporter family protein  44.92 
 
 		 516 aa  465  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1777  sodium/solute symporter family protein  44.75 
 
 		 516 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.165855  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  45.06 
 
 		 513 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1523  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.23 
 
 		 516 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.292925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1330  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.7 
 
 		 516 aa  457  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.892115  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.14 
 
 		 530 aa  450  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1718  SSS sodium solute transporter superfamily  44.12 
 
 		 511 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0958  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.81 
 
 		 570 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.483778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3167  SSS sodium solute transporter superfamily  44.82 
 
 		 536 aa  428  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  42.56 
 
 		 576 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3760  SSS sodium solute transporter superfamily  42.59 
 
 		 541 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1161  SSS sodium solute transporter superfamily  45.58 
 
 		 568 aa  428  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.710493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3836  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.14 
 
 		 539 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.808948 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.57 
 
 		 575 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  42.81 
 
 		 576 aa  425  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3703  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.41 
 
 		 541 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0531  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.81 
 
 		 508 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5185  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.98 
 
 		 508 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.204616 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2431  acetate permease  43.39 
 
 		 577 aa  423  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.157146  normal  0.21776 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1021  SSS sodium solute transporter superfamily  42.07 
 
 		 515 aa  425  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.359049  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  42.76 
 
 		 541 aa  425  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  42.81 
 
 		 576 aa  425  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  42.36 
 
 		 572 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0315  SSS sodium solute transporter superfamily  40.69 
 
 		 519 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.721086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2129  SSS sodium solute transporter superfamily protein  44.35 
 
 		 537 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5018  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.89 
 
 		 557 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000399279 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1454  acetate permease  40.91 
 
 		 554 aa  413  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.253764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6314  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.35 
 
 		 536 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267295  normal  0.199401 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1542  SSS sodium solute transporter superfamily  40.58 
 
 		 577 aa  415  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000862893  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1743  acetate permease  39.71 
 
 		 554 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1335  acetate permease  39.74 
 
 		 554 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5957  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.95 
 
 		 577 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0970  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.11 
 
 		 516 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4508  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  43.07 
 
 		 557 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3976  acetate permease  39.25 
 
 		 554 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.900001  normal  0.864966 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1850  SSS sodium solute transporter superfamily  40.42 
 
 		 513 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3142  acetate permease  41.52 
 
 		 576 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0635  acetate permease  40.53 
 
 		 559 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.953483  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3782  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40.71 
 
 		 563 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.804193  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0004  acetate permease  41.16 
 
 		 548 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.415194  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1293  acetate permease  39.55 
 
 		 554 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3879  acetate permease  41.52 
 
 		 576 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262245  normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1624  sodium:solute symporter family protein  39.74 
 
 		 552 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.484288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3756  acetate permease  39.74 
 
 		 552 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.574544  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  41.54 
 
 		 551 aa  405  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0071  SSS sodium solute transporter superfamily  43.87 
 
 		 528 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2490  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  40 
 
 		 515 aa  405  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0375  acetate permease  40 
 
 		 553 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1608  acetate permease  39.93 
 
 		 552 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4211  acetate permease  46.44 
 
 		 571 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.31095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2501  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.05 
 
 		 607 aa  398  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000632414 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5783  acetate permease  40.43 
 
 		 553 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3377  acetate permease  39.35 
 
 		 552 aa  399  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0784287  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4127  SSS sodium solute transporter superfamily  41.93 
 
 		 561 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2623  acetate permease  41.88 
 
 		 563 aa  399  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  40.1 
 
 		 574 aa  396  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3923  acetate permease  38.79 
 
 		 551 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281224  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3949  acetate permease  38.63 
 
 		 551 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.739246 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0683  acetate permease  40 
 
 		 552 aa  394  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5152  SSS sodium solute transporter superfamily  47.66 
 
 		 516 aa  395  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3837  acetate permease  38.79 
 
 		 551 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0353587  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5596  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.21 
 
 		 560 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  39.6 
 
 		 551 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  40.07 
 
 		 553 aa  395  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3675  hypothetical protein  47.65 
 
 		 554 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.834284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  39.43 
 
 		 551 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03252  acetate permease  40.75 
 
 		 562 aa  395  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0912  acetate permease  39.67 
 
 		 552 aa  392  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3272  acetate permease  40.61 
 
 		 520 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4311  acetate permease  38.36 
 
 		 549 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1577  SSS sodium solute transporter superfamily  47.35 
 
 		 546 aa  391  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0392611  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4960  Na+/solute symporter  45.63 
 
 		 544 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.319543  normal  0.144233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2624  acetate permease  40.78 
 
 		 520 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.332014  normal  0.410104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2637  acetate permease  40.95 
 
 		 520 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0134816  normal  0.110643 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1449  acetate permease  39.7 
 
 		 574 aa  392  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.463386  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2487  acetate permease  40.78 
 
 		 520 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.869989  normal  0.753083 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  39.97 
 
 		 666 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0295  acetate permease  42.4 
 
 		 550 aa  389  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.510607  hitchhiker  0.000229004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>