More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2748 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2748  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 		 237 aa  474  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1493  peptidase M22 glycoprotease  96.09 
 
 		 230 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0479198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1258  peptidase M22, glycoprotease  57.83 
 
 		 230 aa  261  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000258802  hitchhiker  0.00045804 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3725  peptidase M22, glycoprotease  61.16 
 
 		 228 aa  248  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1913  glycoprotease family protein  57.14 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1717  peptidase M22, glycoprotease  48.73 
 
 		 240 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2716  peptidase M22 glycoprotease  46.02 
 
 		 229 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1913  metal-dependent protease  45.74 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0333052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1786  peptidase M22, glycoprotease  40.44 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0677325  normal  0.407437 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1775  peptidase M22, glycoprotease  35.56 
 
 		 236 aa  142  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0438332  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0800  peptidase M22 glycoprotease  34.63 
 
 		 236 aa  138  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.188587  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0244  peptidase M22 glycoprotease  34.22 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1857  peptidase M22 glycoprotease  36.12 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00567012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  36.44 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1391  peptidase M22 glycoprotease  35.24 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000832703  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  36.52 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0237  peptidase M22 glycoprotease  34.35 
 
 		 230 aa  129  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000016093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3738  peptidase M22 glycoprotease  36.13 
 
 		 241 aa  128  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0217  peptidase M22 glycoprotease  33.91 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0290  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0307727  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  35.96 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.674425  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0233  O-sialoglycoprotein endopeptidase (glycoprotease)  33.78 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0245  hypothetical protein  33.78 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0259  hypothetical protein  33.78 
 
 		 230 aa  126  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0280  hypothetical protein  33.78 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0231  O-sialoglycoprotein endopeptidase (glycoprotease)  33.78 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0285  hypothetical protein  33.78 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0309  hypothetical protein  33.78 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1098  peptidase M22 glycoprotease  34.22 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0347  peptidase M22 glycoprotease  32.91 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2133  glycoprotease family protein  36.24 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  38.46 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2423  glycoprotease family protein  36.24 
 
 		 234 aa  118  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  31.91 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0489  peptidase M22, glycoprotease  35.11 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.650313  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0944  peptidase M22 glycoprotease  34.5 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01960  O-sialoglycoprotein endopeptidase  31.33 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.717624  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0099  M22 family peptidase  32.58 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192145 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0148  peptidase M22 glycoprotease  34.55 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0183  peptidase M22 glycoprotease  32.65 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.128229  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2088  hypothetical protein  29.28 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.5343  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2125  hypothetical protein  29.28 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0445  peptidase M22 glycoprotease  30.67 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0618  peptidase M22 glycoprotease  32.59 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.106712  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0341  peptidase M22, glycoprotease  32.46 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0714  peptidase M22 glycoprotease  30.84 
 
 		 216 aa  95.5  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.879586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4358  peptidase M22, glycoprotease  31.65 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294544 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0964  peptidase M22 glycoprotease  32.47 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6394  peptidase M22 glycoprotease  31.86 
 
 		 235 aa  92.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0429104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3849  peptidase M22 glycoprotease  32.11 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434015  normal  0.803149 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1778  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  28.83 
 
 		 236 aa  91.3  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0379  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  31.84 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.457617  hitchhiker  0.000000359774 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2256  peptidase M22 glycoprotease  30 
 
 		 244 aa  89  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0343569  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5298  peptidase M22 glycoprotease  32.31 
 
 		 276 aa  89  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.355129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01100  putative glycoprotease family exported protein  30.56 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0356  hypothetical protein  31.51 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0444593 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0327  metal-dependent protease related protein, putative molecular chaperone  30.4 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  32.89 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1294  peptidase M22 glycoprotease  33.47 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.450316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1546  peptidase M22 glycoprotease  31.11 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.311826 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1663  hypothetical protein  28.38 
 
 		 220 aa  85.1  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1759  hypothetical protein  30.7 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.607918  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  32.31 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1084  peptidase M22 glycoprotease  32.14 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00473352  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1673  peptidase M22, glycoprotease  28.7 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0161  peptidase M22 glycoprotease  29 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235469  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  32.31 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0074  peptidase M22 glycoprotease  28.76 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4976  peptidase M22 glycoprotease  31.53 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.71836  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1747  glycoprotein endopeptidase  33.03 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.3762  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0181  metalloendopeptidase, glycoprotease family  34.74 
 
 		 832 aa  83.2  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  32.75 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1634  peptidase M22 glycoprotease  30.99 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  32.76 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  33.19 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2808  peptidase M22, glycoprotease  35.57 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  32.47 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  31.42 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0761  peptidase M22 glycoprotease  33.09 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.731351  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  31.42 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  41.09 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  32.03 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  31.42 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  33.48 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2301  peptidase M22, glycoprotease  31.07 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  31.42 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  31.42 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  38.93 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1236  peptidase M22 glycoprotease  30.95 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  31.56 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1510  hypothetical protein  39.19 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0629  peptidase M22 glycoprotease  30.25 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  30.97 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  30.53 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  37.91 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0784  peptidase M22 glycoprotease  39.1 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318216  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  32.27 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  30.97 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1193  peptidase M22, glycoprotease  38.46 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>