More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2753 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  95.14 
 
 		 185 aa  352  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  79.46 
 
 		 185 aa  302  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  76.22 
 
 		 185 aa  290  7e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  72.97 
 
 		 185 aa  279  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  72.43 
 
 		 185 aa  276  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2047  ribosome recycling factor  65.95 
 
 		 185 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.082584  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  60 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  60.34 
 
 		 184 aa  224  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  56.9 
 
 		 186 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  57.47 
 
 		 186 aa  211  7e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  55.75 
 
 		 186 aa  210  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  58.38 
 
 		 184 aa  206  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 186 aa  204  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  56.07 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 186 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  51.69 
 
 		 186 aa  201  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  53.26 
 
 		 192 aa  201  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  55.49 
 
 		 184 aa  201  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  201  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  201  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 186 aa  201  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1441  ribosome recycling factor  54.39 
 
 		 186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.378711 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1552  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  197  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2580  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  197  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2434  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  197  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1325  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  197  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0289556  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2490  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  197  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3258  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  197  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.797404  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2053  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  197  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 184 aa  197  7.999999999999999e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1589  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 191 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.609942  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1383  ribosome recycling factor  51.72 
 
 		 186 aa  195  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  normal  0.0434538 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  51.63 
 
 		 186 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1260  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2030  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  194  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1557  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135969  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1918  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2049  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 186 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360804  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  53.76 
 
 		 185 aa  193  9e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6061  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.791603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2016  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2973  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2036  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.605835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0660  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3278  ribosome recycling factor  53.18 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000213543  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  50 
 
 		 186 aa  191  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 184 aa  191  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1282  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000366075  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1862  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 186 aa  190  8e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.964954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  190  8e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  190  9e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1542  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0811  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 187 aa  190  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3158  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000691666  normal  0.144971 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1273  ribosome recycling factor  49.71 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235676  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1826  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2594  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 187 aa  188  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00709219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>